RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W DNA2P38859 1522 aa5.05□□□□□ -1.6
SSQ1YLR369W RTG3P38165 486 aa5.02□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W GYP5Q12344 894 aa5.02□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W HTA1P04911 132 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W HTA2P04912 132 aa5.01□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W ABP1P15891 592 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W PTC4P38089 393 aa5.01□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W DCW1P36091 449 aa5□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W YDR344CQ05510 147 aa5□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W YEL023CP39992 682 aa4.99□□□□□ -1.61
SSQ1YLR369W SWR1Q05471 1514 aa4.96□□□□□ -1.62
SSQ1YLR369W CST9Q06032 482 aa4.96□□□□□ -1.62
SSQ1YLR369W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SSQ1YLR369W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data4.94□□□□□ -1.62not detected
SSQ1YLR369W PML39Q03760 334 aa4.93□□□□□ -1.62
SSQ1YLR369W RCR1P38212 213 aa4.92□□□□□ -1.62
SSQ1YLR369W KOG1P38873 1557 aa4.92□□□□□ -1.62
SSQ1YLR369W SSP1P38871 571 aa4.89□□□□□ -1.63
SSQ1YLR369W MGA2P40578 1113 aa4.86□□□□□ -1.63
SSQ1YLR369W ARH1P48360 493 aa4.86□□□□□ -1.63
SSQ1YLR369W YPL062WQ02781 134 aa4.86□□□□□ -1.63
SSQ1YLR369W MID1P41821 548 aa4.82□□□□□ -1.64
SSQ1YLR369W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SSQ1YLR369W TY1B-DR4Q07793 1604 aa4.82□□□□□ -1.64
SSQ1YLR369W SPT23P35210 1082 aa4.82□□□□□ -1.64
SSQ1YLR369W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W PEX29Q03370 554 aa4.76□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W ATH1P48016 1211 aa4.75□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W NST1P53935 1240 aa4.75□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W HAP5Q02516 242 aa4.74□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W RAS1P01119 309 aa4.74□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W GUT1P32190 709 aa4.74□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W PTC2P39966 464 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W BNI4P53858 892 aa4.72□□□□□ -1.65
SSQ1YLR369W MIF2P35201 549 aa4.71□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W TRK1P12685 1235 aa4.71□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W PTC3P34221 468 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W SOL3P38858 249 aa4.7□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W MPH3P0CE00 602 aa4.69□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W EDS1P38073 919 aa4.69□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W AI4P03878 556 aa4.67□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W ILV3P39522 585 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SSQ1YLR369W MPC54Q08550 464 aa4.65□□□□□ -1.67
SSQ1YLR369W MAK11P20484 414 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SSQ1YLR369W NMA111P53920 997 aa4.63□□□□□ -1.67
SSQ1YLR369W YPR015CQ12531 247 aa4.6□□□□□ -1.67
SSQ1YLR369W HSL1P34244 1518 aa4.59□□□□□ -1.67
SSQ1YLR369W AMS1P22855 1083 aa4.59□□□□□ -1.67
SSQ1YLR369W ECM5Q03214 1411 aa4.58□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W COQ8P27697 501 aa4.58□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W RAM2P29703 316 aa4.57□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W DPL1Q05567 589 aa4.56□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W RAM1P22007 431 aa4.55□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W YGR273CP53329 174 aa4.55□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W GYP1Q08484 637 aa4.55□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W SLI15P38283 698 aa4.54□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W SGS1P35187 1447 aa4.54□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data4.53□□□□□ -1.68not detected
SSQ1YLR369W GAR1P28007 205 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SSQ1YLR369W SDH2P21801 266 aa4.51□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W THO2P53552 1597 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W BUD4P47136 1447 aa4.5□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W ISU2Q12056 156 aa4.5□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W MDS3P53094 1487 aa4.49□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W HIR3P47171 1648 aa4.47□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W REV3P14284 1504 aa4.47□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W SAS4Q04003 481 aa4.47□□□□□ -1.69
SSQ1YLR369W PDR1P12383 1068 aa4.46□□□□□ -1.7
SSQ1YLR369W YEL077CQ3E7X8 1277 aa4.46□□□□□ -1.7
SSQ1YLR369W PEP1P32319 1579 aa4.45□□□□□ -1.7
SSQ1YLR369W CDC73Q06697 393 aa4.44□□□□□ -1.7
SSQ1YLR369W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
SSQ1YLR369W BRE2P43132 505 aa4.42□□□□□ -1.7
SSQ1YLR369W KEX1P09620 729 aa4.41□□□□□ -1.7
SSQ1YLR369W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W BPT1P14772 1559 aa4.38□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W AIR1P40507 360 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W GCR2Q01722 534 aa4.38□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W ATG2P53855 1592 aa4.36□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W CLA4P48562 842 aa4.34□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SSQ1YLR369W PRT1P06103 763 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W ERG12P07277 443 aa4.33□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W CST6P40535 587 aa4.32□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W MTC5Q03897 1148 aa4.31□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W MET22P32179 357 aa4.3□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data4.29□□□□□ -1.72 RIP-Chip
SSQ1YLR369W IFH1P39520 1085 aa4.29□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W UBP14P38237 781 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W VHR2P40041 505 aa4.28□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W STR2P47164 639 aa4.28□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W YPR148CQ06523 435 aa4.28□□□□□ -1.72
SSQ1YLR369W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
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