RNA–Protein interactions for RNA: YKR021W

ALY1, Transcript of Alpha arrestin, substrate of calcineurin, yeast

Gene ALY1, Length 2,748 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALY1	YKR021W	SOL3	P38858	249 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ALY1	YKR021W	KIN1	P13185	1064 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ALY1	YKR021W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ALY1	YKR021W	GLC3	P32775	704 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ALY1	YKR021W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ALY1	YKR021W	NST1	P53935	1240 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ALY1	YKR021W	ATH1	P48016	1211 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ALY1	YKR021W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ALY1	YKR021W	YGR273C	P53329	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ALY1	YKR021W	VHR2	P40041	505 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ALY1	YKR021W	GYP5	Q12344	894 aa		5	□□□□□ -1.61
ALY1	YKR021W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
ALY1	YKR021W	KEX1	P09620	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALY1	YKR021W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ALY1	YKR021W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ALY1	YKR021W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	SET4	P42948	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	ATF2	P53296	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	AI4	P03878	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	RAD54	P32863	898 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	DCW1	P36091	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	GTT3	P39996	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	MSB4	Q12317	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	ORC6	P38826	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	HTA2	P04912	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	RLF2	Q12495	606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	KIC1	P38692	1080 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	HPC2	Q01448	625 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ALY1	YKR021W	RGR1	P19263	1082 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	YEL023C	P39992	682 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	DAN4	P47179	1161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	SLI15	P38283	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	PTC4	P38089	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	TFB3	Q03290	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	VNX1	P42839	908 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	TEA1	P47988	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	WSC3	Q12215	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	CSN12	P47130	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ALY1	YKR021W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	PKC1	P24583	1151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	JIP4	Q03361	876 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	IOC2	Q12072	812 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	NIS1	P53939	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	CSC1	Q06538	782 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	CDC73	Q06697	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	CLB5	P30283	435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	BRL1	P38770	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	ULI1	P43604	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	SIT4	P20604	311 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	HST2	P53686	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	FPK1	P53739	893 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	TFB4	Q12004	338 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALY1	YKR021W	MID1	P41821	548 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	MPC54	Q08550	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	SPP1	Q03012	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	PML39	Q03760	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	DPL1	Q05567	589 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	BIM1	P40013	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	SCJ1	P25303	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	ATG32	P40458	529 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	SEC61	P32915	480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	MMP1	Q12372	583 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	RSC30	P38781	883 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	YJL007C	P47080	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	LDB19	Q12502	818 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	ESS1	P22696	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	UBP9	P39967	754 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	YJU3	P28321	313 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	ISU2	Q12056	156 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	RAD59	Q12223	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ALY1	YKR021W	RTG1	P32607	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	BIO2	P32451	375 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	PEX21	P50091	288 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	NMA111	P53920	997 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	PEX29	Q03370	554 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	CSE4	P36012	229 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	YRR1	Q12172	810 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	RTF1	P53064	558 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ALY1	YKR021W	YBL036C	P38197	257 aa		4.68	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms