Protein–RNA interactions for Protein: P47080

YJL007C, Uncharacterized protein YJL007C, yeastyeast

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Length 104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL007CP47080 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.52■■□□□ 1.36
YJL007CP47080 NOP1YDL014W 984 nt23.01■■□□□ 1.27
YJL007CP47080 NSR1YGR159C 1245 nt22.99■■□□□ 1.27
YJL007CP47080 YKL036CYKL036C 393 nt21.67■■□□□ 1.06
YJL007CP47080 Q0297Q0297 156 nt20.32■□□□□ 0.84
YJL007CP47080 YJL027CYJL027C 417 nt20.32■□□□□ 0.84
YJL007CP47080 SRX1YKL086W 384 nt20.14■□□□□ 0.81
YJL007CP47080 MDJ1YFL016C 1536 nt20.02■□□□□ 0.79
YJL007CP47080 SCS3YGL126W 1143 nt19.96■□□□□ 0.79
YJL007CP47080 YCR051WYCR051W 669 nt19.15■□□□□ 0.66
YJL007CP47080 YOL085CYOL085C 342 nt18.79■□□□□ 0.6
YJL007CP47080 PKP1YIL042C 1185 nt18.47■□□□□ 0.55
YJL007CP47080 RPP1BYDL130W 321 nt18.24■□□□□ 0.51
YJL007CP47080 SCJ1YMR214W 1134 nt18.2■□□□□ 0.5
YJL007CP47080 ATS1YAL020C 1002 nt18■□□□□ 0.47
YJL007CP47080 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.94■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 DBP2YNL112W 1641 nt17.92■□□□□ 0.46
YJL007CP47080 CCC1YLR220W 969 nt17.81■□□□□ 0.44
YJL007CP47080 PET122YER153C 765 nt17.39■□□□□ 0.37
YJL007CP47080 SCR1SCR1 522 nt17.28■□□□□ 0.36
YJL007CP47080 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.15■□□□□ 0.34
YJL007CP47080 RRN5YLR141W 1092 nt16.96■□□□□ 0.31
YJL007CP47080 YBR190WYBR190W 312 nt16.92■□□□□ 0.3
YJL007CP47080 RVS167YDR388W 1449 nt16.86■□□□□ 0.29
YJL007CP47080 Q0182Q0182 405 nt16.77■□□□□ 0.28
YJL007CP47080 RSB1YOR049C 1065 nt16.7■□□□□ 0.26
YJL007CP47080 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.62■□□□□ 0.25
YJL007CP47080 PST2YDR032C 597 nt16.61■□□□□ 0.25
YJL007CP47080 RTC3YHR087W 336 nt16.6■□□□□ 0.25
YJL007CP47080 YDJ1YNL064C 1230 nt16.55■□□□□ 0.24
YJL007CP47080 MOT3YMR070W 1473 nt16.5■□□□□ 0.23
YJL007CP47080 SHR5YOL110W 714 nt16.41■□□□□ 0.22
YJL007CP47080 GAR1YHR089C 618 nt16.15■□□□□ 0.18
YJL007CP47080 YKL097CYKL097C 411 nt16.14■□□□□ 0.17
YJL007CP47080 DEP1YAL013W 1218 nt15.85■□□□□ 0.13
YJL007CP47080 SHU1YHL006C 453 nt15.83■□□□□ 0.12
YJL007CP47080 URN1YPR152C 1398 nt15.7■□□□□ 0.1
YJL007CP47080 YNL208WYNL208W 600 nt15.6■□□□□ 0.09
YJL007CP47080 TIR1YER011W 765 nt15.58■□□□□ 0.08
YJL007CP47080 RPN10YHR200W 807 nt15.5■□□□□ 0.07
YJL007CP47080 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.49■□□□□ 0.07
YJL007CP47080 YOR139CYOR139C 393 nt15.46■□□□□ 0.07
YJL007CP47080 OPI9YLR338W 858 nt15.37■□□□□ 0.05
YJL007CP47080 SSA1YAL005C 1929 nt15.33■□□□□ 0.04
YJL007CP47080 SRB2YHR041C 633 nt15.2■□□□□ 0.02
YJL007CP47080 SAH1YER043C 1350 nt15.19■□□□□ 0.02
YJL007CP47080 NPL3YDR432W 1245 nt15.18■□□□□ 0.02
YJL007CP47080 PUT4YOR348C 1884 nt15.06■□□□□ 0
YJL007CP47080 YJR018WYJR018W 363 nt15□□□□□ -0.01
YJL007CP47080 WWM1YFL010C 636 nt14.99□□□□□ -0.01
YJL007CP47080 MNP1YGL068W 585 nt14.99□□□□□ -0.01
YJL007CP47080 HOM6YJR139C 1080 nt14.99□□□□□ -0.01
YJL007CP47080 YGR021WYGR021W 873 nt14.96□□□□□ -0.01
YJL007CP47080 ARE1YCR048W 1833 nt14.93□□□□□ -0.02
YJL007CP47080 PUN1YLR414C 792 nt14.9□□□□□ -0.02
YJL007CP47080 YJR120WYJR120W 351 nt14.89□□□□□ -0.03
YJL007CP47080 YOL037CYOL037C 354 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL007CP47080 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.83□□□□□ -0.04
YJL007CP47080 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.83□□□□□ -0.04
YJL007CP47080 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.83□□□□□ -0.04
YJL007CP47080 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.83□□□□□ -0.04
YJL007CP47080 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.83□□□□□ -0.04
YJL007CP47080 RPP2BYDR382W 333 nt14.78□□□□□ -0.04
YJL007CP47080 RKM5YLR137W 1104 nt14.76□□□□□ -0.05
YJL007CP47080 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.7□□□□□ -0.06
YJL007CP47080 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL007CP47080 PTC2YER089C 1395 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL007CP47080 SSA3YBL075C 1950 nt14.67□□□□□ -0.06
YJL007CP47080 POA1YBR022W 534 nt14.65□□□□□ -0.06
YJL007CP47080 BDH2YAL061W 1254 nt14.59□□□□□ -0.07
YJL007CP47080 PUS2YGL063W 1113 nt14.56□□□□□ -0.08
YJL007CP47080 YLR281CYLR281C 468 nt14.54□□□□□ -0.08
YJL007CP47080 LSM3YLR438C-A 270 nt14.48□□□□□ -0.09
YJL007CP47080 WHI5YOR083W 888 nt14.43□□□□□ -0.1
YJL007CP47080 BUD23YCR047C 828 nt14.42□□□□□ -0.1
YJL007CP47080 NAB2YGL122C 1578 nt14.41□□□□□ -0.1
YJL007CP47080 INM2YDR287W 879 nt14.4□□□□□ -0.1
YJL007CP47080 YBL100CYBL100C 315 nt14.33□□□□□ -0.12
YJL007CP47080 FPR4YLR449W 1179 nt14.31□□□□□ -0.12
YJL007CP47080 DAL1YIR027C 1383 nt14.3□□□□□ -0.12
YJL007CP47080 NME1NME1 340 nt14.28□□□□□ -0.12
YJL007CP47080 TRM9YML014W 840 nt14.25□□□□□ -0.13
YJL007CP47080 BSC6YOL137W 1494 nt14.25□□□□□ -0.13
YJL007CP47080 FIS1YIL065C 468 nt14.24□□□□□ -0.13
YJL007CP47080 YPR011CYPR011C 981 nt14.24□□□□□ -0.13
YJL007CP47080 FUN26YAL022C 1554 nt14.19□□□□□ -0.14
YJL007CP47080 FMP45YDL222C 930 nt14.17□□□□□ -0.14
YJL007CP47080 PHO4YFR034C 939 nt14.16□□□□□ -0.14
YJL007CP47080 DSK2YMR276W 1122 nt14.14□□□□□ -0.15
YJL007CP47080 YLR236CYLR236C 324 nt14.12□□□□□ -0.15
YJL007CP47080 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.08□□□□□ -0.16
YJL007CP47080 CCT6YDR188W 1641 nt14.07□□□□□ -0.16
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