RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639051.1

ZNF410-225, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 5 BASIC

Gene ZNF410, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-225	ENST00000639051	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ZNF410-225	ENST00000639051	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ZNF410-225	ENST00000639051	FBLN2	P98095	1184 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ZNF410-225	ENST00000639051	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ZNF410-225	ENST00000639051	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ZNF410-225	ENST00000639051	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ZNF410-225	ENST00000639051	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	PRX	Q9BXM0	1461 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	IGF1R	P08069	1367 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ZNF410-225	ENST00000639051	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21	6e-6	■■■■□ 25.1
ZNF410-225	ENST00000639051	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ZNF410-225	ENST00000639051	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF410-225	ENST00000639051	KDM6B	O15054	1643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF410-225	ENST00000639051	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF410-225	ENST00000639051	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF410-225	ENST00000639051	SOCS7	O14512	581 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF410-225	ENST00000639051	SYNJ2	O15056	1496 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF410-225	ENST00000639051	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF410-225	ENST00000639051	GRIN2A	Q12879	1464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF410-225	ENST00000639051	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF410-225	ENST00000639051	CLIP1	P30622	1438 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF410-225	ENST00000639051	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ZNF410-225	ENST00000639051	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ZNF410-225	ENST00000639051	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ZNF410-225	ENST00000639051	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ZNF410-225	ENST00000639051	NUP160	Q12769	1436 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ZNF410-225	ENST00000639051	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ZNF410-225	ENST00000639051	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ZNF410-225	ENST00000639051	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ZNF410-225	ENST00000639051	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ZNF410-225	ENST00000639051	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ZNF410-225	ENST00000639051	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ZNF410-225	ENST00000639051	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF410-225	ENST00000639051	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF410-225	ENST00000639051	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF410-225	ENST00000639051	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ZNF410-225	ENST00000639051	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	APLP2	Q06481	763 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	JPH4	Q96JJ6	628 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ZNF410-225	ENST00000639051	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
ZNF410-225	ENST00000639051	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ZNF410-225	ENST00000639051	PTPRG	P23470	1445 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ZNF410-225	ENST00000639051	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ZNF410-225	ENST00000639051	ABCA8	O94911	1581 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF410-225	ENST00000639051	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ZNF410-225	ENST00000639051	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ZNF410-225	ENST00000639051	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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