RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.52■■■■■ 5.36
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.49■■■■■ 5.35
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.46■■■■■ 5.35
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.35■■■■■ 5.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPKBP1O60336 1514 aa48.28■■■■■ 5.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.26■■■■■ 5.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.23■■■■■ 5.31
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF1RP08069 1367 aa48.23■■■■■ 5.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF27Q86VH2 1401 aa48.23■■■■■ 5.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DIP2BQ9P265 1576 aa48.18■■■■■ 5.3
CAPNS1-217ENST00000629983 CUL7Q14999 1698 aa48.12■■■■■ 5.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.07■■■■■ 5.29
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRGP23470 1445 aa47.99■■■■■ 5.27
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM6BO15054 1643 aa47.97■■■■■ 5.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.95■■■■■ 5.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.88■■■■■ 5.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPOAP1O95153 1857 aa47.85■■■■■ 5.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.85■■■■■ 5.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC2Q92887 1545 aa47.76■■■■■ 5.24
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.75■■■■■ 5.23
CAPNS1-217ENST00000629983 IQGAP2Q13576 1575 aa47.71■■■■■ 5.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ASXL2Q76L83 1435 aa47.68■■■■■ 5.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.65■■■■■ 5.22
CAPNS1-217ENST00000629983 UACAQ9BZF9 1416 aa47.58■■■■■ 5.21
CAPNS1-217ENST00000629983 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.56■■■■■ 5.2
CAPNS1-217ENST00000629983 DISP1Q96F81 1524 aa47.51■■■■■ 5.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GLI2P10070 1586 aa47.51■■■■■ 5.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.43■■■■■ 5.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
CAPNS1-217ENST00000629983 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
CAPNS1-217ENST00000629983 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.35■■■■■ 5.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.35■■■■■ 5.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0556O60303 1618 aa47.27■■■■■ 5.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRL1O94910 1474 aa47.27■■■■■ 5.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.26■■■■■ 5.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
CAPNS1-217ENST00000629983 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.21■■■■■ 5.15
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.11■■■■■ 5.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA3Q08378 1498 aa47.01■■■■■ 5.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNH8Q96L42 1107 aa46.97■■■■■ 5.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.95■■■■■ 5.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CD109Q6YHK3 1445 aa46.92■■■■■ 5.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA8O94911 1581 aa46.86■■■■■ 5.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.83■■■■■ 5.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.78■■■■■ 5.08
CAPNS1-217ENST00000629983 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.77■■■■■ 5.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID3CA6NKF2 412 aa46.74■■■■■ 5.07
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PRXQ9BXM0 1461 aa46.74■■■■■ 5.07
CAPNS1-217ENST00000629983 P3H3Q8IVL6 736 aa46.66■■■■■ 5.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP10BO94823 1461 aa46.51■■■■■ 5.04
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF21BO75037 1637 aa46.5■■■■■ 5.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.46■■■■■ 5.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.35■■■■■ 5.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.32■■■■■ 5.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.32■■■■■ 5.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RAPGEF3O95398 923 aa46.3■■■■■ 5
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD9Q5K651 1589 aa46.27■■■■■ 5
CAPNS1-217ENST00000629983 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
CAPNS1-217ENST00000629983 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.27■■■■■ 5
CAPNS1-217ENST00000629983 NEO1Q92859 1461 aa46.22■■■■■ 4.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRMP28827 1452 aa46.16■■■■■ 4.98
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.1■■■■■ 4.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.08■■■■■ 4.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.03■■■■■ 4.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.02■■■■■ 4.96
CAPNS1-217ENST00000629983 EEA1Q15075 1411 aa45.98■■■■■ 4.95
CAPNS1-217ENST00000629983 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.95■■■■■ 4.95
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MADDQ8WXG6 1647 aa45.93■■■■■ 4.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO41Q8TF61 875 aa45.93■■■■■ 4.94
CAPNS1-217ENST00000629983 AKNAQ7Z591 1439 aa45.89■■■■■ 4.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.88■■■■■ 4.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCAO15360 1455 aa45.87■■■■■ 4.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PLPPR3Q6T4P5 718 aa45.8■■■■■ 4.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.79■■■■■ 4.92
CAPNS1-217ENST00000629983 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.79■■■■■ 4.926e-24■■□□□ 13
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.76■■■■■ 4.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LMTK3Q96Q04 1460 aa45.75■■■■■ 4.91
CAPNS1-217ENST00000629983 RICTORQ6R327 1708 aa45.75■■■■■ 4.91
CAPNS1-217ENST00000629983 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
CAPNS1-217ENST00000629983 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.73■■■■■ 4.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.72■■■■■ 4.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.67■■■■■ 4.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
CAPNS1-217ENST00000629983 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.65■■■■■ 4.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.64■■■■■ 4.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MLECQ14165 292 aa45.63■■■■■ 4.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA2P54652 639 aa45.61■■■■■ 4.89
CAPNS1-217ENST00000629983 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.6■■■■■ 4.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.57■■■■■ 4.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.56■■■■■ 4.88
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