RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629319.2

ZIM2-208, Transcript of zinc finger imprinted 2, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene ZIM2, Length 2,253 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZIM2-208	ENST00000629319	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.42	■■■□□ 2.14
ZIM2-208	ENST00000629319	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ZIM2-208	ENST00000629319	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ZIM2-208	ENST00000629319	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ZIM2-208	ENST00000629319	IGF1R	P08069	1367 aa		28.4	■■■□□ 2.14
ZIM2-208	ENST00000629319	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
ZIM2-208	ENST00000629319	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.35	■■■□□ 2.13
ZIM2-208	ENST00000629319	FKBP8	Q14318	412 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ZIM2-208	ENST00000629319	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		28.32	■■■□□ 2.12
ZIM2-208	ENST00000629319	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.3	■■■□□ 2.12
ZIM2-208	ENST00000629319	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
ZIM2-208	ENST00000629319	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
ZIM2-208	ENST00000629319	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
ZIM2-208	ENST00000629319	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ZIM2-208	ENST00000629319	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.22	■■■□□ 2.11
ZIM2-208	ENST00000629319	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ZIM2-208	ENST00000629319	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
ZIM2-208	ENST00000629319	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ZIM2-208	ENST00000629319	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ZIM2-208	ENST00000629319	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ZIM2-208	ENST00000629319	NEFL	P07196	543 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ZIM2-208	ENST00000629319	ANP32C	O43423	234 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ZIM2-208	ENST00000629319	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ZIM2-208	ENST00000629319	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ZIM2-208	ENST00000629319	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ZIM2-208	ENST00000629319	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.01	■■■□□ 2.07	7e-8	■□□□□ 8.4
ZIM2-208	ENST00000629319	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
ZIM2-208	ENST00000629319	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28	■■■□□ 2.07
ZIM2-208	ENST00000629319	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28	■■■□□ 2.07
ZIM2-208	ENST00000629319	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ZIM2-208	ENST00000629319	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ZIM2-208	ENST00000629319	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ZIM2-208	ENST00000629319	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ZIM2-208	ENST00000629319	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06	4e-7	■■■■■ 36.4
ZIM2-208	ENST00000629319	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ZIM2-208	ENST00000629319	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ZIM2-208	ENST00000629319	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ZIM2-208	ENST00000629319	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	CUL7	Q14999	1698 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ZIM2-208	ENST00000629319	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZIM2-208	ENST00000629319	FMN1	Q68DA7	1419 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZIM2-208	ENST00000629319	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ZIM2-208	ENST00000629319	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZIM2-208	ENST00000629319	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ZIM2-208	ENST00000629319	NAIP	Q13075	1403 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZIM2-208	ENST00000629319	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04
ZIM2-208	ENST00000629319	TOPBP1	Q92547	1522 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZIM2-208	ENST00000629319	BCL11A	Q9H165	835 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZIM2-208	ENST00000629319	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZIM2-208	ENST00000629319	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ZIM2-208	ENST00000629319	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ZIM2-208	ENST00000629319	MSH5	O43196	834 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ZIM2-208	ENST00000629319	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
ZIM2-208	ENST00000629319	SAMD9	Q5K651	1589 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ZIM2-208	ENST00000629319	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ZIM2-208	ENST00000629319	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ZIM2-208	ENST00000629319	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
ZIM2-208	ENST00000629319	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ZIM2-208	ENST00000629319	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ZIM2-208	ENST00000629319	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ZIM2-208	ENST00000629319	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ZIM2-208	ENST00000629319	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ZIM2-208	ENST00000629319	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ZIM2-208	ENST00000629319	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		27.58	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	NES	P48681	1621 aa		27.57	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.55	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.55	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.54	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	KDM6B	O15054	1643 aa		27.54	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.53	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.52	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.52	■■■□□ 2
ZIM2-208	ENST00000629319	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	27.51	■■□□□ 1.99
ZIM2-208	ENST00000629319	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ZIM2-208	ENST00000629319	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		27.47	■■□□□ 1.99
ZIM2-208	ENST00000629319	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
ZIM2-208	ENST00000629319	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
ZIM2-208	ENST00000629319	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	27.45	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		27.43	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		27.42	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	CCDC7	Q96M83	1385 aa		27.4	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.39	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.39	■■□□□ 1.98
ZIM2-208	ENST00000629319	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		27.38	■■□□□ 1.97
ZIM2-208	ENST00000629319	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.38	■■□□□ 1.97
ZIM2-208	ENST00000629319	FOXD1	Q16676	465 aa		27.38	■■□□□ 1.97
ZIM2-208	ENST00000629319	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.36	■■□□□ 1.97

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