RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628147.2

PCBP1-AS1-322, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 NUP160Q12769 1436 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ARAP1Q96P48 1450 aa13.17□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.17□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PRXQ9BXM0 1461 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 JPH4Q96JJ6 628 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 SHROOM2Q13796 1616 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa13.09□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 IQGAP2Q13576 1575 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KIF21BO75037 1637 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 GOLGA3Q08378 1498 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.98□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.96□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KIAA0556O60303 1618 aa12.94□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.94□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 P3H3Q8IVL6 736 aa12.93□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PTPRGP23470 1445 aa12.93□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 DISP1Q96F81 1524 aa12.93□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.92□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.9□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.87□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TSPOAP1O95153 1857 aa12.87□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ARID3CA6NKF2 412 aa12.83□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 SAMD9Q5K651 1589 aa12.82□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.82□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 UACAQ9BZF9 1416 aa12.82□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.82□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.8□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CLIP1P30622 1438 aa12.79□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.79□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ABCC2Q92887 1545 aa12.78□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.78□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 DIP2BQ9P265 1576 aa12.76□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ABCA8O94911 1581 aa12.75□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CEP162Q5TB80 1403 aa12.75□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 FMN1Q68DA7 1419 aa12.74□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.73□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 MAPKBP1O60336 1514 aa12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.71□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ASXL2Q76L83 1435 aa12.71□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ATP10BO94823 1461 aa12.68□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.68□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.66□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.64□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KCNH8Q96L42 1107 aa12.64□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.63□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 HECW1Q76N89 1606 aa12.62□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa12.61□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.6□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KDM6BO15054 1643 aa12.59□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.59□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.58□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.58□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 GLI2P10070 1586 aa12.57□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TTC37Q6PGP7 1564 aa12.53□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 APLP2Q06481 763 aa12.53□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KIF14Q15058 1648 aa12.52□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CD109Q6YHK3 1445 aa12.52□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ABCA9Q8IUA7 1624 aa12.51□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.5□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.48□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.47□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP12.47□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TEX14Q8IWB6 1497 aa12.47□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 TIAM1Q13009 1591 aa12.44□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 MAP3K1Q13233 1512 aa12.44□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PLCH2O75038 1416 aa12.43□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.42□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.42□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.42□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.41□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.41□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.41□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CFAP74Q9C0B2 1584 aa12.4□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.4□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.39□□□□□ -0.43
PCBP1-AS1-322ENST00000628147 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms