RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.59■■■■■ 5.53
SEMA3B-215ENST00000621029 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.56■■■■■ 5.52
SEMA3B-215ENST00000621029 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.54■■■■■ 5.52
SEMA3B-215ENST00000621029 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.43■■■■■ 5.5
SEMA3B-215ENST00000621029 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.16■■■■■ 5.46
SEMA3B-215ENST00000621029 IQGAP2Q13576 1575 aa49.03■■■■■ 5.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.03■■■■■ 5.44
SEMA3B-215ENST00000621029 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.01■■■■■ 5.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49■■■■■ 5.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PTPRGP23470 1445 aa48.92■■■■■ 5.42
SEMA3B-215ENST00000621029 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.87■■■■■ 5.41
SEMA3B-215ENST00000621029 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.81■■■■■ 5.4
SEMA3B-215ENST00000621029 PRXQ9BXM0 1461 aa48.76■■■■■ 5.4
SEMA3B-215ENST00000621029 DISP1Q96F81 1524 aa48.73■■■■■ 5.39
SEMA3B-215ENST00000621029 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.72■■■■■ 5.39
SEMA3B-215ENST00000621029 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.7■■■■■ 5.39
SEMA3B-215ENST00000621029 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.63■■■■■ 5.37
SEMA3B-215ENST00000621029 MAPKBP1O60336 1514 aa48.62■■■■■ 5.37
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.61■■■■■ 5.37
SEMA3B-215ENST00000621029 KIAA0556O60303 1618 aa48.56■■■■■ 5.36
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.54■■■■■ 5.36
SEMA3B-215ENST00000621029 EEA1Q15075 1411 aa48.53■■■■■ 5.36
SEMA3B-215ENST00000621029 UACAQ9BZF9 1416 aa48.53■■■■■ 5.36
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.52■■■■■ 5.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCC2Q92887 1545 aa48.49■■■■■ 5.35
SEMA3B-215ENST00000621029 GOLGA3Q08378 1498 aa48.48■■■■■ 5.35
SEMA3B-215ENST00000621029 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.44■■■■■ 5.35
SEMA3B-215ENST00000621029 DIP2BQ9P265 1576 aa48.39■■■■■ 5.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.38■■■■■ 5.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ASXL2Q76L83 1435 aa48.3■■■■■ 5.32
SEMA3B-215ENST00000621029 P3H3Q8IVL6 736 aa48.26■■■■■ 5.32
SEMA3B-215ENST00000621029 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.26■■■■■ 5.32
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.22■■■■■ 5.31
SEMA3B-215ENST00000621029 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
SEMA3B-215ENST00000621029 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
SEMA3B-215ENST00000621029 TSPOAP1O95153 1857 aa48.07■■■■■ 5.29
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCA8O94911 1581 aa48.06■■■■■ 5.28
SEMA3B-215ENST00000621029 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.05■■■■■ 5.28
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF21BO75037 1637 aa48.03■■■■■ 5.28
SEMA3B-215ENST00000621029 GLI2P10070 1586 aa47.98■■■■■ 5.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMD9Q5K651 1589 aa47.97■■■■■ 5.27
SEMA3B-215ENST00000621029 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ARID3CA6NKF2 412 aa47.95■■■■■ 5.27
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.91■■■■■ 5.26
SEMA3B-215ENST00000621029 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM6BO15054 1643 aa47.86■■■■■ 5.25
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNH8Q96L42 1107 aa47.86■■■■■ 5.25
SEMA3B-215ENST00000621029 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.81■■■■■ 5.24
SEMA3B-215ENST00000621029 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.74■■■■■ 5.23
SEMA3B-215ENST00000621029 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.73■■■■■ 5.23
SEMA3B-215ENST00000621029 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.73■■■■■ 5.23
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.73■■■■■ 5.23
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP10BO94823 1461 aa47.72■■■■■ 5.23
SEMA3B-215ENST00000621029 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
SEMA3B-215ENST00000621029 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.7■■■■■ 5.23
SEMA3B-215ENST00000621029 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.68■■■■■ 5.22
SEMA3B-215ENST00000621029 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.67■■■■■ 5.22
SEMA3B-215ENST00000621029 CD109Q6YHK3 1445 aa47.61■■■■■ 5.21
SEMA3B-215ENST00000621029 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
SEMA3B-215ENST00000621029 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.5■■■■■ 5.19
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.45■■■■■ 5.19
SEMA3B-215ENST00000621029 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
SEMA3B-215ENST00000621029 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.39■■■■■ 5.18
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.39■■■■■ 5.18
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.37■■■■■ 5.17
SEMA3B-215ENST00000621029 FMN1Q68DA7 1419 aa47.32■■■■■ 5.17
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.27■■■■■ 5.16
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
SEMA3B-215ENST00000621029 HECW1Q76N89 1606 aa47.13■■■■■ 5.14
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.12■■■■■ 5.13
SEMA3B-215ENST00000621029 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.08■■■■■ 5.13
SEMA3B-215ENST00000621029 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.05■■■■■ 5.12
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
SEMA3B-215ENST00000621029 NEO1Q92859 1461 aa47.02■■■■■ 5.12
SEMA3B-215ENST00000621029 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.97■■■■■ 5.11
SEMA3B-215ENST00000621029 CLIP1P30622 1438 aa46.96■■■■■ 5.11
SEMA3B-215ENST00000621029 RAPGEF3O95398 923 aa46.94■■■■■ 5.1
SEMA3B-215ENST00000621029 ADGRL1O94910 1474 aa46.91■■■■■ 5.1
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.9■■■■■ 5.1
SEMA3B-215ENST00000621029 FANCAO15360 1455 aa46.86■■■■■ 5.09
SEMA3B-215ENST00000621029 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.85■■■■■ 5.09
SEMA3B-215ENST00000621029 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
SEMA3B-215ENST00000621029 AKNAQ7Z591 1439 aa46.81■■■■■ 5.08
SEMA3B-215ENST00000621029 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
SEMA3B-215ENST00000621029 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.77■■■■■ 5.08
SEMA3B-215ENST00000621029 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.75■■■■■ 5.07
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.74■■■■■ 5.07
SEMA3B-215ENST00000621029 PLCH2O75038 1416 aa46.73■■■■■ 5.07
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.72■■■■■ 5.07
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF14Q15058 1648 aa46.71■■■■■ 5.07
SEMA3B-215ENST00000621029 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.69■■■■■ 5.06
SEMA3B-215ENST00000621029 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.66■■■■■ 5.06
SEMA3B-215ENST00000621029 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.65■■■■■ 5.06
SEMA3B-215ENST00000621029 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.59■■■■■ 5.05
SEMA3B-215ENST00000621029 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.57■■■■■ 5.05
SEMA3B-215ENST00000621029 CEP162Q5TB80 1403 aa46.56■■■■■ 5.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
SEMA3B-215ENST00000621029 RICTORQ6R327 1708 aa46.53■■■■■ 5.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.52■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms