RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619989.1

CCL3L3-203, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3L3, Length 784 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-203ENST00000619989 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 NUP160Q12769 1436 aa22.9■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 CEP170Q5SW79 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 CUL7Q14999 1698 aa22.89■■□□□ 1.25
CCL3L3-203ENST00000619989 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.82■■□□□ 1.24
CCL3L3-203ENST00000619989 JPH4Q96JJ6 628 aa22.77■■□□□ 1.24
CCL3L3-203ENST00000619989 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.76■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.74■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 ARAP1Q96P48 1450 aa22.73■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.72■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 SHROOM2Q13796 1616 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 EEA1Q15075 1411 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 PRXQ9BXM0 1461 aa22.66■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CCL3L3-203ENST00000619989 IQGAP2Q13576 1575 aa22.57■■□□□ 1.2
CCL3L3-203ENST00000619989 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCL3L3-203ENST00000619989 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.52■■□□□ 1.2
CCL3L3-203ENST00000619989 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.5■■□□□ 1.19
CCL3L3-203ENST00000619989 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.47■■□□□ 1.19
CCL3L3-203ENST00000619989 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.44■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 PTPRGP23470 1445 aa22.43■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.43■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 DISP1Q96F81 1524 aa22.42■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 KIF21BO75037 1637 aa22.41■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 MSH5O43196 834 aa22.36■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 P3H3Q8IVL6 736 aa22.36■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 GOLGA3Q08378 1498 aa22.35■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 KIAA0556O60303 1618 aa22.35■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL3L3-203ENST00000619989 UACAQ9BZF9 1416 aa22.25■■□□□ 1.15
CCL3L3-203ENST00000619989 SAMD9Q5K651 1589 aa22.19■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.18■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.18■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCC2Q92887 1545 aa22.17■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.15■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCA8O94911 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 MAPKBP1O60336 1514 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 ARID3CA6NKF2 412 aa22.1■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.09■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.08■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 ASXL2Q76L83 1435 aa22.06■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.05■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.05■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.04■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.01■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.99■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 ATP10BO94823 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 DIP2BQ9P265 1576 aa21.97■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 KCNH8Q96L42 1107 aa21.97■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 CLIP1P30622 1438 aa21.96■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 FMN1Q68DA7 1419 aa21.96■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCL3L3-203ENST00000619989 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.92■■□□□ 1.1
CCL3L3-203ENST00000619989 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCL3L3-203ENST00000619989 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.86■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CEP162Q5TB80 1403 aa21.86■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 GLI2P10070 1586 aa21.86■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TSPOAP1O95153 1857 aa21.85■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 HECW1Q76N89 1606 aa21.81■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.78■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 CD109Q6YHK3 1445 aa21.77■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.76■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.7■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.69■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.69■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.67■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.66■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.66■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 KDM6BO15054 1643 aa21.65■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.58■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.57■■□□□ 1.04
CCL3L3-203ENST00000619989 KIF14Q15058 1648 aa21.55■■□□□ 1.04
CCL3L3-203ENST00000619989 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.53■■□□□ 1.04
CCL3L3-203ENST00000619989 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 PLCH2O75038 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 NEO1Q92859 1461 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 FANCAO15360 1455 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.49■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 RAPGEF3O95398 923 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms