RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618568.4

ARFRP1-211, Transcript of ADP ribosylation factor related protein 1, human

TSL 3

Gene ARFRP1, Length 1,612 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFRP1-211	ENST00000618568	NUP160	Q12769	1436 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ARFRP1-211	ENST00000618568	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ARFRP1-211	ENST00000618568	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ARFRP1-211	ENST00000618568	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ARFRP1-211	ENST00000618568	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ARFRP1-211	ENST00000618568	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ARFRP1-211	ENST00000618568	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
ARFRP1-211	ENST00000618568	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ARFRP1-211	ENST00000618568	CLIP1	P30622	1438 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ARFRP1-211	ENST00000618568	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ARFRP1-211	ENST00000618568	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ARFRP1-211	ENST00000618568	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ARFRP1-211	ENST00000618568	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ARFRP1-211	ENST00000618568	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ARFRP1-211	ENST00000618568	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ARFRP1-211	ENST00000618568	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ARFRP1-211	ENST00000618568	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ARFRP1-211	ENST00000618568	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
ARFRP1-211	ENST00000618568	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ARFRP1-211	ENST00000618568	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ARFRP1-211	ENST00000618568	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ARFRP1-211	ENST00000618568	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ARFRP1-211	ENST00000618568	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ARFRP1-211	ENST00000618568	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ARFRP1-211	ENST00000618568	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ARFRP1-211	ENST00000618568	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ARFRP1-211	ENST00000618568	PTPRG	P23470	1445 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ARFRP1-211	ENST00000618568	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
ARFRP1-211	ENST00000618568	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ARFRP1-211	ENST00000618568	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ARFRP1-211	ENST00000618568	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
ARFRP1-211	ENST00000618568	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.49	■■■□□ 2.79
ARFRP1-211	ENST00000618568	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ARFRP1-211	ENST00000618568	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ARFRP1-211	ENST00000618568	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ARFRP1-211	ENST00000618568	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ARFRP1-211	ENST00000618568	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ARFRP1-211	ENST00000618568	ABCA8	O94911	1581 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ARFRP1-211	ENST00000618568	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
ARFRP1-211	ENST00000618568	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ARFRP1-211	ENST00000618568	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ARFRP1-211	ENST00000618568	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ARFRP1-211	ENST00000618568	APLP2	Q06481	763 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ARFRP1-211	ENST00000618568	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ARFRP1-211	ENST00000618568	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.32	■■■□□ 2.77
ARFRP1-211	ENST00000618568	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ARFRP1-211	ENST00000618568	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ARFRP1-211	ENST00000618568	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ARFRP1-211	ENST00000618568	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ARFRP1-211	ENST00000618568	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ARFRP1-211	ENST00000618568	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ARFRP1-211	ENST00000618568	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ARFRP1-211	ENST00000618568	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ARFRP1-211	ENST00000618568	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ARFRP1-211	ENST00000618568	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
ARFRP1-211	ENST00000618568	ATP10B	O94823	1461 aa		32.2	■■■□□ 2.74
ARFRP1-211	ENST00000618568	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ARFRP1-211	ENST00000618568	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ARFRP1-211	ENST00000618568	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ARFRP1-211	ENST00000618568	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ARFRP1-211	ENST00000618568	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ARFRP1-211	ENST00000618568	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARFRP1-211	ENST00000618568	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ARFRP1-211	ENST00000618568	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72
ARFRP1-211	ENST00000618568	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
ARFRP1-211	ENST00000618568	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ARFRP1-211	ENST00000618568	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ARFRP1-211	ENST00000618568	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ARFRP1-211	ENST00000618568	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ARFRP1-211	ENST00000618568	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
ARFRP1-211	ENST00000618568	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
ARFRP1-211	ENST00000618568	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ARFRP1-211	ENST00000618568	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ARFRP1-211	ENST00000618568	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ARFRP1-211	ENST00000618568	KIF14	Q15058	1648 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ARFRP1-211	ENST00000618568	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ARFRP1-211	ENST00000618568	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ARFRP1-211	ENST00000618568	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ARFRP1-211	ENST00000618568	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ARFRP1-211	ENST00000618568	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ARFRP1-211	ENST00000618568	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.7	■■■□□ 2.67	6e-7	■■■■■ 27.8
ARFRP1-211	ENST00000618568	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.68	■■■□□ 2.66
ARFRP1-211	ENST00000618568	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.67	■■■□□ 2.66
ARFRP1-211	ENST00000618568	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ARFRP1-211	ENST00000618568	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	GLI2	P10070	1586 aa		31.57	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.57	■■■□□ 2.65
ARFRP1-211	ENST00000618568	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
ARFRP1-211	ENST00000618568	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ARFRP1-211	ENST00000618568	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
ARFRP1-211	ENST00000618568	PLCH2	O75038	1416 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ARFRP1-211	ENST00000618568	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ARFRP1-211	ENST00000618568	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.51	■■■□□ 2.64
ARFRP1-211	ENST00000618568	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.5	■■■□□ 2.63

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