RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616429.1

U85056.1-201, humanhuman

BASIC

Gene U85056.1, Length 682 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U85056.1-201ENST00000616429 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.36■■■■■ 4.37
U85056.1-201ENST00000616429 CUL7Q14999 1698 aa42.32■■■■■ 4.37
U85056.1-201ENST00000616429 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.23■■■■■ 4.35
U85056.1-201ENST00000616429 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.2■■■■■ 4.35
U85056.1-201ENST00000616429 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.86■■■■■ 4.29
U85056.1-201ENST00000616429 IQGAP2Q13576 1575 aa41.84■■■■■ 4.29
U85056.1-201ENST00000616429 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.83■■■■■ 4.29
U85056.1-201ENST00000616429 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
U85056.1-201ENST00000616429 PTPRGP23470 1445 aa41.76■■■■■ 4.28
U85056.1-201ENST00000616429 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
U85056.1-201ENST00000616429 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.75■■■■■ 4.27
U85056.1-201ENST00000616429 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.71■■■■■ 4.27
U85056.1-201ENST00000616429 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.7■■■■■ 4.27
U85056.1-201ENST00000616429 MAPKBP1O60336 1514 aa41.66■■■■■ 4.26
U85056.1-201ENST00000616429 DISP1Q96F81 1524 aa41.66■■■■■ 4.26
U85056.1-201ENST00000616429 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.61■■■■■ 4.25
U85056.1-201ENST00000616429 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.6■■■■■ 4.25
U85056.1-201ENST00000616429 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.59■■■■■ 4.25
U85056.1-201ENST00000616429 PRXQ9BXM0 1461 aa41.54■■■■■ 4.24
U85056.1-201ENST00000616429 DIP2BQ9P265 1576 aa41.51■■■■■ 4.24
U85056.1-201ENST00000616429 ABCC2Q92887 1545 aa41.47■■■■■ 4.23
U85056.1-201ENST00000616429 KIAA0556O60303 1618 aa41.46■■■■■ 4.23
U85056.1-201ENST00000616429 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.45■■■■■ 4.23
U85056.1-201ENST00000616429 UACAQ9BZF9 1416 aa41.44■■■■■ 4.23
U85056.1-201ENST00000616429 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.43■■■■■ 4.22
U85056.1-201ENST00000616429 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.34■■■■■ 4.21
U85056.1-201ENST00000616429 ASXL2Q76L83 1435 aa41.31■■■■■ 4.2
U85056.1-201ENST00000616429 GOLGA3Q08378 1498 aa41.26■■■■■ 4.2
U85056.1-201ENST00000616429 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.25■■■■■ 4.19
U85056.1-201ENST00000616429 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.25■■■■■ 4.19
U85056.1-201ENST00000616429 TSPOAP1O95153 1857 aa41.19■■■■■ 4.18
U85056.1-201ENST00000616429 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
U85056.1-201ENST00000616429 EEA1Q15075 1411 aa41.14■■■■■ 4.18
U85056.1-201ENST00000616429 GLI2P10070 1586 aa41.12■■■■■ 4.17
U85056.1-201ENST00000616429 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
U85056.1-201ENST00000616429 ABCA8O94911 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
U85056.1-201ENST00000616429 P3H3Q8IVL6 736 aa41.07■■■■■ 4.17
U85056.1-201ENST00000616429 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
U85056.1-201ENST00000616429 KDM6BO15054 1643 aa41.04■■■■■ 4.16
U85056.1-201ENST00000616429 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
U85056.1-201ENST00000616429 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
U85056.1-201ENST00000616429 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.95■■■■■ 4.15
U85056.1-201ENST00000616429 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.94■■■■■ 4.14
U85056.1-201ENST00000616429 SAMD9Q5K651 1589 aa40.92■■■■■ 4.14
U85056.1-201ENST00000616429 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.9■■■■■ 4.14
U85056.1-201ENST00000616429 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
U85056.1-201ENST00000616429 ARID3CA6NKF2 412 aa40.84■■■■■ 4.13
U85056.1-201ENST00000616429 KCNH8Q96L42 1107 aa40.82■■■■■ 4.13
U85056.1-201ENST00000616429 KIF21BO75037 1637 aa40.81■■■■■ 4.12
U85056.1-201ENST00000616429 ATP10BO94823 1461 aa40.77■■■■■ 4.12
U85056.1-201ENST00000616429 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
U85056.1-201ENST00000616429 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.74■■■■■ 4.11
U85056.1-201ENST00000616429 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.71■■■■■ 4.11
U85056.1-201ENST00000616429 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.69■■■■■ 4.1
U85056.1-201ENST00000616429 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.68■■■■■ 4.1
U85056.1-201ENST00000616429 CD109Q6YHK3 1445 aa40.67■■■■■ 4.1
U85056.1-201ENST00000616429 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.63■■■■■ 4.1
U85056.1-201ENST00000616429 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.61■■■■■ 4.09
U85056.1-201ENST00000616429 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
U85056.1-201ENST00000616429 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.56■■■■■ 4.08
U85056.1-201ENST00000616429 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
U85056.1-201ENST00000616429 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.55■■■■■ 4.08
U85056.1-201ENST00000616429 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
U85056.1-201ENST00000616429 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
U85056.1-201ENST00000616429 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.42■■■■■ 4.06
U85056.1-201ENST00000616429 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.32■■■■■ 4.05
U85056.1-201ENST00000616429 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.32■■■■■ 4.05
U85056.1-201ENST00000616429 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.28■■■■■ 4.04
U85056.1-201ENST00000616429 ADGRL1O94910 1474 aa40.27■■■■■ 4.04
U85056.1-201ENST00000616429 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
U85056.1-201ENST00000616429 FMN1Q68DA7 1419 aa40.2■■■■■ 4.03
U85056.1-201ENST00000616429 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.2■■■■■ 4.03
U85056.1-201ENST00000616429 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
U85056.1-201ENST00000616429 NEO1Q92859 1461 aa40.18■■■■■ 4.02
U85056.1-201ENST00000616429 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
U85056.1-201ENST00000616429 RAPGEF3O95398 923 aa40.13■■■■■ 4.01
U85056.1-201ENST00000616429 HECW1Q76N89 1606 aa40.09■■■■■ 4.01
U85056.1-201ENST00000616429 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.06■■■■■ 4
U85056.1-201ENST00000616429 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40■■■■□ 3.99
U85056.1-201ENST00000616429 FANCAO15360 1455 aa39.99■■■■□ 3.99
U85056.1-201ENST00000616429 AKNAQ7Z591 1439 aa39.99■■■■□ 3.99
U85056.1-201ENST00000616429 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
U85056.1-201ENST00000616429 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
U85056.1-201ENST00000616429 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.91■■■■□ 3.98
U85056.1-201ENST00000616429 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.89■■■■□ 3.98
U85056.1-201ENST00000616429 PLCH2O75038 1416 aa39.88■■■■□ 3.97
U85056.1-201ENST00000616429 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
U85056.1-201ENST00000616429 KIF14Q15058 1648 aa39.84■■■■□ 3.97
U85056.1-201ENST00000616429 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
U85056.1-201ENST00000616429 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.84■■■■□ 3.97
U85056.1-201ENST00000616429 RICTORQ6R327 1708 aa39.84■■■■□ 3.97
U85056.1-201ENST00000616429 CLIP1P30622 1438 aa39.81■■■■□ 3.96
U85056.1-201ENST00000616429 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.74■■■■□ 3.95
U85056.1-201ENST00000616429 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.74■■■■□ 3.95
U85056.1-201ENST00000616429 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.73■■■■□ 3.95
U85056.1-201ENST00000616429 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.72■■■■□ 3.95
U85056.1-201ENST00000616429 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.71■■■■□ 3.95
U85056.1-201ENST00000616429 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.7■■■■□ 3.95
U85056.1-201ENST00000616429 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
U85056.1-201ENST00000616429 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.68■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms