RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612323.4

TMEM230-210, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM230, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-210ENST00000612323 KIF27Q86VH2 1401 aa36.81■■■■□ 3.48
TMEM230-210ENST00000612323 CUL7Q14999 1698 aa36.73■■■■□ 3.47
TMEM230-210ENST00000612323 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.64■■■■□ 3.46
TMEM230-210ENST00000612323 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.6■■■■□ 3.45
TMEM230-210ENST00000612323 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.5■■■■□ 3.43
TMEM230-210ENST00000612323 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.45■■■■□ 3.42
TMEM230-210ENST00000612323 IQGAP2Q13576 1575 aa36.31■■■■□ 3.4
TMEM230-210ENST00000612323 MAPKBP1O60336 1514 aa36.27■■■■□ 3.4
TMEM230-210ENST00000612323 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.26■■■■□ 3.4
TMEM230-210ENST00000612323 PTPRGP23470 1445 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 DISP1Q96F81 1524 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.2■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 DIP2BQ9P265 1576 aa36.19■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.18■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.17■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.12■■■■□ 3.37
TMEM230-210ENST00000612323 ABCC2Q92887 1545 aa36.03■■■■□ 3.36
TMEM230-210ENST00000612323 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.03■■■■□ 3.36
TMEM230-210ENST00000612323 KIAA0556O60303 1618 aa36.01■■■■□ 3.36
TMEM230-210ENST00000612323 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36■■■■□ 3.35
TMEM230-210ENST00000612323 PRXQ9BXM0 1461 aa36■■■■□ 3.35
TMEM230-210ENST00000612323 TSPOAP1O95153 1857 aa36■■■■□ 3.35
TMEM230-210ENST00000612323 UACAQ9BZF9 1416 aa35.98■■■■□ 3.35
TMEM230-210ENST00000612323 ASXL2Q76L83 1435 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM230-210ENST00000612323 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.87■■■■□ 3.33
TMEM230-210ENST00000612323 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TMEM230-210ENST00000612323 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.33
TMEM230-210ENST00000612323 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.82■■■■□ 3.32
TMEM230-210ENST00000612323 GLI2P10070 1586 aa35.8■■■■□ 3.32
TMEM230-210ENST00000612323 KDM6BO15054 1643 aa35.75■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.72■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 GOLGA3Q08378 1498 aa35.71■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 ABCA8O94911 1581 aa35.71■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.65■■■■□ 3.3
TMEM230-210ENST00000612323 P3H3Q8IVL6 736 aa35.58■■■■□ 3.29
TMEM230-210ENST00000612323 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
TMEM230-210ENST00000612323 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.55■■■■□ 3.28
TMEM230-210ENST00000612323 SAMD9Q5K651 1589 aa35.53■■■■□ 3.28
TMEM230-210ENST00000612323 EEA1Q15075 1411 aa35.5■■■■□ 3.27
TMEM230-210ENST00000612323 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
TMEM230-210ENST00000612323 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.44■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 ATP10BO94823 1461 aa35.41■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 KCNH8Q96L42 1107 aa35.41■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 ARID3CA6NKF2 412 aa35.4■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.37■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.36■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 KIF21BO75037 1637 aa35.33■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.33■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 CD109Q6YHK3 1445 aa35.32■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.32■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.3■■■■□ 3.24
TMEM230-210ENST00000612323 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.28■■■■□ 3.24
TMEM230-210ENST00000612323 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
TMEM230-210ENST00000612323 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.17■■■■□ 3.22
TMEM230-210ENST00000612323 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.14■■■■□ 3.22
TMEM230-210ENST00000612323 ADGRL1O94910 1474 aa35.11■■■■□ 3.21
TMEM230-210ENST00000612323 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.09■■■■□ 3.21
TMEM230-210ENST00000612323 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TMEM230-210ENST00000612323 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
TMEM230-210ENST00000612323 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.04■■■■□ 3.2
TMEM230-210ENST00000612323 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
TMEM230-210ENST00000612323 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.95■■■■□ 3.19
TMEM230-210ENST00000612323 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
TMEM230-210ENST00000612323 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.89■■■■□ 3.18
TMEM230-210ENST00000612323 RAPGEF3O95398 923 aa34.88■■■■□ 3.17
TMEM230-210ENST00000612323 NEO1Q92859 1461 aa34.88■■■■□ 3.17
TMEM230-210ENST00000612323 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.17
TMEM230-210ENST00000612323 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.87■■■■□ 3.17
TMEM230-210ENST00000612323 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.86■■■■□ 3.17
TMEM230-210ENST00000612323 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.83■■■■□ 3.17
TMEM230-210ENST00000612323 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.78■■■■□ 3.16
TMEM230-210ENST00000612323 FMN1Q68DA7 1419 aa34.75■■■■□ 3.15
TMEM230-210ENST00000612323 RICTORQ6R327 1708 aa34.73■■■■□ 3.15
TMEM230-210ENST00000612323 HECW1Q76N89 1606 aa34.73■■■■□ 3.15
TMEM230-210ENST00000612323 AKNAQ7Z591 1439 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM230-210ENST00000612323 FANCAO15360 1455 aa34.7■■■■□ 3.15
TMEM230-210ENST00000612323 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
TMEM230-210ENST00000612323 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
TMEM230-210ENST00000612323 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.63■■■■□ 3.13
TMEM230-210ENST00000612323 KIF14Q15058 1648 aa34.63■■■■□ 3.13
TMEM230-210ENST00000612323 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.62■■■■□ 3.13
TMEM230-210ENST00000612323 PLCH2O75038 1416 aa34.6■■■■□ 3.13
TMEM230-210ENST00000612323 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.58■■■■□ 3.13
TMEM230-210ENST00000612323 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.56■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.55■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.55■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.55■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.52■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.49■■■■□ 3.11
TMEM230-210ENST00000612323 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.48■■■■□ 3.11
TMEM230-210ENST00000612323 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.48■■■■□ 3.11
TMEM230-210ENST00000612323 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms