RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602243.5

SAMD4B-212, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, humanhuman

TSL 3

Gene SAMD4B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4B-212ENST00000602243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.22■■■■■ 4.67
SAMD4B-212ENST00000602243 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.03■■■■■ 4.64
SAMD4B-212ENST00000602243 MAPKBP1O60336 1514 aa44.01■■■■■ 4.64
SAMD4B-212ENST00000602243 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.99■■■■■ 4.63
SAMD4B-212ENST00000602243 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.98■■■■■ 4.63
SAMD4B-212ENST00000602243 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.97■■■■■ 4.63
SAMD4B-212ENST00000602243 DIP2BQ9P265 1576 aa43.93■■■■■ 4.62
SAMD4B-212ENST00000602243 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.91■■■■■ 4.62
SAMD4B-212ENST00000602243 IGF1RP08069 1367 aa43.85■■■■■ 4.61
SAMD4B-212ENST00000602243 CUL7Q14999 1698 aa43.83■■■■■ 4.61
SAMD4B-212ENST00000602243 KIF27Q86VH2 1401 aa43.81■■■■■ 4.6
SAMD4B-212ENST00000602243 KDM6BO15054 1643 aa43.68■■■■■ 4.58
SAMD4B-212ENST00000602243 TSPOAP1O95153 1857 aa43.64■■■■■ 4.58
SAMD4B-212ENST00000602243 PTPRGP23470 1445 aa43.6■■■■■ 4.57
SAMD4B-212ENST00000602243 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.54■■■■■ 4.56
SAMD4B-212ENST00000602243 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.48■■■■■ 4.55
SAMD4B-212ENST00000602243 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.48■■■■■ 4.55
SAMD4B-212ENST00000602243 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
SAMD4B-212ENST00000602243 ABCC2Q92887 1545 aa43.47■■■■■ 4.55
SAMD4B-212ENST00000602243 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.46■■■■■ 4.55
SAMD4B-212ENST00000602243 IQGAP2Q13576 1575 aa43.42■■■■■ 4.54
SAMD4B-212ENST00000602243 ASXL2Q76L83 1435 aa43.37■■■■■ 4.53
SAMD4B-212ENST00000602243 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.34■■■■■ 4.53
SAMD4B-212ENST00000602243 GLI2P10070 1586 aa43.32■■■■■ 4.52
SAMD4B-212ENST00000602243 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.32■■■■■ 4.52
SAMD4B-212ENST00000602243 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
SAMD4B-212ENST00000602243 DISP1Q96F81 1524 aa43.26■■■■■ 4.52
SAMD4B-212ENST00000602243 UACAQ9BZF9 1416 aa43.25■■■■■ 4.51
SAMD4B-212ENST00000602243 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.13■■■■■ 4.5
SAMD4B-212ENST00000602243 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.13■■■■■ 4.5
SAMD4B-212ENST00000602243 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
SAMD4B-212ENST00000602243 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.1■■■■■ 4.49
SAMD4B-212ENST00000602243 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.07■■■■■ 4.48
SAMD4B-212ENST00000602243 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
SAMD4B-212ENST00000602243 KIAA0556O60303 1618 aa43.04■■■■■ 4.48
SAMD4B-212ENST00000602243 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
SAMD4B-212ENST00000602243 ADGRL1O94910 1474 aa43.02■■■■■ 4.48
SAMD4B-212ENST00000602243 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.97■■■■■ 4.47
SAMD4B-212ENST00000602243 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.86■■■■■ 4.45
SAMD4B-212ENST00000602243 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.81■■■■■ 4.44
SAMD4B-212ENST00000602243 GOLGA3Q08378 1498 aa42.71■■■■■ 4.43
SAMD4B-212ENST00000602243 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
SAMD4B-212ENST00000602243 ABCA8O94911 1581 aa42.69■■■■■ 4.42
SAMD4B-212ENST00000602243 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.66■■■■■ 4.42
SAMD4B-212ENST00000602243 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.65■■■■■ 4.42
SAMD4B-212ENST00000602243 CD109Q6YHK3 1445 aa42.63■■■■■ 4.42
SAMD4B-212ENST00000602243 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.61■■■■■ 4.41
SAMD4B-212ENST00000602243 KCNH8Q96L42 1107 aa42.58■■■■■ 4.41
SAMD4B-212ENST00000602243 PRXQ9BXM0 1461 aa42.53■■■■■ 4.4
SAMD4B-212ENST00000602243 KIF21BO75037 1637 aa42.37■■■■■ 4.37
SAMD4B-212ENST00000602243 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.33■■■■■ 4.37
SAMD4B-212ENST00000602243 ARID3CA6NKF2 412 aa42.31■■■■■ 4.36
SAMD4B-212ENST00000602243 ATP10BO94823 1461 aa42.3■■■■■ 4.36
SAMD4B-212ENST00000602243 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
SAMD4B-212ENST00000602243 P3H3Q8IVL6 736 aa42.26■■■■■ 4.36
SAMD4B-212ENST00000602243 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.23■■■■■ 4.35
SAMD4B-212ENST00000602243 SAMD9Q5K651 1589 aa42.17■■■■■ 4.34
SAMD4B-212ENST00000602243 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.15■■■■■ 4.34
SAMD4B-212ENST00000602243 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.11■■■■■ 4.33
SAMD4B-212ENST00000602243 NEO1Q92859 1461 aa42.06■■■■■ 4.32
SAMD4B-212ENST00000602243 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.06■■■■■ 4.32
SAMD4B-212ENST00000602243 RAPGEF3O95398 923 aa42.04■■■■■ 4.32
SAMD4B-212ENST00000602243 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.02■■■■■ 4.32
SAMD4B-212ENST00000602243 PTPRMP28827 1452 aa42.01■■■■■ 4.32
SAMD4B-212ENST00000602243 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
SAMD4B-212ENST00000602243 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
SAMD4B-212ENST00000602243 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.97■■■■■ 4.31
SAMD4B-212ENST00000602243 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SAMD4B-212ENST00000602243 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.91■■■■■ 4.3
SAMD4B-212ENST00000602243 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.86■■■■■ 4.29
SAMD4B-212ENST00000602243 MADDQ8WXG6 1647 aa41.84■■■■■ 4.29
SAMD4B-212ENST00000602243 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
SAMD4B-212ENST00000602243 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
SAMD4B-212ENST00000602243 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.79■■■■■ 4.28
SAMD4B-212ENST00000602243 FBXO41Q8TF61 875 aa41.77■■■■■ 4.28
SAMD4B-212ENST00000602243 RICTORQ6R327 1708 aa41.76■■■■■ 4.28
SAMD4B-212ENST00000602243 EEA1Q15075 1411 aa41.76■■■■■ 4.28
SAMD4B-212ENST00000602243 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
SAMD4B-212ENST00000602243 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.74■■■■■ 4.27
SAMD4B-212ENST00000602243 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
SAMD4B-212ENST00000602243 AKNAQ7Z591 1439 aa41.71■■■■■ 4.27
SAMD4B-212ENST00000602243 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.7■■■■■ 4.27
SAMD4B-212ENST00000602243 FANCAO15360 1455 aa41.69■■■■■ 4.26
SAMD4B-212ENST00000602243 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.267e-16■■■□□ 14.9
SAMD4B-212ENST00000602243 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.68■■■■■ 4.26
SAMD4B-212ENST00000602243 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
SAMD4B-212ENST00000602243 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.64■■■■■ 4.26
SAMD4B-212ENST00000602243 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.63■■■■■ 4.25
SAMD4B-212ENST00000602243 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.6■■■■■ 4.25
SAMD4B-212ENST00000602243 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.54■■■■■ 4.24
SAMD4B-212ENST00000602243 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.52■■■■■ 4.24
SAMD4B-212ENST00000602243 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.52■■■■■ 4.24
SAMD4B-212ENST00000602243 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.52■■■■■ 4.24
SAMD4B-212ENST00000602243 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
SAMD4B-212ENST00000602243 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.47■■■■■ 4.23
SAMD4B-212ENST00000602243 HECW1Q76N89 1606 aa41.44■■■■■ 4.22
SAMD4B-212ENST00000602243 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.42■■■■■ 4.22
SAMD4B-212ENST00000602243 HSPA2P54652 639 aa41.41■■■■■ 4.22
SAMD4B-212ENST00000602243 PLCH2O75038 1416 aa41.39■■■■■ 4.22
SAMD4B-212ENST00000602243 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.38■■■■■ 4.22
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