RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594965.1

GTF2F1-204, Transcript of general transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF2F1, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1-204ENST00000594965 JPH4Q96JJ6 628 aa38.15■■■■□ 3.7
GTF2F1-204ENST00000594965 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
GTF2F1-204ENST00000594965 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.12■■■■□ 3.69
GTF2F1-204ENST00000594965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.96■■■■□ 3.67
GTF2F1-204ENST00000594965 IQGAP2Q13576 1575 aa37.88■■■■□ 3.65
GTF2F1-204ENST00000594965 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
GTF2F1-204ENST00000594965 PRXQ9BXM0 1461 aa37.78■■■■□ 3.64
GTF2F1-204ENST00000594965 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.73■■■■□ 3.63
GTF2F1-204ENST00000594965 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.68■■■■□ 3.62
GTF2F1-204ENST00000594965 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.67■■■■□ 3.62
GTF2F1-204ENST00000594965 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.66■■■■□ 3.62
GTF2F1-204ENST00000594965 DISP1Q96F81 1524 aa37.66■■■■□ 3.62
GTF2F1-204ENST00000594965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.6■■■■□ 3.61
GTF2F1-204ENST00000594965 PTPRGP23470 1445 aa37.6■■■■□ 3.61
GTF2F1-204ENST00000594965 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.59■■■■□ 3.61
GTF2F1-204ENST00000594965 EEA1Q15075 1411 aa37.56■■■■□ 3.6
GTF2F1-204ENST00000594965 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.56■■■■□ 3.6
GTF2F1-204ENST00000594965 KIAA0556O60303 1618 aa37.55■■■■□ 3.6
GTF2F1-204ENST00000594965 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.5■■■■□ 3.59
GTF2F1-204ENST00000594965 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
GTF2F1-204ENST00000594965 MAPKBP1O60336 1514 aa37.46■■■■□ 3.59
GTF2F1-204ENST00000594965 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
GTF2F1-204ENST00000594965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
GTF2F1-204ENST00000594965 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.37■■■■□ 3.57
GTF2F1-204ENST00000594965 UACAQ9BZF9 1416 aa37.36■■■■□ 3.57
GTF2F1-204ENST00000594965 GOLGA3Q08378 1498 aa37.35■■■■□ 3.57
GTF2F1-204ENST00000594965 ABCC2Q92887 1545 aa37.34■■■■□ 3.57
GTF2F1-204ENST00000594965 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.32■■■■□ 3.56
GTF2F1-204ENST00000594965 KIF21BO75037 1637 aa37.3■■■■□ 3.56
GTF2F1-204ENST00000594965 DIP2BQ9P265 1576 aa37.29■■■■□ 3.56
GTF2F1-204ENST00000594965 SAMD9Q5K651 1589 aa37.21■■■■□ 3.55
GTF2F1-204ENST00000594965 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.2■■■■□ 3.55
GTF2F1-204ENST00000594965 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.2■■■■□ 3.55
GTF2F1-204ENST00000594965 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.19■■■■□ 3.54
GTF2F1-204ENST00000594965 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
GTF2F1-204ENST00000594965 ABCA8O94911 1581 aa37.17■■■■□ 3.54
GTF2F1-204ENST00000594965 ASXL2Q76L83 1435 aa37.14■■■■□ 3.54
GTF2F1-204ENST00000594965 P3H3Q8IVL6 736 aa37.1■■■■□ 3.53
GTF2F1-204ENST00000594965 TSPOAP1O95153 1857 aa37.05■■■■□ 3.52
GTF2F1-204ENST00000594965 GLI2P10070 1586 aa37.01■■■■□ 3.52
GTF2F1-204ENST00000594965 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
GTF2F1-204ENST00000594965 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.95■■■■□ 3.51
GTF2F1-204ENST00000594965 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.5
GTF2F1-204ENST00000594965 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
GTF2F1-204ENST00000594965 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.91■■■■□ 3.5
GTF2F1-204ENST00000594965 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.9■■■■□ 3.5
GTF2F1-204ENST00000594965 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.9■■■■□ 3.5
GTF2F1-204ENST00000594965 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.89■■■■□ 3.5
GTF2F1-204ENST00000594965 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
GTF2F1-204ENST00000594965 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.86■■■■□ 3.49
GTF2F1-204ENST00000594965 ATP10BO94823 1461 aa36.83■■■■□ 3.49
GTF2F1-204ENST00000594965 ARID3CA6NKF2 412 aa36.77■■■■□ 3.48
GTF2F1-204ENST00000594965 KDM6BO15054 1643 aa36.76■■■■□ 3.48
GTF2F1-204ENST00000594965 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
GTF2F1-204ENST00000594965 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.7■■■■□ 3.47
GTF2F1-204ENST00000594965 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.69■■■■□ 3.46
GTF2F1-204ENST00000594965 KCNH8Q96L42 1107 aa36.68■■■■□ 3.46
GTF2F1-204ENST00000594965 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.6■■■■□ 3.45
GTF2F1-204ENST00000594965 CD109Q6YHK3 1445 aa36.58■■■■□ 3.45
GTF2F1-204ENST00000594965 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.55■■■■□ 3.44
GTF2F1-204ENST00000594965 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
GTF2F1-204ENST00000594965 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
GTF2F1-204ENST00000594965 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
GTF2F1-204ENST00000594965 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.53■■■■□ 3.44
GTF2F1-204ENST00000594965 FMN1Q68DA7 1419 aa36.52■■■■□ 3.44
GTF2F1-204ENST00000594965 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
GTF2F1-204ENST00000594965 HECW1Q76N89 1606 aa36.45■■■■□ 3.42
GTF2F1-204ENST00000594965 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.4■■■■□ 3.42
GTF2F1-204ENST00000594965 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.39■■■■□ 3.42
GTF2F1-204ENST00000594965 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
GTF2F1-204ENST00000594965 CLIP1P30622 1438 aa36.31■■■■□ 3.4
GTF2F1-204ENST00000594965 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.4
GTF2F1-204ENST00000594965 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
GTF2F1-204ENST00000594965 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.26■■■■□ 3.4
GTF2F1-204ENST00000594965 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.26■■■■□ 3.39
GTF2F1-204ENST00000594965 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.25■■■■□ 3.39
GTF2F1-204ENST00000594965 NEO1Q92859 1461 aa36.21■■■■□ 3.39
GTF2F1-204ENST00000594965 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.18■■■■□ 3.38
GTF2F1-204ENST00000594965 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
GTF2F1-204ENST00000594965 KIF14Q15058 1648 aa36.15■■■■□ 3.38
GTF2F1-204ENST00000594965 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.12■■■■□ 3.37
GTF2F1-204ENST00000594965 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
GTF2F1-204ENST00000594965 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
GTF2F1-204ENST00000594965 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.11■■■■□ 3.37
GTF2F1-204ENST00000594965 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.08■■■■□ 3.37
GTF2F1-204ENST00000594965 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.08■■■■□ 3.37
GTF2F1-204ENST00000594965 CEP162Q5TB80 1403 aa36.07■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.06■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 FANCAO15360 1455 aa36.06■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.06■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 AKNAQ7Z591 1439 aa36.04■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 PLCH2O75038 1416 aa36.03■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.03■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 RAPGEF3O95398 923 aa36.02■■■■□ 3.36
GTF2F1-204ENST00000594965 RICTORQ6R327 1708 aa36■■■■□ 3.35
GTF2F1-204ENST00000594965 ADGRL1O94910 1474 aa35.96■■■■□ 3.35
GTF2F1-204ENST00000594965 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
GTF2F1-204ENST00000594965 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.92■■■■□ 3.34
GTF2F1-204ENST00000594965 PREX2Q70Z35 1606 aa35.84■■■■□ 3.33
GTF2F1-204ENST00000594965 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms