RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 PBRM1Q86U86 1689 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 GRIN2AQ12879 1464 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 TOP2BQ02880 1626 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-209ENST00000590049 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-209ENST00000590049 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-209ENST00000590049 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CERKQ8TCT0 537 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 JPH4Q96JJ6 628 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAMTS12P58397 1594 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CUX1P39880 1505 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 GLI2P10070 1586 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPRMP28827 1452 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-209ENST00000590049 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-209ENST00000590049 ASXL2Q76L83 1435 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC2Q92887 1545 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF21BO75037 1637 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 HSPA2P54652 639 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPRGP23470 1445 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-209ENST00000590049 CUL7Q14999 1698 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-209ENST00000590049 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-209ENST00000590049 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-209ENST00000590049 MADDQ8WXG6 1647 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-209ENST00000590049 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-209ENST00000590049 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-209ENST00000590049 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-209ENST00000590049 CD109Q6YHK3 1445 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-209ENST00000590049 UACAQ9BZF9 1416 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-209ENST00000590049 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-209ENST00000590049 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-209ENST00000590049 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-209ENST00000590049 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNH8Q96L42 1107 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-209ENST00000590049 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-209ENST00000590049 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-209ENST00000590049 STRCQ7RTU9 1775 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-209ENST00000590049 RAPGEF3O95398 923 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPRTO14522 1441 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 DISP1Q96F81 1524 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 FANCAO15360 1455 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 IQGAP2Q13576 1575 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 HSPA1LP34931 641 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 IGF1RP08069 1367 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 NEO1Q92859 1461 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 MLECQ14165 292 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 AKNAQ7Z591 1439 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA0556O60303 1618 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 PIP4K2BP78356 416 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 NCOA1Q15788 1441 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF27Q86VH2 1401 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.27■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA8O94911 1581 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 RICTORQ6R327 1708 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 TOM1O60784 492 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms