RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.75■■□□□ 1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 GRIN2AQ12879 1464 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 TOP2BQ02880 1626 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-209ENST00000590049 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-209ENST00000590049 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-209ENST00000590049 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CERKQ8TCT0 537 aa21.53■■□□□ 1.04
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CAPNS1-209ENST00000590049 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC2Q92887 1545 aa21.2■□□□□ 0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-209ENST00000590049 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
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CAPNS1-209ENST00000590049 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-209ENST00000590049 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-209ENST00000590049 CD109Q6YHK3 1445 aa20.88■□□□□ 0.93
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CAPNS1-209ENST00000590049 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-209ENST00000590049 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-209ENST00000590049 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-209ENST00000590049 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.81■□□□□ 0.92
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CAPNS1-209ENST00000590049 FANCAO15360 1455 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 IQGAP2Q13576 1575 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.49■□□□□ 0.87
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CAPNS1-209ENST00000590049 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.32■□□□□ 0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 NCOA1Q15788 1441 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF27Q86VH2 1401 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.27■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA8O94911 1581 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 RICTORQ6R327 1708 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 TOM1O60784 492 aa20.22■□□□□ 0.83
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