RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC9O60706 1549 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-209ENST00000590049 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-209ENST00000590049 NACADO15069 1562 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-209ENST00000590049 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-209ENST00000590049 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-209ENST00000590049 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-209ENST00000590049 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-209ENST00000590049 CUX2O14529 1486 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-209ENST00000590049 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM41Q8WV44 630 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-209ENST00000590049 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-209ENST00000590049 ERCC6Q03468 1493 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-209ENST00000590049 SCRIBQ14160 1630 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-209ENST00000590049 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-209ENST00000590049 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-209ENST00000590049 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-209ENST00000590049 NESP48681 1621 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-209ENST00000590049 NCAPD3P42695 1498 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-209ENST00000590049 OSCARQ8IYS5 282 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-209ENST00000590049 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-209ENST00000590049 SMARCA2P51531 1590 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 HMGXB3Q12766 1538 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGEF11O15085 1522 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR62O43379 1518 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 SMARCA4P51532 1647 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 ARAP1Q96P48 1450 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-209ENST00000590049 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-209ENST00000590049 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-209ENST00000590049 IFT140Q96RY7 1462 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 CHD1O14646 1710 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 FBLN2P98095 1184 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 CFTRP13569 1480 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-209ENST00000590049 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.28e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXO41Q8TF61 875 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-209ENST00000590049 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-209ENST00000590049 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-209ENST00000590049 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-209ENST00000590049 TOPBP1Q92547 1522 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-209ENST00000590049 SYNJ1O43426 1573 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-209ENST00000590049 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-209ENST00000590049 SOCS7O14512 581 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-209ENST00000590049 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-209ENST00000590049 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-209ENST00000590049 WIZO95785 1651 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC8Q09428 1581 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-209ENST00000590049 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-209ENST00000590049 PRDM2Q13029 1718 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-209ENST00000590049 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-209ENST00000590049 KDM6BO15054 1643 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-209ENST00000590049 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-209ENST00000590049 ADGRL1O94910 1474 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-209ENST00000590049 ILDR2Q71H61 639 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-209ENST00000590049 SYNJ2O15056 1496 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-209ENST00000590049 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-209ENST00000590049 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR97A6NE52 1622 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-209ENST00000590049 GRIN2BQ13224 1484 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-209ENST00000590049 SOGA1O94964 1423 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-209ENST00000590049 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-209ENST00000590049 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-209ENST00000590049 DIP2BQ9P265 1576 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP170Q5SW79 1584 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-209ENST00000590049 MAPKBP1O60336 1514 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-209ENST00000590049 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TSPOAP1O95153 1857 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 SHROOM2Q13796 1616 aa21.77■■□□□ 1.08
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