RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.34	■■■□□ 2.29
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TNNI3-208	ENST00000589864	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TNNI3-208	ENST00000589864	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TNNI3-208	ENST00000589864	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TNNI3-208	ENST00000589864	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TNNI3-208	ENST00000589864	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TNNI3-208	ENST00000589864	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TNNI3-208	ENST00000589864	IGF1R	P08069	1367 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TNNI3-208	ENST00000589864	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CUL7	Q14999	1698 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TNNI3-208	ENST00000589864	KDM6B	O15054	1643 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TNNI3-208	ENST00000589864	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TSPOAP1	O95153	1857 aa		29	■■■□□ 2.23
TNNI3-208	ENST00000589864	PTPRG	P23470	1445 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TNNI3-208	ENST00000589864	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TNNI3-208	ENST00000589864	GLI2	P10070	1586 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TNNI3-208	ENST00000589864	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TNNI3-208	ENST00000589864	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TNNI3-208	ENST00000589864	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TNNI3-208	ENST00000589864	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TNNI3-208	ENST00000589864	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TNNI3-208	ENST00000589864	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TNNI3-208	ENST00000589864	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.17
TNNI3-208	ENST00000589864	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TNNI3-208	ENST00000589864	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
TNNI3-208	ENST00000589864	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TNNI3-208	ENST00000589864	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TNNI3-208	ENST00000589864	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TNNI3-208	ENST00000589864	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TNNI3-208	ENST00000589864	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TNNI3-208	ENST00000589864	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
TNNI3-208	ENST00000589864	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TNNI3-208	ENST00000589864	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TNNI3-208	ENST00000589864	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TNNI3-208	ENST00000589864	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TNNI3-208	ENST00000589864	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TNNI3-208	ENST00000589864	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TNNI3-208	ENST00000589864	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.34	■■■□□ 2.13
TNNI3-208	ENST00000589864	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.33	■■■□□ 2.13
TNNI3-208	ENST00000589864	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.33	■■■□□ 2.13
TNNI3-208	ENST00000589864	ABCA8	O94911	1581 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
TNNI3-208	ENST00000589864	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TNNI3-208	ENST00000589864	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TNNI3-208	ENST00000589864	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TNNI3-208	ENST00000589864	KIF21B	O75037	1637 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TNNI3-208	ENST00000589864	ATP10B	O94823	1461 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TNNI3-208	ENST00000589864	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.05	■■■□□ 2.08
TNNI3-208	ENST00000589864	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TNNI3-208	ENST00000589864	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TNNI3-208	ENST00000589864	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TNNI3-208	ENST00000589864	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TNNI3-208	ENST00000589864	PTPRM	P28827	1452 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TNNI3-208	ENST00000589864	FBXO41	Q8TF61	875 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TNNI3-208	ENST00000589864	NEO1	Q92859	1461 aa		27.95	■■■□□ 2.07
TNNI3-208	ENST00000589864	SAMD9	Q5K651	1589 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TNNI3-208	ENST00000589864	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TNNI3-208	ENST00000589864	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TNNI3-208	ENST00000589864	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TNNI3-208	ENST00000589864	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TNNI3-208	ENST00000589864	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TNNI3-208	ENST00000589864	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TNNI3-208	ENST00000589864	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TNNI3-208	ENST00000589864	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TNNI3-208	ENST00000589864	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TNNI3-208	ENST00000589864	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TNNI3-208	ENST00000589864	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TNNI3-208	ENST00000589864	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TNNI3-208	ENST00000589864	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TNNI3-208	ENST00000589864	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TNNI3-208	ENST00000589864	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TNNI3-208	ENST00000589864	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TNNI3-208	ENST00000589864	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TNNI3-208	ENST00000589864	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TNNI3-208	ENST00000589864	FANCA	O15360	1455 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TNNI3-208	ENST00000589864	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TNNI3-208	ENST00000589864	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TNNI3-208	ENST00000589864	EEA1	Q15075	1411 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TNNI3-208	ENST00000589864	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TNNI3-208	ENST00000589864	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.64	■■■□□ 2.02
TNNI3-208	ENST00000589864	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TNNI3-208	ENST00000589864	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TNNI3-208	ENST00000589864	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TNNI3-208	ENST00000589864	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.57	■■■□□ 2
TNNI3-208	ENST00000589864	HSPA2	P54652	639 aa		27.57	■■■□□ 2
TNNI3-208	ENST00000589864	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.56	■■■□□ 2
TNNI3-208	ENST00000589864	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.56	■■■□□ 2
TNNI3-208	ENST00000589864	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.52	■■■□□ 2
TNNI3-208	ENST00000589864	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TNNI3-208	ENST00000589864	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TNNI3-208	ENST00000589864	PLCH2	O75038	1416 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TNNI3-208	ENST00000589864	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TNNI3-208	ENST00000589864	MLEC	Q14165	292 aa		27.48	■■□□□ 1.99

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