RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.58■■■■□ 3.13
GIPC1-211ENST00000589631 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
GIPC1-211ENST00000589631 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.53■■■■□ 3.12
GIPC1-211ENST00000589631 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
GIPC1-211ENST00000589631 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.33■■■■□ 3.09
GIPC1-211ENST00000589631 IQGAP2Q13576 1575 aa34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-211ENST00000589631 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.17■■■■□ 3.06
GIPC1-211ENST00000589631 PRXQ9BXM0 1461 aa34.11■■■■□ 3.05
GIPC1-211ENST00000589631 PTPRGP23470 1445 aa34.1■■■■□ 3.05
GIPC1-211ENST00000589631 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.09■■■■□ 3.05
GIPC1-211ENST00000589631 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.08■■■■□ 3.05
GIPC1-211ENST00000589631 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.08■■■■□ 3.05
GIPC1-211ENST00000589631 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-211ENST00000589631 DISP1Q96F81 1524 aa34.04■■■■□ 3.04
GIPC1-211ENST00000589631 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.03■■■■□ 3.04
GIPC1-211ENST00000589631 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-211ENST00000589631 MAPKBP1O60336 1514 aa33.97■■■■□ 3.03
GIPC1-211ENST00000589631 EEA1Q15075 1411 aa33.95■■■■□ 3.02
GIPC1-211ENST00000589631 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.94■■■■□ 3.02
GIPC1-211ENST00000589631 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
GIPC1-211ENST00000589631 KIAA0556O60303 1618 aa33.91■■■■□ 3.02
GIPC1-211ENST00000589631 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.87■■■■□ 3.01
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.87■■■■□ 3.01
GIPC1-211ENST00000589631 UACAQ9BZF9 1416 aa33.86■■■■□ 3.01
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC2Q92887 1545 aa33.84■■■■□ 3.01
GIPC1-211ENST00000589631 GOLGA3Q08378 1498 aa33.84■■■■□ 3.01
GIPC1-211ENST00000589631 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.81■■■■□ 3
GIPC1-211ENST00000589631 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.79■■■■□ 3
GIPC1-211ENST00000589631 DIP2BQ9P265 1576 aa33.77■■■■□ 3
GIPC1-211ENST00000589631 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
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GIPC1-211ENST00000589631 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.67■■■□□ 2.98
GIPC1-211ENST00000589631 ASXL2Q76L83 1435 aa33.66■■■□□ 2.98
GIPC1-211ENST00000589631 KIF21BO75037 1637 aa33.61■■■□□ 2.97
GIPC1-211ENST00000589631 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
GIPC1-211ENST00000589631 ABCA8O94911 1581 aa33.59■■■□□ 2.97
GIPC1-211ENST00000589631 SAMD9Q5K651 1589 aa33.55■■■□□ 2.96
GIPC1-211ENST00000589631 GLI2P10070 1586 aa33.55■■■□□ 2.96
GIPC1-211ENST00000589631 P3H3Q8IVL6 736 aa33.53■■■□□ 2.96
GIPC1-211ENST00000589631 TSPOAP1O95153 1857 aa33.52■■■□□ 2.96
GIPC1-211ENST00000589631 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
GIPC1-211ENST00000589631 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.42■■■□□ 2.94
GIPC1-211ENST00000589631 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
GIPC1-211ENST00000589631 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
GIPC1-211ENST00000589631 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.36■■■□□ 2.93
GIPC1-211ENST00000589631 KDM6BO15054 1643 aa33.35■■■□□ 2.93
GIPC1-211ENST00000589631 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.33■■■□□ 2.93
GIPC1-211ENST00000589631 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
GIPC1-211ENST00000589631 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.32■■■□□ 2.92
GIPC1-211ENST00000589631 ATP10BO94823 1461 aa33.31■■■□□ 2.92
GIPC1-211ENST00000589631 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.3■■■□□ 2.92
GIPC1-211ENST00000589631 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.25■■■□□ 2.91
GIPC1-211ENST00000589631 KCNH8Q96L42 1107 aa33.25■■■□□ 2.91
GIPC1-211ENST00000589631 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.25■■■□□ 2.91
GIPC1-211ENST00000589631 ARID3CA6NKF2 412 aa33.23■■■□□ 2.91
GIPC1-211ENST00000589631 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.21■■■□□ 2.91
GIPC1-211ENST00000589631 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
GIPC1-211ENST00000589631 CD109Q6YHK3 1445 aa33.18■■■□□ 2.9
GIPC1-211ENST00000589631 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.15■■■□□ 2.9
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GIPC1-211ENST00000589631 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.09■■■□□ 2.89
GIPC1-211ENST00000589631 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
GIPC1-211ENST00000589631 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
GIPC1-211ENST00000589631 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.05■■■□□ 2.88
GIPC1-211ENST00000589631 FMN1Q68DA7 1419 aa33.04■■■□□ 2.88
GIPC1-211ENST00000589631 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.02■■■□□ 2.88
GIPC1-211ENST00000589631 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.91■■■□□ 2.86
GIPC1-211ENST00000589631 HECW1Q76N89 1606 aa32.91■■■□□ 2.86
GIPC1-211ENST00000589631 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
GIPC1-211ENST00000589631 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.88■■■□□ 2.85
GIPC1-211ENST00000589631 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
GIPC1-211ENST00000589631 NEO1Q92859 1461 aa32.83■■■□□ 2.85
GIPC1-211ENST00000589631 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.8■■■□□ 2.84
GIPC1-211ENST00000589631 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
GIPC1-211ENST00000589631 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
GIPC1-211ENST00000589631 CLIP1P30622 1438 aa32.75■■■□□ 2.83
GIPC1-211ENST00000589631 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.73■■■□□ 2.83
GIPC1-211ENST00000589631 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.73■■■□□ 2.83
GIPC1-211ENST00000589631 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.72■■■□□ 2.83
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GIPC1-211ENST00000589631 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.67■■■□□ 2.82
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GIPC1-211ENST00000589631 RAPGEF3O95398 923 aa32.66■■■□□ 2.82
GIPC1-211ENST00000589631 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
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GIPC1-211ENST00000589631 ADGRL1O94910 1474 aa32.64■■■□□ 2.82
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.64■■■□□ 2.82
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GIPC1-211ENST00000589631 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.58■■■□□ 2.81
GIPC1-211ENST00000589631 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
GIPC1-211ENST00000589631 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.57■■■□□ 2.81
GIPC1-211ENST00000589631 RICTORQ6R327 1708 aa32.54■■■□□ 2.8
GIPC1-211ENST00000589631 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.52■■■□□ 2.8
GIPC1-211ENST00000589631 CEP162Q5TB80 1403 aa32.49■■■□□ 2.79
GIPC1-211ENST00000589631 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.45■■■□□ 2.79
GIPC1-211ENST00000589631 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.42■■■□□ 2.78
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.41■■■□□ 2.78
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