RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 CUL7Q14999 1698 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP170Q5SW79 1584 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF11O15085 1522 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP160Q12769 1436 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-211ENST00000588374 JPH4Q96JJ6 628 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-211ENST00000588374 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-211ENST00000588374 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-211ENST00000588374 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 ARAP1Q96P48 1450 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 SHROOM2Q13796 1616 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 EEA1Q15075 1411 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 PRXQ9BXM0 1461 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-211ENST00000588374 IQGAP2Q13576 1575 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-211ENST00000588374 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-211ENST00000588374 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-211ENST00000588374 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-211ENST00000588374 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 P3H3Q8IVL6 736 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRGP23470 1445 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF21BO75037 1637 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 DISP1Q96F81 1524 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0556O60303 1618 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA3Q08378 1498 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-211ENST00000588374 UACAQ9BZF9 1416 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SAMD9Q5K651 1589 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ARID3CA6NKF2 412 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC2Q92887 1545 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA8O94911 1581 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPKBP1O60336 1514 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNH8Q96L42 1107 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 ASXL2Q76L83 1435 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPOAP1O95153 1857 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP10BO94823 1461 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-211ENST00000588374 DIP2BQ9P265 1576 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-211ENST00000588374 CLIP1P30622 1438 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-211ENST00000588374 FMN1Q68DA7 1419 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-211ENST00000588374 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-211ENST00000588374 GLI2P10070 1586 aa10.9□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP162Q5TB80 1403 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 HECW1Q76N89 1606 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CD109Q6YHK3 1445 aa10.85□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM6BO15054 1643 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-211ENST00000588374 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-211ENST00000588374 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-211ENST00000588374 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF14Q15058 1648 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 RAPGEF3O95398 923 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 APLP2Q06481 763 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 PLCH2O75038 1416 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 AKNAQ7Z591 1439 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms