RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 SHROOM2Q13796 1616 aa51.77■■■■■ 5.88
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGEF11O15085 1522 aa51.76■■■■■ 5.88
GIPC1-205ENST00000586027 JPH4Q96JJ6 628 aa51.71■■■■■ 5.87
GIPC1-205ENST00000586027 EHMT2Q96KQ7 1210 aa51.7■■■■■ 5.87
GIPC1-205ENST00000586027 IQGAP2Q13576 1575 aa51.69■■■■■ 5.87
GIPC1-205ENST00000586027 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.69■■■■■ 5.86
GIPC1-205ENST00000586027 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.69■■■■■ 5.86
GIPC1-205ENST00000586027 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.69■■■■■ 5.86
GIPC1-205ENST00000586027 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.66■■■■■ 5.86
GIPC1-205ENST00000586027 GOLGA3Q08378 1498 aa51.64■■■■■ 5.86
GIPC1-205ENST00000586027 ERCC6L2Q5T890 1561 aa51.62■■■■■ 5.85
GIPC1-205ENST00000586027 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP51.58■■■■■ 5.85
GIPC1-205ENST00000586027 UGGT2Q9NYU1 1516 aa51.45■■■■■ 5.83
GIPC1-205ENST00000586027 UBTFP17480 764 aaKnown RBP51.44■■■■■ 5.82
GIPC1-205ENST00000586027 ARAP1Q96P48 1450 aa51.43■■■■■ 5.82
GIPC1-205ENST00000586027 DISP1Q96F81 1524 aa51.35■■■■■ 5.81
GIPC1-205ENST00000586027 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa51.27■■■■■ 5.8
GIPC1-205ENST00000586027 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.24■■■■■ 5.79
GIPC1-205ENST00000586027 KIAA0556O60303 1618 aa51.22■■■■■ 5.79
GIPC1-205ENST00000586027 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP51.19■■■■■ 5.79
GIPC1-205ENST00000586027 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa51.15■■■■■ 5.78
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GIPC1-205ENST00000586027 SAMD9Q5K651 1589 aa51.09■■■■■ 5.77
GIPC1-205ENST00000586027 P3H3Q8IVL6 736 aa51.03■■■■■ 5.76
GIPC1-205ENST00000586027 PTPRGP23470 1445 aa51.02■■■■■ 5.76
GIPC1-205ENST00000586027 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP51.02■■■■■ 5.76
GIPC1-205ENST00000586027 EFCAB5A4FU69 1503 aa50.93■■■■■ 5.74
GIPC1-205ENST00000586027 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.88■■■■■ 5.73
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa50.87■■■■■ 5.73
GIPC1-205ENST00000586027 CLIP1P30622 1438 aa50.74■■■■■ 5.71
GIPC1-205ENST00000586027 ADCY10Q96PN6 1610 aa50.73■■■■■ 5.71
GIPC1-205ENST00000586027 UACAQ9BZF9 1416 aa50.71■■■■■ 5.71
GIPC1-205ENST00000586027 PLB1Q6P1J6 1458 aa50.7■■■■■ 5.71
GIPC1-205ENST00000586027 CEP162Q5TB80 1403 aa50.69■■■■■ 5.71
GIPC1-205ENST00000586027 ABCA8O94911 1581 aa50.63■■■■■ 5.7
GIPC1-205ENST00000586027 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa50.62■■■■■ 5.69
GIPC1-205ENST00000586027 ABCC2Q92887 1545 aa50.61■■■■■ 5.69
GIPC1-205ENST00000586027 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa50.46■■■■■ 5.67
GIPC1-205ENST00000586027 FMN1Q68DA7 1419 aa50.45■■■■■ 5.67
GIPC1-205ENST00000586027 KDM5BQ9UGL1 1544 aa50.38■■■■■ 5.66
GIPC1-205ENST00000586027 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP50.37■■■■■ 5.65
GIPC1-205ENST00000586027 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP50.33■■■■■ 5.65
GIPC1-205ENST00000586027 ARID3CA6NKF2 412 aa50.3■■■■■ 5.64
GIPC1-205ENST00000586027 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP50.29■■■■■ 5.64
GIPC1-205ENST00000586027 ATP10BO94823 1461 aa50.23■■■■■ 5.63
GIPC1-205ENST00000586027 MAPKBP1O60336 1514 aa50.23■■■■■ 5.63
GIPC1-205ENST00000586027 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP50.21■■■■■ 5.63
GIPC1-205ENST00000586027 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa50.18■■■■■ 5.62
GIPC1-205ENST00000586027 HECW1Q76N89 1606 aa50.15■■■■■ 5.62
GIPC1-205ENST00000586027 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP50.15■■■■■ 5.62
GIPC1-205ENST00000586027 ASXL2Q76L83 1435 aa50.13■■■■■ 5.62
GIPC1-205ENST00000586027 FYCO1Q9BQS8 1478 aa50.07■■■■■ 5.61
GIPC1-205ENST00000586027 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP50.06■■■■■ 5.6
GIPC1-205ENST00000586027 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
GIPC1-205ENST00000586027 VPS8Q8N3P4 1428 aa50.01■■■■■ 5.6
GIPC1-205ENST00000586027 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa50.01■■■■■ 5.6
GIPC1-205ENST00000586027 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP50.01■■■■■ 5.6
GIPC1-205ENST00000586027 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
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GIPC1-205ENST00000586027 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.94■■■■■ 5.58
GIPC1-205ENST00000586027 DIP2BQ9P265 1576 aa49.89■■■■■ 5.58
GIPC1-205ENST00000586027 CCDC18Q5T9S5 1454 aa49.86■■■■■ 5.57
GIPC1-205ENST00000586027 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.82■■■■■ 5.57
GIPC1-205ENST00000586027 FAM69CQ0P6D2 419 aa49.81■■■■■ 5.56
GIPC1-205ENST00000586027 PLEKHD1A6NEE1 506 aa49.78■■■■■ 5.56
GIPC1-205ENST00000586027 KCNH8Q96L42 1107 aa49.78■■■■■ 5.56
GIPC1-205ENST00000586027 GLI2P10070 1586 aa49.7■■■■■ 5.55
GIPC1-205ENST00000586027 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP49.67■■■■■ 5.54
GIPC1-205ENST00000586027 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa49.67■■■■■ 5.54
GIPC1-205ENST00000586027 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP49.61■■■■■ 5.53
GIPC1-205ENST00000586027 CFAP43Q8NDM7 1665 aa49.56■■■■■ 5.52
GIPC1-205ENST00000586027 TIAM1Q13009 1591 aa49.55■■■■■ 5.52
GIPC1-205ENST00000586027 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa49.52■■■■■ 5.52
GIPC1-205ENST00000586027 ABCA9Q8IUA7 1624 aa49.5■■■■■ 5.51
GIPC1-205ENST00000586027 KIF14Q15058 1648 aa49.49■■■■■ 5.51
GIPC1-205ENST00000586027 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP49.46■■■■■ 5.51
GIPC1-205ENST00000586027 MAP3K1Q13233 1512 aa49.45■■■■■ 5.51
GIPC1-205ENST00000586027 MTUS2Q5JR59 1369 aa49.43■■■■■ 5.5
GIPC1-205ENST00000586027 CD109Q6YHK3 1445 aa49.42■■■■■ 5.5
GIPC1-205ENST00000586027 TSPOAP1O95153 1857 aa49.42■■■■■ 5.5
GIPC1-205ENST00000586027 TTC37Q6PGP7 1564 aa49.42■■■■■ 5.5
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GIPC1-205ENST00000586027 PLCH2O75038 1416 aa49.16■■■■■ 5.46
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GIPC1-205ENST00000586027 NCOA2Q15596 1464 aa49.12■■■■■ 5.45
GIPC1-205ENST00000586027 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
GIPC1-205ENST00000586027 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP49.05■■■■■ 5.44
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GIPC1-205ENST00000586027 CCNB3Q8WWL7 1395 aa49.04■■■■■ 5.44
GIPC1-205ENST00000586027 ARAP3Q8WWN8 1544 aa49.04■■■■■ 5.44
GIPC1-205ENST00000586027 FANCAO15360 1455 aa49.03■■■■■ 5.44
GIPC1-205ENST00000586027 PREX2Q70Z35 1606 aa49.03■■■■■ 5.44
GIPC1-205ENST00000586027 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa49■■■■■ 5.44
GIPC1-205ENST00000586027 NEO1Q92859 1461 aa48.99■■■■■ 5.43
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