RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585930.5

SEPT9-211, Transcript of septin 9, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SEPT9, Length 1,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT9-211ENST00000585930 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.72■■■□□ 2.51
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SEPT9-211ENST00000585930 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.58■■■□□ 2.49
SEPT9-211ENST00000585930 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
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SEPT9-211ENST00000585930 IQGAP2Q13576 1575 aa30.31■■■□□ 2.44
SEPT9-211ENST00000585930 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.27■■■□□ 2.44
SEPT9-211ENST00000585930 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.27■■■□□ 2.44
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SEPT9-211ENST00000585930 KCNH8Q96L42 1107 aa29.76■■■□□ 2.35
SEPT9-211ENST00000585930 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.73■■■□□ 2.35
SEPT9-211ENST00000585930 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.73■■■□□ 2.35
SEPT9-211ENST00000585930 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
SEPT9-211ENST00000585930 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.68■■■□□ 2.34
SEPT9-211ENST00000585930 EEA1Q15075 1411 aa29.65■■■□□ 2.34
SEPT9-211ENST00000585930 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.64■■■□□ 2.34
SEPT9-211ENST00000585930 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.61■■■□□ 2.33
SEPT9-211ENST00000585930 SAMD9Q5K651 1589 aa29.6■■■□□ 2.33
SEPT9-211ENST00000585930 ATP10BO94823 1461 aa29.59■■■□□ 2.33
SEPT9-211ENST00000585930 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.57■■■□□ 2.32
SEPT9-211ENST00000585930 CD109Q6YHK3 1445 aa29.56■■■□□ 2.32
SEPT9-211ENST00000585930 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.56■■■□□ 2.32
SEPT9-211ENST00000585930 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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SEPT9-211ENST00000585930 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.29■■■□□ 2.28
SEPT9-211ENST00000585930 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.28■■■□□ 2.28
SEPT9-211ENST00000585930 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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SEPT9-211ENST00000585930 RAPGEF3O95398 923 aa29.26■■■□□ 2.27
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SEPT9-211ENST00000585930 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.21■■■□□ 2.27
SEPT9-211ENST00000585930 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.2■■■□□ 2.27
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SEPT9-211ENST00000585930 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.256e-6■■■■■ 38.2
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SEPT9-211ENST00000585930 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.9■■■□□ 2.22
SEPT9-211ENST00000585930 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.9■■■□□ 2.22
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SEPT9-211ENST00000585930 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SEPT9-211ENST00000585930 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SEPT9-211ENST00000585930 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.84■■■□□ 2.21
SEPT9-211ENST00000585930 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.83■■■□□ 2.21
SEPT9-211ENST00000585930 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.82■■■□□ 2.2
SEPT9-211ENST00000585930 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.81■■■□□ 2.2
SEPT9-211ENST00000585930 PTPRMP28827 1452 aa28.81■■■□□ 2.2
SEPT9-211ENST00000585930 CLIP1P30622 1438 aa28.81■■■□□ 2.2
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