RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583658.1

LLGL2-222, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-222	ENST00000583658	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
LLGL2-222	ENST00000583658	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
LLGL2-222	ENST00000583658	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LLGL2-222	ENST00000583658	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LLGL2-222	ENST00000583658	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.03	■■■□□ 2.72
LLGL2-222	ENST00000583658	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32	■■■□□ 2.71
LLGL2-222	ENST00000583658	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		31.96	■■■□□ 2.71
LLGL2-222	ENST00000583658	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	31.9	■■■□□ 2.7
LLGL2-222	ENST00000583658	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		31.89	■■■□□ 2.7
LLGL2-222	ENST00000583658	PTPRG	P23470	1445 aa		31.88	■■■□□ 2.69
LLGL2-222	ENST00000583658	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		31.87	■■■□□ 2.69
LLGL2-222	ENST00000583658	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.85	■■■□□ 2.69
LLGL2-222	ENST00000583658	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		31.84	■■■□□ 2.69
LLGL2-222	ENST00000583658	PRX	Q9BXM0	1461 aa		31.8	■■■□□ 2.68
LLGL2-222	ENST00000583658	DISP1	Q96F81	1524 aa		31.8	■■■□□ 2.68
LLGL2-222	ENST00000583658	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.79	■■■□□ 2.68
LLGL2-222	ENST00000583658	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LLGL2-222	ENST00000583658	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LLGL2-222	ENST00000583658	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LLGL2-222	ENST00000583658	KIAA0556	O60303	1618 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LLGL2-222	ENST00000583658	ABCC2	Q92887	1545 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LLGL2-222	ENST00000583658	UACA	Q9BZF9	1416 aa		31.66	■■■□□ 2.66
LLGL2-222	ENST00000583658	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.66	■■■□□ 2.66
LLGL2-222	ENST00000583658	EEA1	Q15075	1411 aa		31.66	■■■□□ 2.66
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.64	■■■□□ 2.66
LLGL2-222	ENST00000583658	GOLGA3	Q08378	1498 aa		31.64	■■■□□ 2.66
LLGL2-222	ENST00000583658	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
LLGL2-222	ENST00000583658	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.62	■■■□□ 2.65
LLGL2-222	ENST00000583658	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		31.54	■■■□□ 2.64
LLGL2-222	ENST00000583658	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.54	■■■□□ 2.64
LLGL2-222	ENST00000583658	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.49	■■■□□ 2.63
LLGL2-222	ENST00000583658	GLI2	P10070	1586 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LLGL2-222	ENST00000583658	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
LLGL2-222	ENST00000583658	ABCA8	O94911	1581 aa		31.39	■■■□□ 2.62
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
LLGL2-222	ENST00000583658	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.35	■■■□□ 2.61
LLGL2-222	ENST00000583658	SAMD9	Q5K651	1589 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LLGL2-222	ENST00000583658	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
LLGL2-222	ENST00000583658	KIF21B	O75037	1637 aa		31.32	■■■□□ 2.6
LLGL2-222	ENST00000583658	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.3	■■■□□ 2.6
LLGL2-222	ENST00000583658	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.28	■■■□□ 2.6
LLGL2-222	ENST00000583658	KDM6B	O15054	1643 aa		31.28	■■■□□ 2.6
LLGL2-222	ENST00000583658	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.24	■■■□□ 2.59
LLGL2-222	ENST00000583658	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
LLGL2-222	ENST00000583658	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.19	■■■□□ 2.58
LLGL2-222	ENST00000583658	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.18	■■■□□ 2.58
LLGL2-222	ENST00000583658	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.14	■■■□□ 2.57
LLGL2-222	ENST00000583658	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LLGL2-222	ENST00000583658	ATP10B	O94823	1461 aa		31.11	■■■□□ 2.57
LLGL2-222	ENST00000583658	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
LLGL2-222	ENST00000583658	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.1	■■■□□ 2.57
LLGL2-222	ENST00000583658	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.06	■■■□□ 2.56
LLGL2-222	ENST00000583658	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.05	■■■□□ 2.56
LLGL2-222	ENST00000583658	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.03	■■■□□ 2.56
LLGL2-222	ENST00000583658	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.03	■■■□□ 2.56
LLGL2-222	ENST00000583658	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
LLGL2-222	ENST00000583658	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
LLGL2-222	ENST00000583658	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
LLGL2-222	ENST00000583658	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	30.95	■■■□□ 2.55
LLGL2-222	ENST00000583658	ARID3C	A6NKF2	412 aa		30.95	■■■□□ 2.55
LLGL2-222	ENST00000583658	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		30.91	■■■□□ 2.54
LLGL2-222	ENST00000583658	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	30.88	■■■□□ 2.53
LLGL2-222	ENST00000583658	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	30.88	■■■□□ 2.53
LLGL2-222	ENST00000583658	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		30.85	■■■□□ 2.53
LLGL2-222	ENST00000583658	FMN1	Q68DA7	1419 aa		30.84	■■■□□ 2.53
LLGL2-222	ENST00000583658	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		30.82	■■■□□ 2.52
LLGL2-222	ENST00000583658	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		30.81	■■■□□ 2.52
LLGL2-222	ENST00000583658	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.8	■■■□□ 2.52
LLGL2-222	ENST00000583658	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		30.79	■■■□□ 2.52
LLGL2-222	ENST00000583658	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		30.75	■■■□□ 2.51
LLGL2-222	ENST00000583658	NEO1	Q92859	1461 aa		30.75	■■■□□ 2.51
LLGL2-222	ENST00000583658	HECW1	Q76N89	1606 aa		30.73	■■■□□ 2.51
LLGL2-222	ENST00000583658	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	30.67	■■■□□ 2.5
LLGL2-222	ENST00000583658	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	30.63	■■■□□ 2.49
LLGL2-222	ENST00000583658	ADGRL1	O94910	1474 aa		30.63	■■■□□ 2.49
LLGL2-222	ENST00000583658	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	30.62	■■■□□ 2.49
LLGL2-222	ENST00000583658	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		30.6	■■■□□ 2.49
LLGL2-222	ENST00000583658	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	30.57	■■■□□ 2.48
LLGL2-222	ENST00000583658	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		30.57	■■■□□ 2.48
LLGL2-222	ENST00000583658	FANCA	O15360	1455 aa		30.54	■■■□□ 2.48
LLGL2-222	ENST00000583658	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		30.53	■■■□□ 2.48
LLGL2-222	ENST00000583658	AKNA	Q7Z591	1439 aa		30.52	■■■□□ 2.48
LLGL2-222	ENST00000583658	RAPGEF3	O95398	923 aa		30.5	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	30.49	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	30.49	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		30.49	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		30.49	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	PLCH2	O75038	1416 aa		30.48	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	CLIP1	P30622	1438 aa		30.47	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		30.46	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	KIF14	Q15058	1648 aa		30.46	■■■□□ 2.47
LLGL2-222	ENST00000583658	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	30.45	■■■□□ 2.46
LLGL2-222	ENST00000583658	RICTOR	Q6R327	1708 aa		30.44	■■■□□ 2.46
LLGL2-222	ENST00000583658	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		30.44	■■■□□ 2.46
LLGL2-222	ENST00000583658	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		30.42	■■■□□ 2.46
LLGL2-222	ENST00000583658	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		30.37	■■■□□ 2.45
LLGL2-222	ENST00000583658	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		30.37	■■■□□ 2.45
LLGL2-222	ENST00000583658	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		30.36	■■■□□ 2.45
LLGL2-222	ENST00000583658	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		30.34	■■■□□ 2.45
LLGL2-222	ENST00000583658	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		30.31	■■■□□ 2.44

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