RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 IQGAP2Q13576 1575 aa23.14■■□□□ 1.3
GGA3-216ENST00000583282 SHROOM2Q13796 1616 aa23.13■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 GOLGA3Q08378 1498 aa23.12■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.12■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 ARHGEF11O15085 1522 aa23.09■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.09■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.09■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.09■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.09■■□□□ 1.29
GGA3-216ENST00000583282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.06■■□□□ 1.28
GGA3-216ENST00000583282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GGA3-216ENST00000583282 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.97■■□□□ 1.27
GGA3-216ENST00000583282 JPH4Q96JJ6 628 aa22.96■■□□□ 1.27
GGA3-216ENST00000583282 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GGA3-216ENST00000583282 KIAA0556O60303 1618 aa22.94■■□□□ 1.26
GGA3-216ENST00000583282 ARAP1Q96P48 1450 aa22.93■■□□□ 1.26
GGA3-216ENST00000583282 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GGA3-216ENST00000583282 DISP1Q96F81 1524 aa22.9■■□□□ 1.26
GGA3-216ENST00000583282 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.87■■□□□ 1.25
GGA3-216ENST00000583282 SAMD9Q5K651 1589 aa22.87■■□□□ 1.25
GGA3-216ENST00000583282 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.81■■□□□ 1.24
GGA3-216ENST00000583282 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GGA3-216ENST00000583282 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.78■■□□□ 1.24
GGA3-216ENST00000583282 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.78■■□□□ 1.24
GGA3-216ENST00000583282 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.75■■□□□ 1.23
GGA3-216ENST00000583282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.75■■□□□ 1.23
GGA3-216ENST00000583282 P3H3Q8IVL6 736 aa22.75■■□□□ 1.23
GGA3-216ENST00000583282 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.73■■□□□ 1.23
GGA3-216ENST00000583282 PTPRGP23470 1445 aa22.71■■□□□ 1.23
GGA3-216ENST00000583282 CLIP1P30622 1438 aa22.69■■□□□ 1.22
GGA3-216ENST00000583282 CEP162Q5TB80 1403 aa22.69■■□□□ 1.22
GGA3-216ENST00000583282 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.68■■□□□ 1.22
GGA3-216ENST00000583282 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.63■■□□□ 1.21
GGA3-216ENST00000583282 ABCA8O94911 1581 aa22.62■■□□□ 1.21
GGA3-216ENST00000583282 ABCC2Q92887 1545 aa22.62■■□□□ 1.21
GGA3-216ENST00000583282 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.61■■□□□ 1.21
GGA3-216ENST00000583282 UACAQ9BZF9 1416 aa22.59■■□□□ 1.21
GGA3-216ENST00000583282 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
GGA3-216ENST00000583282 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
GGA3-216ENST00000583282 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
GGA3-216ENST00000583282 FMN1Q68DA7 1419 aa22.53■■□□□ 1.2
GGA3-216ENST00000583282 HECW1Q76N89 1606 aa22.51■■□□□ 1.19
GGA3-216ENST00000583282 ARID3CA6NKF2 412 aa22.48■■□□□ 1.19
GGA3-216ENST00000583282 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GGA3-216ENST00000583282 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.45■■□□□ 1.19
GGA3-216ENST00000583282 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.45■■□□□ 1.18
GGA3-216ENST00000583282 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
GGA3-216ENST00000583282 MAPKBP1O60336 1514 aa22.41■■□□□ 1.18
GGA3-216ENST00000583282 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.41■■□□□ 1.18
GGA3-216ENST00000583282 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
GGA3-216ENST00000583282 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GGA3-216ENST00000583282 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.4■■□□□ 1.18
GGA3-216ENST00000583282 ATP10BO94823 1461 aa22.37■■□□□ 1.17
GGA3-216ENST00000583282 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.37■■□□□ 1.17
GGA3-216ENST00000583282 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GGA3-216ENST00000583282 ASXL2Q76L83 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
GGA3-216ENST00000583282 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GGA3-216ENST00000583282 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GGA3-216ENST00000583282 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.32■■□□□ 1.16
GGA3-216ENST00000583282 DIP2BQ9P265 1576 aa22.31■■□□□ 1.16
GGA3-216ENST00000583282 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.31■■□□□ 1.16
GGA3-216ENST00000583282 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.3■■□□□ 1.16
GGA3-216ENST00000583282 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.29■■□□□ 1.16
GGA3-216ENST00000583282 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.23■■□□□ 1.15
GGA3-216ENST00000583282 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GGA3-216ENST00000583282 TIAM1Q13009 1591 aa22.21■■□□□ 1.15
GGA3-216ENST00000583282 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.21■■□□□ 1.15
GGA3-216ENST00000583282 KIF14Q15058 1648 aa22.19■■□□□ 1.14
GGA3-216ENST00000583282 TSPOAP1O95153 1857 aa22.17■■□□□ 1.14
GGA3-216ENST00000583282 GLI2P10070 1586 aa22.16■■□□□ 1.14
GGA3-216ENST00000583282 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GGA3-216ENST00000583282 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.15■■□□□ 1.14
GGA3-216ENST00000583282 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.15■■□□□ 1.14
GGA3-216ENST00000583282 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.14■■□□□ 1.14
GGA3-216ENST00000583282 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.14■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 KCNH8Q96L42 1107 aa22.14■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.13■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.13■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.1■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GGA3-216ENST00000583282 MAP3K1Q13233 1512 aa22.07■■□□□ 1.12
GGA3-216ENST00000583282 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.06■■□□□ 1.12
GGA3-216ENST00000583282 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.05■■□□□ 1.12
GGA3-216ENST00000583282 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GGA3-216ENST00000583282 APLP2Q06481 763 aa22.04■■□□□ 1.12
GGA3-216ENST00000583282 CD109Q6YHK3 1445 aa22.02■■□□□ 1.12
GGA3-216ENST00000583282 PREX2Q70Z35 1606 aa22■■□□□ 1.11
GGA3-216ENST00000583282 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22■■□□□ 1.11
GGA3-216ENST00000583282 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.97■■□□□ 1.11
GGA3-216ENST00000583282 NCOA2Q15596 1464 aa21.96■■□□□ 1.11
GGA3-216ENST00000583282 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.96■■□□□ 1.11
GGA3-216ENST00000583282 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GGA3-216ENST00000583282 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.95■■□□□ 1.11
GGA3-216ENST00000583282 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.94■■□□□ 1.1
GGA3-216ENST00000583282 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.94■■□□□ 1.1
GGA3-216ENST00000583282 FANCAO15360 1455 aa21.9■■□□□ 1.1
GGA3-216ENST00000583282 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.89■■□□□ 1.1
GGA3-216ENST00000583282 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.89■■□□□ 1.09
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