RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580738.5

NDEL1-209, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1 like 1, human

TSL 2

Gene NDEL1, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDEL1-209	ENST00000580738	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		34.28	■■■■□ 3.08
NDEL1-209	ENST00000580738	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		34.24	■■■■□ 3.07
NDEL1-209	ENST00000580738	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		34.23	■■■■□ 3.07
NDEL1-209	ENST00000580738	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	34.21	■■■■□ 3.07
NDEL1-209	ENST00000580738	MAPKBP1	O60336	1514 aa		34.14	■■■■□ 3.06
NDEL1-209	ENST00000580738	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		34.12	■■■■□ 3.05
NDEL1-209	ENST00000580738	DIP2B	Q9P265	1576 aa		34.11	■■■■□ 3.05
NDEL1-209	ENST00000580738	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.04	■■■■□ 3.04
NDEL1-209	ENST00000580738	IGF1R	P08069	1367 aa		34.01	■■■■□ 3.04
NDEL1-209	ENST00000580738	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.96	■■■■□ 3.03
NDEL1-209	ENST00000580738	KDM6B	O15054	1643 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NDEL1-209	ENST00000580738	KIF27	Q86VH2	1401 aa		33.89	■■■■□ 3.02
NDEL1-209	ENST00000580738	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.87	■■■■□ 3.01
NDEL1-209	ENST00000580738	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
NDEL1-209	ENST00000580738	PTPRG	P23470	1445 aa		33.86	■■■■□ 3.01
NDEL1-209	ENST00000580738	CUL7	Q14999	1698 aa		33.84	■■■■□ 3.01
NDEL1-209	ENST00000580738	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.75	■■■□□ 2.99
NDEL1-209	ENST00000580738	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.73	■■■□□ 2.99
NDEL1-209	ENST00000580738	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.73	■■■□□ 2.99
NDEL1-209	ENST00000580738	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.7	■■■□□ 2.99
NDEL1-209	ENST00000580738	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.7	■■■□□ 2.98
NDEL1-209	ENST00000580738	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.63	■■■□□ 2.97
NDEL1-209	ENST00000580738	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
NDEL1-209	ENST00000580738	GLI2	P10070	1586 aa		33.6	■■■□□ 2.97
NDEL1-209	ENST00000580738	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.6	■■■□□ 2.97
NDEL1-209	ENST00000580738	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.58	■■■□□ 2.97
NDEL1-209	ENST00000580738	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.56	■■■□□ 2.96
NDEL1-209	ENST00000580738	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.53	■■■□□ 2.96
NDEL1-209	ENST00000580738	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.96
NDEL1-209	ENST00000580738	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.5	■■■□□ 2.95
NDEL1-209	ENST00000580738	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
NDEL1-209	ENST00000580738	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
NDEL1-209	ENST00000580738	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.45	■■■□□ 2.95
NDEL1-209	ENST00000580738	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.39	■■■□□ 2.94
NDEL1-209	ENST00000580738	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.38	■■■□□ 2.93
NDEL1-209	ENST00000580738	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
NDEL1-209	ENST00000580738	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.35	■■■□□ 2.93
NDEL1-209	ENST00000580738	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.34	■■■□□ 2.93
NDEL1-209	ENST00000580738	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.31	■■■□□ 2.92
NDEL1-209	ENST00000580738	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.25	■■■□□ 2.91
NDEL1-209	ENST00000580738	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.2	■■■□□ 2.91
NDEL1-209	ENST00000580738	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.14	■■■□□ 2.9
NDEL1-209	ENST00000580738	CD109	Q6YHK3	1445 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NDEL1-209	ENST00000580738	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NDEL1-209	ENST00000580738	ABCA8	O94911	1581 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NDEL1-209	ENST00000580738	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NDEL1-209	ENST00000580738	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NDEL1-209	ENST00000580738	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NDEL1-209	ENST00000580738	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.92	■■■□□ 2.86
NDEL1-209	ENST00000580738	KIF21B	O75037	1637 aa		32.89	■■■□□ 2.86
NDEL1-209	ENST00000580738	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.88	■■■□□ 2.85
NDEL1-209	ENST00000580738	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.86	■■■□□ 2.85
NDEL1-209	ENST00000580738	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.85	■■■□□ 2.85
NDEL1-209	ENST00000580738	ATP10B	O94823	1461 aa		32.82	■■■□□ 2.84
NDEL1-209	ENST00000580738	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
NDEL1-209	ENST00000580738	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.73	■■■□□ 2.83
NDEL1-209	ENST00000580738	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.7	■■■□□ 2.83
NDEL1-209	ENST00000580738	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.7	■■■□□ 2.82
NDEL1-209	ENST00000580738	PTPRM	P28827	1452 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NDEL1-209	ENST00000580738	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.66	■■■□□ 2.82
NDEL1-209	ENST00000580738	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.65	■■■□□ 2.82
NDEL1-209	ENST00000580738	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
NDEL1-209	ENST00000580738	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
NDEL1-209	ENST00000580738	NEO1	Q92859	1461 aa		32.61	■■■□□ 2.81
NDEL1-209	ENST00000580738	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NDEL1-209	ENST00000580738	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.57	■■■□□ 2.8
NDEL1-209	ENST00000580738	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
NDEL1-209	ENST00000580738	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.55	■■■□□ 2.8
NDEL1-209	ENST00000580738	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NDEL1-209	ENST00000580738	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.51	■■■□□ 2.8
NDEL1-209	ENST00000580738	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
NDEL1-209	ENST00000580738	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.49	■■■□□ 2.79
NDEL1-209	ENST00000580738	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
NDEL1-209	ENST00000580738	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
NDEL1-209	ENST00000580738	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.44	■■■□□ 2.78
NDEL1-209	ENST00000580738	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.42	■■■□□ 2.78
NDEL1-209	ENST00000580738	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
NDEL1-209	ENST00000580738	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.39	■■■□□ 2.78
NDEL1-209	ENST00000580738	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.38	■■■□□ 2.77
NDEL1-209	ENST00000580738	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.37	■■■□□ 2.77
NDEL1-209	ENST00000580738	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
NDEL1-209	ENST00000580738	FANCA	O15360	1455 aa		32.34	■■■□□ 2.77
NDEL1-209	ENST00000580738	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.34	■■■□□ 2.77
NDEL1-209	ENST00000580738	HSPA2	P54652	639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
NDEL1-209	ENST00000580738	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.32	■■■□□ 2.76
NDEL1-209	ENST00000580738	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.3	■■■□□ 2.76
NDEL1-209	ENST00000580738	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.26	■■■□□ 2.76
NDEL1-209	ENST00000580738	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.24	■■■□□ 2.75
NDEL1-209	ENST00000580738	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.23	■■■□□ 2.75
NDEL1-209	ENST00000580738	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.23	■■■□□ 2.75
NDEL1-209	ENST00000580738	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.23	■■■□□ 2.75
NDEL1-209	ENST00000580738	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.22	■■■□□ 2.75
NDEL1-209	ENST00000580738	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.21	■■■□□ 2.75
NDEL1-209	ENST00000580738	MLEC	Q14165	292 aa		32.2	■■■□□ 2.75
NDEL1-209	ENST00000580738	EEA1	Q15075	1411 aa		32.18	■■■□□ 2.74
NDEL1-209	ENST00000580738	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.16	■■■□□ 2.74
NDEL1-209	ENST00000580738	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NDEL1-209	ENST00000580738	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
NDEL1-209	ENST00000580738	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.14	■■■□□ 2.74
NDEL1-209	ENST00000580738	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.13	■■■□□ 2.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms