RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575288.5

PITPNA-207, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PITPNA, Length 1,264 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNA-207ENST00000575288 JPH4Q96JJ6 628 aa46.54■■■■■ 5.04
PITPNA-207ENST00000575288 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
PITPNA-207ENST00000575288 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.46■■■■■ 5.03
PITPNA-207ENST00000575288 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.31■■■■■ 5
PITPNA-207ENST00000575288 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
PITPNA-207ENST00000575288 IQGAP2Q13576 1575 aa46.14■■■■■ 4.98
PITPNA-207ENST00000575288 PRXQ9BXM0 1461 aa46.07■■■■■ 4.97
PITPNA-207ENST00000575288 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.96■■■■■ 4.95
PITPNA-207ENST00000575288 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.95■■■■■ 4.95
PITPNA-207ENST00000575288 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.94■■■■■ 4.94
PITPNA-207ENST00000575288 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.88■■■■■ 4.94
PITPNA-207ENST00000575288 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.88■■■■■ 4.93
PITPNA-207ENST00000575288 PTPRGP23470 1445 aa45.87■■■■■ 4.93
PITPNA-207ENST00000575288 EEA1Q15075 1411 aa45.87■■■■■ 4.93
PITPNA-207ENST00000575288 DISP1Q96F81 1524 aa45.87■■■■■ 4.93
PITPNA-207ENST00000575288 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
PITPNA-207ENST00000575288 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.85■■■■■ 4.93
PITPNA-207ENST00000575288 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.82■■■■■ 4.93
PITPNA-207ENST00000575288 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
PITPNA-207ENST00000575288 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
PITPNA-207ENST00000575288 KIAA0556O60303 1618 aa45.72■■■■■ 4.91
PITPNA-207ENST00000575288 GOLGA3Q08378 1498 aa45.58■■■■■ 4.89
PITPNA-207ENST00000575288 MAPKBP1O60336 1514 aa45.57■■■■■ 4.88
PITPNA-207ENST00000575288 UACAQ9BZF9 1416 aa45.54■■■■■ 4.88
PITPNA-207ENST00000575288 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.5■■■■■ 4.87
PITPNA-207ENST00000575288 ABCC2Q92887 1545 aa45.5■■■■■ 4.87
PITPNA-207ENST00000575288 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.48■■■■■ 4.87
PITPNA-207ENST00000575288 KIF21BO75037 1637 aa45.46■■■■■ 4.87
PITPNA-207ENST00000575288 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.42■■■■■ 4.86
PITPNA-207ENST00000575288 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.39■■■■■ 4.86
PITPNA-207ENST00000575288 P3H3Q8IVL6 736 aa45.35■■■■■ 4.85
PITPNA-207ENST00000575288 DIP2BQ9P265 1576 aa45.34■■■■■ 4.85
PITPNA-207ENST00000575288 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.34■■■■■ 4.85
PITPNA-207ENST00000575288 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.3■■■■■ 4.84
PITPNA-207ENST00000575288 SAMD9Q5K651 1589 aa45.28■■■■■ 4.84
PITPNA-207ENST00000575288 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.28■■■■■ 4.84
PITPNA-207ENST00000575288 ASXL2Q76L83 1435 aa45.27■■■■■ 4.84
PITPNA-207ENST00000575288 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
PITPNA-207ENST00000575288 ABCA8O94911 1581 aa45.24■■■■■ 4.83
PITPNA-207ENST00000575288 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
PITPNA-207ENST00000575288 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
PITPNA-207ENST00000575288 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.05■■■■■ 4.8
PITPNA-207ENST00000575288 TSPOAP1O95153 1857 aa45.01■■■■■ 4.8
PITPNA-207ENST00000575288 GLI2P10070 1586 aa45■■■■■ 4.79
PITPNA-207ENST00000575288 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.99■■■■■ 4.79
PITPNA-207ENST00000575288 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
PITPNA-207ENST00000575288 ARID3CA6NKF2 412 aa44.96■■■■■ 4.79
PITPNA-207ENST00000575288 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.96■■■■■ 4.79
PITPNA-207ENST00000575288 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.93■■■■■ 4.78
PITPNA-207ENST00000575288 ATP10BO94823 1461 aa44.89■■■■■ 4.78
PITPNA-207ENST00000575288 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
PITPNA-207ENST00000575288 KCNH8Q96L42 1107 aa44.8■■■■■ 4.76
PITPNA-207ENST00000575288 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.79■■■■■ 4.76
PITPNA-207ENST00000575288 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
PITPNA-207ENST00000575288 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.77■■■■■ 4.76
PITPNA-207ENST00000575288 KDM6BO15054 1643 aa44.72■■■■■ 4.75
PITPNA-207ENST00000575288 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
PITPNA-207ENST00000575288 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
PITPNA-207ENST00000575288 CD109Q6YHK3 1445 aa44.6■■■■■ 4.73
PITPNA-207ENST00000575288 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.59■■■■■ 4.73
PITPNA-207ENST00000575288 FMN1Q68DA7 1419 aa44.59■■■■■ 4.73
PITPNA-207ENST00000575288 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.59■■■■■ 4.73
PITPNA-207ENST00000575288 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.5■■■■■ 4.71
PITPNA-207ENST00000575288 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
PITPNA-207ENST00000575288 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
PITPNA-207ENST00000575288 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
PITPNA-207ENST00000575288 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.45■■■■■ 4.71
PITPNA-207ENST00000575288 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.44■■■■■ 4.7
PITPNA-207ENST00000575288 HECW1Q76N89 1606 aa44.42■■■■■ 4.7
PITPNA-207ENST00000575288 CLIP1P30622 1438 aa44.38■■■■■ 4.69
PITPNA-207ENST00000575288 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
PITPNA-207ENST00000575288 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.23■■■■■ 4.67
PITPNA-207ENST00000575288 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.21■■■■■ 4.67
PITPNA-207ENST00000575288 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.2■■■■■ 4.67
PITPNA-207ENST00000575288 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
PITPNA-207ENST00000575288 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.15■■■■■ 4.66
PITPNA-207ENST00000575288 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.14■■■■■ 4.66
PITPNA-207ENST00000575288 NEO1Q92859 1461 aa44.11■■■■■ 4.65
PITPNA-207ENST00000575288 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.11■■■■■ 4.65
PITPNA-207ENST00000575288 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.1■■■■■ 4.65
PITPNA-207ENST00000575288 CEP162Q5TB80 1403 aa44.09■■■■■ 4.65
PITPNA-207ENST00000575288 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.08■■■■■ 4.65
PITPNA-207ENST00000575288 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
PITPNA-207ENST00000575288 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.06■■■■■ 4.64
PITPNA-207ENST00000575288 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
PITPNA-207ENST00000575288 KIF14Q15058 1648 aa44■■■■■ 4.63
PITPNA-207ENST00000575288 FANCAO15360 1455 aa43.99■■■■■ 4.63
PITPNA-207ENST00000575288 RAPGEF3O95398 923 aa43.96■■■■■ 4.63
PITPNA-207ENST00000575288 PLCH2O75038 1416 aa43.93■■■■■ 4.62
PITPNA-207ENST00000575288 AKNAQ7Z591 1439 aa43.93■■■■■ 4.62
PITPNA-207ENST00000575288 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.92■■■■■ 4.62
PITPNA-207ENST00000575288 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.91■■■■■ 4.62
PITPNA-207ENST00000575288 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.87■■■■■ 4.61
PITPNA-207ENST00000575288 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.85■■■■■ 4.61
PITPNA-207ENST00000575288 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
PITPNA-207ENST00000575288 ADGRL1O94910 1474 aa43.76■■■■■ 4.6
PITPNA-207ENST00000575288 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.76■■■■■ 4.6
PITPNA-207ENST00000575288 RICTORQ6R327 1708 aa43.75■■■■■ 4.59
PITPNA-207ENST00000575288 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.72■■■■■ 4.59
PITPNA-207ENST00000575288 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms