RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-207ENST00000572043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.12■■■□□ 2.41
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-207ENST00000572043 IQGAP2Q13576 1575 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-207ENST00000572043 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTPRGP23470 1445 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRXQ9BXM0 1461 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-207ENST00000572043 DISP1Q96F81 1524 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1-207ENST00000572043 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.83■■■□□ 2.37
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 EEA1Q15075 1411 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA0556O60303 1618 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 UACAQ9BZF9 1416 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAPKBP1O60336 1514 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCC2Q92887 1545 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 GOLGA3Q08378 1498 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 P3H3Q8IVL6 736 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.6■■■□□ 2.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 DIP2BQ9P265 1576 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASXL2Q76L83 1435 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF21BO75037 1637 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARID3CA6NKF2 412 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCA8O94911 1581 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 SAMD9Q5K651 1589 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 TSPOAP1O95153 1857 aa29.32■■■□□ 2.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.32■■■□□ 2.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 GLI2P10070 1586 aa29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNH8Q96L42 1107 aa29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP10BO94823 1461 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM6BO15054 1643 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD109Q6YHK3 1445 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29■■■□□ 2.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29■■■□□ 2.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 FMN1Q68DA7 1419 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 HECW1Q76N89 1606 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLIP1P30622 1438 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.23e-9■■□□□ 12.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEO1Q92859 1461 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAPGEF3O95398 923 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 FANCAO15360 1455 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 AKNAQ7Z591 1439 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRL1O94910 1474 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF14Q15058 1648 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLCH2O75038 1416 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 CEP162Q5TB80 1403 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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