RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF27Q86VH2 1401 aa37.13■■■■□ 3.53
SLC12A4-208ENST00000572010 IGF1RP08069 1367 aa37.13■■■■□ 3.53
SLC12A4-208ENST00000572010 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.1■■■■□ 3.53
SLC12A4-208ENST00000572010 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.03■■■■□ 3.52
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.97■■■■□ 3.51
SLC12A4-208ENST00000572010 CUL7Q14999 1698 aa36.96■■■■□ 3.51
SLC12A4-208ENST00000572010 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.9■■■■□ 3.5
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.86■■■■□ 3.49
SLC12A4-208ENST00000572010 MAPKBP1O60336 1514 aa36.82■■■■□ 3.48
SLC12A4-208ENST00000572010 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.81■■■■□ 3.48
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPRGP23470 1445 aa36.78■■■■□ 3.48
SLC12A4-208ENST00000572010 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
SLC12A4-208ENST00000572010 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.74■■■■□ 3.47
SLC12A4-208ENST00000572010 DIP2BQ9P265 1576 aa36.68■■■■□ 3.46
SLC12A4-208ENST00000572010 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.67■■■■□ 3.46
SLC12A4-208ENST00000572010 IQGAP2Q13576 1575 aa36.59■■■■□ 3.45
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCC2Q92887 1545 aa36.52■■■■□ 3.44
SLC12A4-208ENST00000572010 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.51■■■■□ 3.44
SLC12A4-208ENST00000572010 KDM6BO15054 1643 aa36.45■■■■□ 3.43
SLC12A4-208ENST00000572010 UACAQ9BZF9 1416 aa36.45■■■■□ 3.43
SLC12A4-208ENST00000572010 TSPOAP1O95153 1857 aa36.45■■■■□ 3.43
SLC12A4-208ENST00000572010 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.43■■■■□ 3.42
SLC12A4-208ENST00000572010 ASXL2Q76L83 1435 aa36.43■■■■□ 3.42
SLC12A4-208ENST00000572010 DISP1Q96F81 1524 aa36.43■■■■□ 3.42
SLC12A4-208ENST00000572010 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.43■■■■□ 3.42
SLC12A4-208ENST00000572010 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC12A4-208ENST00000572010 GLI2P10070 1586 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC12A4-208ENST00000572010 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.26■■■■□ 3.4
SLC12A4-208ENST00000572010 KIAA0556O60303 1618 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC12A4-208ENST00000572010 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC12A4-208ENST00000572010 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SLC12A4-208ENST00000572010 GOLGA3Q08378 1498 aa36.14■■■■□ 3.38
SLC12A4-208ENST00000572010 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
SLC12A4-208ENST00000572010 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
SLC12A4-208ENST00000572010 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC12A4-208ENST00000572010 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
SLC12A4-208ENST00000572010 PRXQ9BXM0 1461 aa36.05■■■■□ 3.36
SLC12A4-208ENST00000572010 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC12A4-208ENST00000572010 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNH8Q96L42 1107 aa36.01■■■■□ 3.36
SLC12A4-208ENST00000572010 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCA8O94911 1581 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC12A4-208ENST00000572010 P3H3Q8IVL6 736 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC12A4-208ENST00000572010 CD109Q6YHK3 1445 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC12A4-208ENST00000572010 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC12A4-208ENST00000572010 ADGRL1O94910 1474 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC12A4-208ENST00000572010 ARID3CA6NKF2 412 aa35.81■■■■□ 3.32
SLC12A4-208ENST00000572010 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.8■■■■□ 3.32
SLC12A4-208ENST00000572010 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.77■■■■□ 3.32
SLC12A4-208ENST00000572010 ATP10BO94823 1461 aa35.7■■■■□ 3.31
SLC12A4-208ENST00000572010 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
SLC12A4-208ENST00000572010 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
SLC12A4-208ENST00000572010 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
SLC12A4-208ENST00000572010 EEA1Q15075 1411 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC12A4-208ENST00000572010 SAMD9Q5K651 1589 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC12A4-208ENST00000572010 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC12A4-208ENST00000572010 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC12A4-208ENST00000572010 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.47■■■■□ 3.27
SLC12A4-208ENST00000572010 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.43■■■■□ 3.26
SLC12A4-208ENST00000572010 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.42■■■■□ 3.26
SLC12A4-208ENST00000572010 RAPGEF3O95398 923 aa35.42■■■■□ 3.26
SLC12A4-208ENST00000572010 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
SLC12A4-208ENST00000572010 NEO1Q92859 1461 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC12A4-208ENST00000572010 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.37■■■■□ 3.25
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF21BO75037 1637 aa35.36■■■■□ 3.25
SLC12A4-208ENST00000572010 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
SLC12A4-208ENST00000572010 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.26■■■■□ 3.23
SLC12A4-208ENST00000572010 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
SLC12A4-208ENST00000572010 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
SLC12A4-208ENST00000572010 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC12A4-208ENST00000572010 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
SLC12A4-208ENST00000572010 AKNAQ7Z591 1439 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC12A4-208ENST00000572010 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
SLC12A4-208ENST00000572010 FANCAO15360 1455 aa35.14■■■■□ 3.22
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPRMP28827 1452 aa35.12■■■■□ 3.21
SLC12A4-208ENST00000572010 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.212e-8■■■□□ 16.4
SLC12A4-208ENST00000572010 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.1■■■■□ 3.21
SLC12A4-208ENST00000572010 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC12A4-208ENST00000572010 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.04■■■■□ 3.2
SLC12A4-208ENST00000572010 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
SLC12A4-208ENST00000572010 FMN1Q68DA7 1419 aa35.04■■■■□ 3.2
SLC12A4-208ENST00000572010 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
SLC12A4-208ENST00000572010 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC12A4-208ENST00000572010 TTC37Q6PGP7 1564 aa35■■■■□ 3.19
SLC12A4-208ENST00000572010 RICTORQ6R327 1708 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.97■■■■□ 3.19
SLC12A4-208ENST00000572010 PLCH2O75038 1416 aa34.97■■■■□ 3.19
SLC12A4-208ENST00000572010 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.96■■■■□ 3.19
SLC12A4-208ENST00000572010 MADDQ8WXG6 1647 aa34.94■■■■□ 3.18
SLC12A4-208ENST00000572010 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.93■■■■□ 3.18
SLC12A4-208ENST00000572010 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.93■■■■□ 3.18
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.92■■■■□ 3.18
SLC12A4-208ENST00000572010 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.91■■■■□ 3.18
SLC12A4-208ENST00000572010 HECW1Q76N89 1606 aa34.91■■■■□ 3.18
SLC12A4-208ENST00000572010 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.89■■■■□ 3.18
SLC12A4-208ENST00000572010 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.89■■■■□ 3.18
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