RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569511.5

USP10-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 5

Gene USP10, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-216ENST00000569511 NUP160Q12769 1436 aa29.63■■■□□ 2.33
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USP10-216ENST00000569511 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.58■■■□□ 2.33
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USP10-216ENST00000569511 ARAP1Q96P48 1450 aa29.55■■■□□ 2.32
USP10-216ENST00000569511 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.47■■■□□ 2.31
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USP10-216ENST00000569511 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.08■■■□□ 2.25
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USP10-216ENST00000569511 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.76■■■□□ 2.19
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USP10-216ENST00000569511 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
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USP10-216ENST00000569511 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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USP10-216ENST00000569511 MAPKBP1O60336 1514 aa28.52■■■□□ 2.16
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USP10-216ENST00000569511 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.33■■■□□ 2.13
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USP10-216ENST00000569511 TSPOAP1O95153 1857 aa28.26■■■□□ 2.11
USP10-216ENST00000569511 TIAM1Q13009 1591 aa28.25■■■□□ 2.11
USP10-216ENST00000569511 KCNH8Q96L42 1107 aa28.25■■■□□ 2.11
USP10-216ENST00000569511 GLI2P10070 1586 aa28.24■■■□□ 2.11
USP10-216ENST00000569511 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.21■■■□□ 2.11
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USP10-216ENST00000569511 MAP3K1Q13233 1512 aa28.18■■■□□ 2.1
USP10-216ENST00000569511 KIF14Q15058 1648 aa28.18■■■□□ 2.1
USP10-216ENST00000569511 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.18■■■□□ 2.1
USP10-216ENST00000569511 APLP2Q06481 763 aa28.15■■■□□ 2.1
USP10-216ENST00000569511 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.13■■■□□ 2.09
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USP10-216ENST00000569511 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.091e-6■■■□□ 18.3
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USP10-216ENST00000569511 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.1■■■□□ 2.09
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USP10-216ENST00000569511 CD109Q6YHK3 1445 aa28.05■■■□□ 2.08
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USP10-216ENST00000569511 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
USP10-216ENST00000569511 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28■■■□□ 2.07
USP10-216ENST00000569511 PREX2Q70Z35 1606 aa27.96■■■□□ 2.07
USP10-216ENST00000569511 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.95■■■□□ 2.07
USP10-216ENST00000569511 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.95■■■□□ 2.06
USP10-216ENST00000569511 NCOA2Q15596 1464 aa27.93■■■□□ 2.06
USP10-216ENST00000569511 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.92■■■□□ 2.06
USP10-216ENST00000569511 PLCH2O75038 1416 aa27.91■■■□□ 2.06
USP10-216ENST00000569511 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.9■■■□□ 2.06
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