RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569085.1

FHOD1-209, Transcript of formin homology 2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FHOD1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD1-209ENST00000569085 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.56■■□□□ 1.2
FHOD1-209ENST00000569085 CEP170Q5SW79 1584 aa22.55■■□□□ 1.2
FHOD1-209ENST00000569085 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.52■■□□□ 1.2
FHOD1-209ENST00000569085 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.51■■□□□ 1.19
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FHOD1-209ENST00000569085 ARHGEF11O15085 1522 aa22.44■■□□□ 1.18
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FHOD1-209ENST00000569085 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
FHOD1-209ENST00000569085 IQGAP2Q13576 1575 aa22.36■■□□□ 1.17
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FHOD1-209ENST00000569085 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
FHOD1-209ENST00000569085 KIF21BO75037 1637 aa22.35■■□□□ 1.17
FHOD1-209ENST00000569085 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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FHOD1-209ENST00000569085 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.27■■□□□ 1.16
FHOD1-209ENST00000569085 P3H3Q8IVL6 736 aa22.27■■□□□ 1.16
FHOD1-209ENST00000569085 ARAP1Q96P48 1450 aa22.27■■□□□ 1.16
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FHOD1-209ENST00000569085 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.23■■□□□ 1.15
FHOD1-209ENST00000569085 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.23■■□□□ 1.15
FHOD1-209ENST00000569085 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.21■■□□□ 1.15
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FHOD1-209ENST00000569085 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.04■■□□□ 1.12
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FHOD1-209ENST00000569085 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.02■■□□□ 1.12
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FHOD1-209ENST00000569085 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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FHOD1-209ENST00000569085 CEP162Q5TB80 1403 aa21.93■■□□□ 1.1
FHOD1-209ENST00000569085 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.92■■□□□ 1.1
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FHOD1-209ENST00000569085 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.9■■□□□ 1.1
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FHOD1-209ENST00000569085 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.81■■□□□ 1.08
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FHOD1-209ENST00000569085 KCNH8Q96L42 1107 aa21.8■■□□□ 1.08
FHOD1-209ENST00000569085 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.8■■□□□ 1.08
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FHOD1-209ENST00000569085 ASXL2Q76L83 1435 aa21.78■■□□□ 1.08
FHOD1-209ENST00000569085 ATP10BO94823 1461 aa21.77■■□□□ 1.08
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FHOD1-209ENST00000569085 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
FHOD1-209ENST00000569085 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.63■■□□□ 1.05
FHOD1-209ENST00000569085 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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FHOD1-209ENST00000569085 CD109Q6YHK3 1445 aa21.53■■□□□ 1.04
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FHOD1-209ENST00000569085 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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FHOD1-209ENST00000569085 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
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FHOD1-209ENST00000569085 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.33■■□□□ 1
FHOD1-209ENST00000569085 FANCAO15360 1455 aa21.31■■□□□ 1
FHOD1-209ENST00000569085 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.31■■□□□ 1
FHOD1-209ENST00000569085 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
FHOD1-209ENST00000569085 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.29■■□□□ 1
FHOD1-209ENST00000569085 NEO1Q92859 1461 aa21.27■■□□□ 1
FHOD1-209ENST00000569085 AKNAQ7Z591 1439 aa21.27■■□□□ 1
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