RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568810.5

PPP4C-213, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,080 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-213	ENST00000568810	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.41
PPP4C-213	ENST00000568810	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.62	■■■■■ 4.41
PPP4C-213	ENST00000568810	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.6	■■■■■ 4.41
PPP4C-213	ENST00000568810	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.56	■■■■■ 4.4
PPP4C-213	ENST00000568810	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PPP4C-213	ENST00000568810	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.23	■■■■■ 4.35
PPP4C-213	ENST00000568810	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PPP4C-213	ENST00000568810	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PPP4C-213	ENST00000568810	PTPRG	P23470	1445 aa		42.04	■■■■■ 4.32
PPP4C-213	ENST00000568810	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.04	■■■■■ 4.32
PPP4C-213	ENST00000568810	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.03	■■■■■ 4.32
PPP4C-213	ENST00000568810	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.99	■■■■■ 4.31
PPP4C-213	ENST00000568810	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.99	■■■■■ 4.31
PPP4C-213	ENST00000568810	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.97	■■■■■ 4.31
PPP4C-213	ENST00000568810	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.95	■■■■■ 4.31
PPP4C-213	ENST00000568810	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.91	■■■■■ 4.3
PPP4C-213	ENST00000568810	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.88	■■■■■ 4.3
PPP4C-213	ENST00000568810	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29
PPP4C-213	ENST00000568810	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.83	■■■■■ 4.29
PPP4C-213	ENST00000568810	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PPP4C-213	ENST00000568810	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.79	■■■■■ 4.28
PPP4C-213	ENST00000568810	EEA1	Q15075	1411 aa		41.78	■■■■■ 4.28
PPP4C-213	ENST00000568810	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PPP4C-213	ENST00000568810	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PPP4C-213	ENST00000568810	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PPP4C-213	ENST00000568810	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.73	■■■■■ 4.27
PPP4C-213	ENST00000568810	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.73	■■■■■ 4.27
PPP4C-213	ENST00000568810	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.72	■■■■■ 4.27
PPP4C-213	ENST00000568810	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PPP4C-213	ENST00000568810	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.55	■■■■■ 4.24
PPP4C-213	ENST00000568810	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.55	■■■■■ 4.24
PPP4C-213	ENST00000568810	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.47	■■■■■ 4.23
PPP4C-213	ENST00000568810	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.46	■■■■■ 4.23
PPP4C-213	ENST00000568810	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
PPP4C-213	ENST00000568810	ABCA8	O94911	1581 aa		41.41	■■■■■ 4.22
PPP4C-213	ENST00000568810	GLI2	P10070	1586 aa		41.39	■■■■■ 4.22
PPP4C-213	ENST00000568810	KIF21B	O75037	1637 aa		41.36	■■■■■ 4.21
PPP4C-213	ENST00000568810	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.36	■■■■■ 4.21
PPP4C-213	ENST00000568810	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.36	■■■■■ 4.21
PPP4C-213	ENST00000568810	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.3	■■■■■ 4.2
PPP4C-213	ENST00000568810	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.29	■■■■■ 4.2
PPP4C-213	ENST00000568810	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.26	■■■■■ 4.2
PPP4C-213	ENST00000568810	KDM6B	O15054	1643 aa		41.22	■■■■■ 4.19
PPP4C-213	ENST00000568810	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.18	■■■■■ 4.18
PPP4C-213	ENST00000568810	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.17	■■■■■ 4.18
PPP4C-213	ENST00000568810	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.11	■■■■■ 4.17
PPP4C-213	ENST00000568810	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.08	■■■■■ 4.17
PPP4C-213	ENST00000568810	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.07	■■■■■ 4.17
PPP4C-213	ENST00000568810	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.06	■■■■■ 4.16
PPP4C-213	ENST00000568810	ATP10B	O94823	1461 aa		41.06	■■■■■ 4.16
PPP4C-213	ENST00000568810	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.05	■■■■■ 4.16
PPP4C-213	ENST00000568810	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41	■■■■■ 4.15
PPP4C-213	ENST00000568810	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.99	■■■■■ 4.15
PPP4C-213	ENST00000568810	KCNH8	Q96L42	1107 aa		40.99	■■■■■ 4.15
PPP4C-213	ENST00000568810	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.98	■■■■■ 4.15
PPP4C-213	ENST00000568810	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	40.94	■■■■■ 4.14
PPP4C-213	ENST00000568810	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.94	■■■■■ 4.14
PPP4C-213	ENST00000568810	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.93	■■■■■ 4.14
PPP4C-213	ENST00000568810	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
PPP4C-213	ENST00000568810	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PPP4C-213	ENST00000568810	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
PPP4C-213	ENST00000568810	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
PPP4C-213	ENST00000568810	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
PPP4C-213	ENST00000568810	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PPP4C-213	ENST00000568810	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PPP4C-213	ENST00000568810	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.71	■■■■■ 4.11
PPP4C-213	ENST00000568810	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PPP4C-213	ENST00000568810	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PPP4C-213	ENST00000568810	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PPP4C-213	ENST00000568810	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.57	■■■■■ 4.08
PPP4C-213	ENST00000568810	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.56	■■■■■ 4.08
PPP4C-213	ENST00000568810	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PPP4C-213	ENST00000568810	NEO1	Q92859	1461 aa		40.51	■■■■■ 4.08
PPP4C-213	ENST00000568810	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
PPP4C-213	ENST00000568810	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.44	■■■■■ 4.06	1e-10	■■□□□ 13.3
PPP4C-213	ENST00000568810	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
PPP4C-213	ENST00000568810	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PPP4C-213	ENST00000568810	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.37	■■■■■ 4.05
PPP4C-213	ENST00000568810	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PPP4C-213	ENST00000568810	CLIP1	P30622	1438 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PPP4C-213	ENST00000568810	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PPP4C-213	ENST00000568810	FANCA	O15360	1455 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PPP4C-213	ENST00000568810	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PPP4C-213	ENST00000568810	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PPP4C-213	ENST00000568810	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPP4C-213	ENST00000568810	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PPP4C-213	ENST00000568810	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
PPP4C-213	ENST00000568810	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PPP4C-213	ENST00000568810	PLCH2	O75038	1416 aa		40.22	■■■■■ 4.03
PPP4C-213	ENST00000568810	KIF14	Q15058	1648 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PPP4C-213	ENST00000568810	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.2	■■■■■ 4.03
PPP4C-213	ENST00000568810	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PPP4C-213	ENST00000568810	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PPP4C-213	ENST00000568810	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PPP4C-213	ENST00000568810	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.06	■■■■■ 4
PPP4C-213	ENST00000568810	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.03	■■■■■ 4
PPP4C-213	ENST00000568810	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.01	■■■■■ 4
PPP4C-213	ENST00000568810	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.01	■■■■■ 4
PPP4C-213	ENST00000568810	CEP162	Q5TB80	1403 aa		39.98	■■■■□ 3.99

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