RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567074.5

UBE2I-215, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 I, human

TSL 1 (best)

Gene UBE2I, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2I-215	ENST00000567074	CUL7	Q14999	1698 aa		33.28	■■■□□ 2.92
UBE2I-215	ENST00000567074	IGF1R	P08069	1367 aa		33.22	■■■□□ 2.91
UBE2I-215	ENST00000567074	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.16	■■■□□ 2.9
UBE2I-215	ENST00000567074	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.04	■■■□□ 2.88
UBE2I-215	ENST00000567074	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.02	■■■□□ 2.88
UBE2I-215	ENST00000567074	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.97	■■■□□ 2.87
UBE2I-215	ENST00000567074	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.95	■■■□□ 2.87
UBE2I-215	ENST00000567074	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.95	■■■□□ 2.87
UBE2I-215	ENST00000567074	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UBE2I-215	ENST00000567074	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UBE2I-215	ENST00000567074	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UBE2I-215	ENST00000567074	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.82	■■■□□ 2.84
UBE2I-215	ENST00000567074	PTPRG	P23470	1445 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UBE2I-215	ENST00000567074	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UBE2I-215	ENST00000567074	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UBE2I-215	ENST00000567074	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UBE2I-215	ENST00000567074	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
UBE2I-215	ENST00000567074	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UBE2I-215	ENST00000567074	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UBE2I-215	ENST00000567074	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.65	■■■□□ 2.82
UBE2I-215	ENST00000567074	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.64	■■■□□ 2.82
UBE2I-215	ENST00000567074	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
UBE2I-215	ENST00000567074	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.58	■■■□□ 2.81
UBE2I-215	ENST00000567074	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBE2I-215	ENST00000567074	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UBE2I-215	ENST00000567074	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UBE2I-215	ENST00000567074	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UBE2I-215	ENST00000567074	KDM6B	O15054	1643 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UBE2I-215	ENST00000567074	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.51	■■■□□ 2.8
UBE2I-215	ENST00000567074	GLI2	P10070	1586 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UBE2I-215	ENST00000567074	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.47	■■■□□ 2.79
UBE2I-215	ENST00000567074	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBE2I-215	ENST00000567074	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBE2I-215	ENST00000567074	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
UBE2I-215	ENST00000567074	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
UBE2I-215	ENST00000567074	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
UBE2I-215	ENST00000567074	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.3	■■■□□ 2.76
UBE2I-215	ENST00000567074	ABCA8	O94911	1581 aa		32.24	■■■□□ 2.75
UBE2I-215	ENST00000567074	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.23	■■■□□ 2.75
UBE2I-215	ENST00000567074	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.23	■■■□□ 2.75
UBE2I-215	ENST00000567074	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.13	■■■□□ 2.73
UBE2I-215	ENST00000567074	EEA1	Q15075	1411 aa		32.12	■■■□□ 2.73
UBE2I-215	ENST00000567074	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
UBE2I-215	ENST00000567074	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.1	■■■□□ 2.73
UBE2I-215	ENST00000567074	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.07	■■■□□ 2.72
UBE2I-215	ENST00000567074	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
UBE2I-215	ENST00000567074	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.06	■■■□□ 2.72
UBE2I-215	ENST00000567074	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.04	■■■□□ 2.72
UBE2I-215	ENST00000567074	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32	■■■□□ 2.71
UBE2I-215	ENST00000567074	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.95	■■■□□ 2.71
UBE2I-215	ENST00000567074	ATP10B	O94823	1461 aa		31.93	■■■□□ 2.7
UBE2I-215	ENST00000567074	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.93	■■■□□ 2.7
UBE2I-215	ENST00000567074	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.92	■■■□□ 2.7
UBE2I-215	ENST00000567074	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.89	■■■□□ 2.7
UBE2I-215	ENST00000567074	KIF21B	O75037	1637 aa		31.85	■■■□□ 2.69
UBE2I-215	ENST00000567074	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UBE2I-215	ENST00000567074	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UBE2I-215	ENST00000567074	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UBE2I-215	ENST00000567074	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.79	■■■□□ 2.68
UBE2I-215	ENST00000567074	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UBE2I-215	ENST00000567074	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.77	■■■□□ 2.68
UBE2I-215	ENST00000567074	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
UBE2I-215	ENST00000567074	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UBE2I-215	ENST00000567074	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
UBE2I-215	ENST00000567074	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
UBE2I-215	ENST00000567074	NEO1	Q92859	1461 aa		31.67	■■■□□ 2.66
UBE2I-215	ENST00000567074	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
UBE2I-215	ENST00000567074	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.59	■■■□□ 2.65
UBE2I-215	ENST00000567074	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.51	■■■□□ 2.63
UBE2I-215	ENST00000567074	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
UBE2I-215	ENST00000567074	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UBE2I-215	ENST00000567074	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UBE2I-215	ENST00000567074	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.47	■■■□□ 2.63
UBE2I-215	ENST00000567074	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UBE2I-215	ENST00000567074	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UBE2I-215	ENST00000567074	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.43	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.43	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	FANCA	O15360	1455 aa		31.42	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.4	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.39	■■■□□ 2.62
UBE2I-215	ENST00000567074	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UBE2I-215	ENST00000567074	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.33	■■■□□ 2.61
UBE2I-215	ENST00000567074	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.33	■■■□□ 2.61
UBE2I-215	ENST00000567074	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.32	■■■□□ 2.6
UBE2I-215	ENST00000567074	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
UBE2I-215	ENST00000567074	PLCH2	O75038	1416 aa		31.29	■■■□□ 2.6
UBE2I-215	ENST00000567074	PTPRM	P28827	1452 aa		31.27	■■■□□ 2.6
UBE2I-215	ENST00000567074	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.27	■■■□□ 2.6
UBE2I-215	ENST00000567074	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
UBE2I-215	ENST00000567074	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.25	■■■□□ 2.59
UBE2I-215	ENST00000567074	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
UBE2I-215	ENST00000567074	KIF14	Q15058	1648 aa		31.22	■■■□□ 2.59
UBE2I-215	ENST00000567074	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.22	■■■□□ 2.59
UBE2I-215	ENST00000567074	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.22	■■■□□ 2.59
UBE2I-215	ENST00000567074	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
UBE2I-215	ENST00000567074	CLIP1	P30622	1438 aa		31.18	■■■□□ 2.58

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