RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 GOLGA3Q08378 1498 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-209ENST00000566833 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-209ENST00000566833 IQGAP2Q13576 1575 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-209ENST00000566833 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-209ENST00000566833 JPH4Q96JJ6 628 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-209ENST00000566833 SHROOM2Q13796 1616 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARHGEF11O15085 1522 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-209ENST00000566833 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-209ENST00000566833 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-209ENST00000566833 DISP1Q96F81 1524 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIAA0556O60303 1618 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARAP1Q96P48 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.8■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 P3H3Q8IVL6 736 aa21.77■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 SAMD9Q5K651 1589 aa21.77■■□□□ 1.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTPRGP23470 1445 aa21.75■■□□□ 1.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 CLIP1P30622 1438 aa21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-209ENST00000566833 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.68■■□□□ 1.06
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.67■■□□□ 1.06
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEP162Q5TB80 1403 aa21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1-209ENST00000566833 UACAQ9BZF9 1416 aa21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 FMN1Q68DA7 1419 aa21.57■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.57■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCC2Q92887 1545 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCA8O94911 1581 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARID3CA6NKF2 412 aa21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 HECW1Q76N89 1606 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATP10BO94823 1461 aa21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAPKBP1O60336 1514 aa21.37■■□□□ 1.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ASXL2Q76L83 1435 aa21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.32■■□□□ 1
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-209ENST00000566833 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-209ENST00000566833 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-209ENST00000566833 APLP2Q06481 763 aa21.24■□□□□ 0.99
CCNDBP1-209ENST00000566833 KCNH8Q96L42 1107 aa21.24■□□□□ 0.99
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-209ENST00000566833 DIP2BQ9P265 1576 aa21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-209ENST00000566833 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.18■□□□□ 0.98
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.18■□□□□ 0.98
CCNDBP1-209ENST00000566833 TIAM1Q13009 1591 aa21.16■□□□□ 0.98
CCNDBP1-209ENST00000566833 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCNDBP1-209ENST00000566833 GLI2P10070 1586 aa21.15■□□□□ 0.98
CCNDBP1-209ENST00000566833 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.15■□□□□ 0.98
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIF14Q15058 1648 aa21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAP3K1Q13233 1512 aa21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.11■□□□□ 0.97
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CCNDBP1-209ENST00000566833 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 CD109Q6YHK3 1445 aa21.06■□□□□ 0.96
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CCNDBP1-209ENST00000566833 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 TEX14Q8IWB6 1497 aa21■□□□□ 0.95
CCNDBP1-209ENST00000566833 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.99■□□□□ 0.95
CCNDBP1-209ENST00000566833 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.97■□□□□ 0.95
CCNDBP1-209ENST00000566833 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCNDBP1-209ENST00000566833 NCOA2Q15596 1464 aa20.95■□□□□ 0.94
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLCH2O75038 1416 aa20.95■□□□□ 0.94
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.93■□□□□ 0.94
CCNDBP1-209ENST00000566833 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.92■□□□□ 0.94
CCNDBP1-209ENST00000566833 PREX2Q70Z35 1606 aa20.92■□□□□ 0.94
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.92■□□□□ 0.94
CCNDBP1-209ENST00000566833 FANCAO15360 1455 aa20.91■□□□□ 0.94
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