RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 JPH4Q96JJ6 628 aa31.95■■■□□ 2.71
USP10-208ENST00000563386 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
USP10-208ENST00000563386 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.88■■■□□ 2.69
USP10-208ENST00000563386 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.84■■■□□ 2.69
USP10-208ENST00000563386 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.72■■■□□ 2.67
USP10-208ENST00000563386 IQGAP2Q13576 1575 aa31.7■■■□□ 2.67
USP10-208ENST00000563386 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
USP10-208ENST00000563386 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
USP10-208ENST00000563386 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.66■■■□□ 2.66
USP10-208ENST00000563386 PRXQ9BXM0 1461 aa31.65■■■□□ 2.66
USP10-208ENST00000563386 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
USP10-208ENST00000563386 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.58■■■□□ 2.65
USP10-208ENST00000563386 EEA1Q15075 1411 aa31.58■■■□□ 2.65
USP10-208ENST00000563386 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.54■■■□□ 2.64
USP10-208ENST00000563386 PTPRGP23470 1445 aa31.5■■■□□ 2.63
USP10-208ENST00000563386 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.48■■■□□ 2.63
USP10-208ENST00000563386 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.48■■■□□ 2.63
USP10-208ENST00000563386 DISP1Q96F81 1524 aa31.47■■■□□ 2.63
USP10-208ENST00000563386 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
USP10-208ENST00000563386 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.41■■■□□ 2.62
USP10-208ENST00000563386 KIAA0556O60303 1618 aa31.38■■■□□ 2.61
USP10-208ENST00000563386 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.35■■■□□ 2.61
USP10-208ENST00000563386 GOLGA3Q08378 1498 aa31.33■■■□□ 2.61
USP10-208ENST00000563386 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
USP10-208ENST00000563386 KIF21BO75037 1637 aa31.28■■■□□ 2.6
USP10-208ENST00000563386 P3H3Q8IVL6 736 aa31.26■■■□□ 2.59
USP10-208ENST00000563386 UACAQ9BZF9 1416 aa31.25■■■□□ 2.59
USP10-208ENST00000563386 ABCC2Q92887 1545 aa31.19■■■□□ 2.58
USP10-208ENST00000563386 MAPKBP1O60336 1514 aa31.19■■■□□ 2.58
USP10-208ENST00000563386 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
USP10-208ENST00000563386 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.18■■■□□ 2.58
USP10-208ENST00000563386 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.14■■■□□ 2.58
USP10-208ENST00000563386 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.14■■■□□ 2.57
USP10-208ENST00000563386 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.12■■■□□ 2.57
USP10-208ENST00000563386 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.1■■■□□ 2.57
USP10-208ENST00000563386 SAMD9Q5K651 1589 aa31.09■■■□□ 2.57
USP10-208ENST00000563386 ASXL2Q76L83 1435 aa31.05■■■□□ 2.56
USP10-208ENST00000563386 DIP2BQ9P265 1576 aa31.05■■■□□ 2.56
USP10-208ENST00000563386 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.04■■■□□ 2.56
USP10-208ENST00000563386 ABCA8O94911 1581 aa31.04■■■□□ 2.56
USP10-208ENST00000563386 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
USP10-208ENST00000563386 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.99■■■□□ 2.55
USP10-208ENST00000563386 ARID3CA6NKF2 412 aa30.99■■■□□ 2.55
USP10-208ENST00000563386 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.93■■■□□ 2.54
USP10-208ENST00000563386 TSPOAP1O95153 1857 aa30.89■■■□□ 2.53
USP10-208ENST00000563386 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.87■■■□□ 2.53
USP10-208ENST00000563386 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
USP10-208ENST00000563386 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.84■■■□□ 2.53
USP10-208ENST00000563386 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
USP10-208ENST00000563386 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
USP10-208ENST00000563386 KCNH8Q96L42 1107 aa30.83■■■□□ 2.53
USP10-208ENST00000563386 ATP10BO94823 1461 aa30.82■■■□□ 2.52
USP10-208ENST00000563386 GLI2P10070 1586 aa30.81■■■□□ 2.52
USP10-208ENST00000563386 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.78■■■□□ 2.52
USP10-208ENST00000563386 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
USP10-208ENST00000563386 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
USP10-208ENST00000563386 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.69■■■□□ 2.5
USP10-208ENST00000563386 FMN1Q68DA7 1419 aa30.67■■■□□ 2.5
USP10-208ENST00000563386 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
USP10-208ENST00000563386 KDM6BO15054 1643 aa30.64■■■□□ 2.5
USP10-208ENST00000563386 CD109Q6YHK3 1445 aa30.61■■■□□ 2.49
USP10-208ENST00000563386 CLIP1P30622 1438 aa30.59■■■□□ 2.49
USP10-208ENST00000563386 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.59■■■□□ 2.49
USP10-208ENST00000563386 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.58■■■□□ 2.49
USP10-208ENST00000563386 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.58■■■□□ 2.49
USP10-208ENST00000563386 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.49
USP10-208ENST00000563386 HECW1Q76N89 1606 aa30.56■■■□□ 2.48
USP10-208ENST00000563386 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.51■■■□□ 2.47
USP10-208ENST00000563386 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.48■■■□□ 2.47
USP10-208ENST00000563386 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.48■■■□□ 2.47
USP10-208ENST00000563386 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
USP10-208ENST00000563386 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
USP10-208ENST00000563386 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.42■■■□□ 2.46
USP10-208ENST00000563386 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
USP10-208ENST00000563386 CEP162Q5TB80 1403 aa30.4■■■□□ 2.46
USP10-208ENST00000563386 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.39■■■□□ 2.45
USP10-208ENST00000563386 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.451e-6■■■□□ 18.3
USP10-208ENST00000563386 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.33■■■□□ 2.45
USP10-208ENST00000563386 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.32■■■□□ 2.44
USP10-208ENST00000563386 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.31■■■□□ 2.44
USP10-208ENST00000563386 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
USP10-208ENST00000563386 NEO1Q92859 1461 aa30.25■■■□□ 2.43
USP10-208ENST00000563386 KIF14Q15058 1648 aa30.25■■■□□ 2.43
USP10-208ENST00000563386 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.24■■■□□ 2.43
USP10-208ENST00000563386 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.23■■■□□ 2.43
USP10-208ENST00000563386 FANCAO15360 1455 aa30.21■■■□□ 2.43
USP10-208ENST00000563386 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
USP10-208ENST00000563386 RAPGEF3O95398 923 aa30.19■■■□□ 2.42
USP10-208ENST00000563386 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.16■■■□□ 2.42
USP10-208ENST00000563386 PLCH2O75038 1416 aa30.16■■■□□ 2.42
USP10-208ENST00000563386 AKNAQ7Z591 1439 aa30.16■■■□□ 2.42
USP10-208ENST00000563386 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.15■■■□□ 2.42
USP10-208ENST00000563386 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.1■■■□□ 2.41
USP10-208ENST00000563386 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
USP10-208ENST00000563386 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.06■■■□□ 2.4
USP10-208ENST00000563386 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.05■■■□□ 2.4
USP10-208ENST00000563386 ADGRL1O94910 1474 aa30.05■■■□□ 2.4
USP10-208ENST00000563386 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.04■■■□□ 2.4
USP10-208ENST00000563386 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.03■■■□□ 2.4
USP10-208ENST00000563386 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms