RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 KIF21BO75037 1637 aa34.81■■■■□ 3.16
MEIS3-212ENST00000561293 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
MEIS3-212ENST00000561293 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.77■■■■□ 3.16
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.76■■■■□ 3.16
MEIS3-212ENST00000561293 JPH4Q96JJ6 628 aa34.75■■■■□ 3.15
MEIS3-212ENST00000561293 GOLGA3Q08378 1498 aa34.72■■■■□ 3.15
MEIS3-212ENST00000561293 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.72■■■■□ 3.15
MEIS3-212ENST00000561293 IQGAP2Q13576 1575 aa34.67■■■■□ 3.14
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGEF11O15085 1522 aa34.67■■■■□ 3.14
MEIS3-212ENST00000561293 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
MEIS3-212ENST00000561293 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
MEIS3-212ENST00000561293 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.64■■■■□ 3.14
MEIS3-212ENST00000561293 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.6■■■■□ 3.13
MEIS3-212ENST00000561293 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.6■■■■□ 3.13
MEIS3-212ENST00000561293 SHROOM2Q13796 1616 aa34.6■■■■□ 3.13
MEIS3-212ENST00000561293 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.6■■■■□ 3.13
MEIS3-212ENST00000561293 P3H3Q8IVL6 736 aa34.55■■■■□ 3.12
MEIS3-212ENST00000561293 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.49■■■■□ 3.11
MEIS3-212ENST00000561293 DISP1Q96F81 1524 aa34.47■■■■□ 3.11
MEIS3-212ENST00000561293 ARAP1Q96P48 1450 aa34.46■■■■□ 3.11
MEIS3-212ENST00000561293 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.45■■■■□ 3.11
MEIS3-212ENST00000561293 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.37■■■■□ 3.09
MEIS3-212ENST00000561293 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.36■■■■□ 3.09
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA0556O60303 1618 aa34.36■■■■□ 3.09
MEIS3-212ENST00000561293 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.3■■■■□ 3.08
MEIS3-212ENST00000561293 PTPRGP23470 1445 aa34.26■■■■□ 3.07
MEIS3-212ENST00000561293 SAMD9Q5K651 1589 aa34.25■■■■□ 3.07
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.24■■■■□ 3.07
MEIS3-212ENST00000561293 CLIP1P30622 1438 aa34.2■■■■□ 3.07
MEIS3-212ENST00000561293 CEP162Q5TB80 1403 aa34.2■■■■□ 3.07
MEIS3-212ENST00000561293 ARID3CA6NKF2 412 aa34.14■■■■□ 3.06
MEIS3-212ENST00000561293 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.13■■■■□ 3.05
MEIS3-212ENST00000561293 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.12■■■■□ 3.05
MEIS3-212ENST00000561293 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.01■■■■□ 3.04
MEIS3-212ENST00000561293 UACAQ9BZF9 1416 aa34.01■■■■□ 3.04
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MEIS3-212ENST00000561293 ABCA8O94911 1581 aa33.92■■■■□ 3.02
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC2Q92887 1545 aa33.9■■■■□ 3.02
MEIS3-212ENST00000561293 FMN1Q68DA7 1419 aa33.86■■■■□ 3.01
MEIS3-212ENST00000561293 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.85■■■■□ 3.01
MEIS3-212ENST00000561293 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.82■■■■□ 3
MEIS3-212ENST00000561293 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
MEIS3-212ENST00000561293 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.81■■■■□ 3
MEIS3-212ENST00000561293 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
MEIS3-212ENST00000561293 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
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MEIS3-212ENST00000561293 ATP10BO94823 1461 aa33.74■■■□□ 2.99
MEIS3-212ENST00000561293 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.73■■■□□ 2.99
MEIS3-212ENST00000561293 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
MEIS3-212ENST00000561293 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.69■■■□□ 2.98
MEIS3-212ENST00000561293 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.67■■■□□ 2.98
MEIS3-212ENST00000561293 ASXL2Q76L83 1435 aa33.65■■■□□ 2.98
MEIS3-212ENST00000561293 HECW1Q76N89 1606 aa33.64■■■□□ 2.98
MEIS3-212ENST00000561293 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.64■■■□□ 2.98
MEIS3-212ENST00000561293 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.97
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MEIS3-212ENST00000561293 KCNH8Q96L42 1107 aa33.61■■■□□ 2.97
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MEIS3-212ENST00000561293 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.49■■■□□ 2.95
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.47■■■□□ 2.95
MEIS3-212ENST00000561293 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.45■■■□□ 2.94
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.42■■■□□ 2.94
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.41■■■□□ 2.94
MEIS3-212ENST00000561293 DIP2BQ9P265 1576 aa33.39■■■□□ 2.94
MEIS3-212ENST00000561293 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
MEIS3-212ENST00000561293 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
MEIS3-212ENST00000561293 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
MEIS3-212ENST00000561293 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.34■■■□□ 2.93
MEIS3-212ENST00000561293 TIAM1Q13009 1591 aa33.32■■■□□ 2.92
MEIS3-212ENST00000561293 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.31■■■□□ 2.92
MEIS3-212ENST00000561293 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
MEIS3-212ENST00000561293 APLP2Q06481 763 aa33.3■■■□□ 2.92
MEIS3-212ENST00000561293 KIF14Q15058 1648 aa33.3■■■□□ 2.92
MEIS3-212ENST00000561293 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.27■■■□□ 2.92
MEIS3-212ENST00000561293 TSPOAP1O95153 1857 aa33.23■■■□□ 2.91
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MEIS3-212ENST00000561293 CD109Q6YHK3 1445 aa33.17■■■□□ 2.9
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MEIS3-212ENST00000561293 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.13■■■□□ 2.89
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MEIS3-212ENST00000561293 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.12■■■□□ 2.89
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MEIS3-212ENST00000561293 PLCH2O75038 1416 aa32.97■■■□□ 2.87
MEIS3-212ENST00000561293 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.95■■■□□ 2.87
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.94■■■□□ 2.86
MEIS3-212ENST00000561293 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.93■■■□□ 2.86
MEIS3-212ENST00000561293 FANCAO15360 1455 aa32.93■■■□□ 2.86
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
MEIS3-212ENST00000561293 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.92■■■□□ 2.86
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