RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559432.5

CRNDE-206, Transcript of colorectal neoplasia differentially expressed, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CRNDE, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNDE-206ENST00000559432 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
CRNDE-206ENST00000559432 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.36■■■■■ 4.53
CRNDE-206ENST00000559432 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.24■■■■■ 4.51
CRNDE-206ENST00000559432 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.22■■■■■ 4.51
CRNDE-206ENST00000559432 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.91■■■■■ 4.46
CRNDE-206ENST00000559432 IQGAP2Q13576 1575 aa42.86■■■■■ 4.45
CRNDE-206ENST00000559432 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.84■■■■■ 4.45
CRNDE-206ENST00000559432 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.83■■■■■ 4.45
CRNDE-206ENST00000559432 PTPRGP23470 1445 aa42.75■■■■■ 4.43
CRNDE-206ENST00000559432 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.75■■■■■ 4.43
CRNDE-206ENST00000559432 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.71■■■■■ 4.43
CRNDE-206ENST00000559432 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
CRNDE-206ENST00000559432 MAPKBP1O60336 1514 aa42.63■■■■■ 4.42
CRNDE-206ENST00000559432 DISP1Q96F81 1524 aa42.59■■■■■ 4.41
CRNDE-206ENST00000559432 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.59■■■■■ 4.41
CRNDE-206ENST00000559432 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.57■■■■■ 4.4
CRNDE-206ENST00000559432 PRXQ9BXM0 1461 aa42.55■■■■■ 4.4
CRNDE-206ENST00000559432 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.54■■■■■ 4.4
CRNDE-206ENST00000559432 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.53■■■■■ 4.4
CRNDE-206ENST00000559432 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.5■■■■■ 4.39
CRNDE-206ENST00000559432 KIAA0556O60303 1618 aa42.46■■■■■ 4.39
CRNDE-206ENST00000559432 ABCC2Q92887 1545 aa42.45■■■■■ 4.39
CRNDE-206ENST00000559432 DIP2BQ9P265 1576 aa42.44■■■■■ 4.38
CRNDE-206ENST00000559432 UACAQ9BZF9 1416 aa42.43■■■■■ 4.38
CRNDE-206ENST00000559432 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.41■■■■■ 4.38
CRNDE-206ENST00000559432 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.38■■■■■ 4.37
CRNDE-206ENST00000559432 GOLGA3Q08378 1498 aa42.36■■■■■ 4.37
CRNDE-206ENST00000559432 EEA1Q15075 1411 aa42.3■■■■■ 4.36
CRNDE-206ENST00000559432 ASXL2Q76L83 1435 aa42.25■■■■■ 4.35
CRNDE-206ENST00000559432 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.24■■■■■ 4.35
CRNDE-206ENST00000559432 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.2■■■■■ 4.35
CRNDE-206ENST00000559432 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
CRNDE-206ENST00000559432 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CRNDE-206ENST00000559432 TSPOAP1O95153 1857 aa42.08■■■■■ 4.33
CRNDE-206ENST00000559432 GLI2P10070 1586 aa42.06■■■■■ 4.32
CRNDE-206ENST00000559432 ABCA8O94911 1581 aa42.02■■■■■ 4.32
CRNDE-206ENST00000559432 P3H3Q8IVL6 736 aa42.01■■■■■ 4.32
CRNDE-206ENST00000559432 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
CRNDE-206ENST00000559432 KDM6BO15054 1643 aa41.98■■■■■ 4.31
CRNDE-206ENST00000559432 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.97■■■■■ 4.31
CRNDE-206ENST00000559432 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.92■■■■■ 4.3
CRNDE-206ENST00000559432 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
CRNDE-206ENST00000559432 SAMD9Q5K651 1589 aa41.92■■■■■ 4.3
CRNDE-206ENST00000559432 KIF21BO75037 1637 aa41.88■■■■■ 4.3
CRNDE-206ENST00000559432 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
CRNDE-206ENST00000559432 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.84■■■■■ 4.29
CRNDE-206ENST00000559432 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
CRNDE-206ENST00000559432 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.77■■■■■ 4.28
CRNDE-206ENST00000559432 ARID3CA6NKF2 412 aa41.75■■■■■ 4.27
CRNDE-206ENST00000559432 KCNH8Q96L42 1107 aa41.75■■■■■ 4.27
CRNDE-206ENST00000559432 ATP10BO94823 1461 aa41.69■■■■■ 4.26
CRNDE-206ENST00000559432 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.69■■■■■ 4.26
CRNDE-206ENST00000559432 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.68■■■■■ 4.26
CRNDE-206ENST00000559432 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.65■■■■■ 4.26
CRNDE-206ENST00000559432 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
CRNDE-206ENST00000559432 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.64■■■■■ 4.26
CRNDE-206ENST00000559432 CD109Q6YHK3 1445 aa41.63■■■■■ 4.26
CRNDE-206ENST00000559432 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.61■■■■■ 4.25
CRNDE-206ENST00000559432 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
CRNDE-206ENST00000559432 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
CRNDE-206ENST00000559432 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.56■■■■■ 4.24
CRNDE-206ENST00000559432 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CRNDE-206ENST00000559432 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
CRNDE-206ENST00000559432 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.38■■■■■ 4.21
CRNDE-206ENST00000559432 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.34■■■■■ 4.21
CRNDE-206ENST00000559432 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.32■■■■■ 4.21
CRNDE-206ENST00000559432 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.29■■■■■ 4.2
CRNDE-206ENST00000559432 FMN1Q68DA7 1419 aa41.29■■■■■ 4.2
CRNDE-206ENST00000559432 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.23■■■■■ 4.19
CRNDE-206ENST00000559432 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
CRNDE-206ENST00000559432 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.22■■■■■ 4.19
CRNDE-206ENST00000559432 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CRNDE-206ENST00000559432 HECW1Q76N89 1606 aa41.16■■■■■ 4.18
CRNDE-206ENST00000559432 NEO1Q92859 1461 aa41.15■■■■■ 4.18
CRNDE-206ENST00000559432 ADGRL1O94910 1474 aa41.14■■■■■ 4.18
CRNDE-206ENST00000559432 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
CRNDE-206ENST00000559432 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
CRNDE-206ENST00000559432 RAPGEF3O95398 923 aa41■■■■■ 4.15
CRNDE-206ENST00000559432 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.99■■■■■ 4.15
CRNDE-206ENST00000559432 FANCAO15360 1455 aa40.96■■■■■ 4.15
CRNDE-206ENST00000559432 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.95■■■■■ 4.15
CRNDE-206ENST00000559432 AKNAQ7Z591 1439 aa40.92■■■■■ 4.14
CRNDE-206ENST00000559432 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
CRNDE-206ENST00000559432 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.86■■■■■ 4.13
CRNDE-206ENST00000559432 CLIP1P30622 1438 aa40.85■■■■■ 4.13
CRNDE-206ENST00000559432 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.85■■■■■ 4.13
CRNDE-206ENST00000559432 PLCH2O75038 1416 aa40.84■■■■■ 4.13
CRNDE-206ENST00000559432 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CRNDE-206ENST00000559432 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
CRNDE-206ENST00000559432 KIF14Q15058 1648 aa40.81■■■■■ 4.12
CRNDE-206ENST00000559432 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.8■■■■■ 4.12
CRNDE-206ENST00000559432 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.79■■■■■ 4.12
CRNDE-206ENST00000559432 RICTORQ6R327 1708 aa40.75■■■■■ 4.11
CRNDE-206ENST00000559432 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.74■■■■■ 4.11
CRNDE-206ENST00000559432 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.72■■■■■ 4.11
CRNDE-206ENST00000559432 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.72■■■■■ 4.11
CRNDE-206ENST00000559432 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.68■■■■■ 4.1
CRNDE-206ENST00000559432 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.66■■■■■ 4.1
CRNDE-206ENST00000559432 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CRNDE-206ENST00000559432 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.63■■■■■ 4.1
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