RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559092.1

SMAD3-210, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMAD3, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-210ENST00000559092 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SMAD3-210ENST00000559092 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
SMAD3-210ENST00000559092 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.04■■■□□ 2.4
SMAD3-210ENST00000559092 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.01■■■□□ 2.39
SMAD3-210ENST00000559092 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.87■■■□□ 2.37
SMAD3-210ENST00000559092 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.76■■■□□ 2.35
SMAD3-210ENST00000559092 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
SMAD3-210ENST00000559092 IQGAP2Q13576 1575 aa29.72■■■□□ 2.35
SMAD3-210ENST00000559092 PTPRGP23470 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
SMAD3-210ENST00000559092 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.69■■■□□ 2.34
SMAD3-210ENST00000559092 PRXQ9BXM0 1461 aa29.68■■■□□ 2.34
SMAD3-210ENST00000559092 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.62■■■□□ 2.33
SMAD3-210ENST00000559092 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.61■■■□□ 2.33
SMAD3-210ENST00000559092 DISP1Q96F81 1524 aa29.59■■■□□ 2.33
SMAD3-210ENST00000559092 EEA1Q15075 1411 aa29.56■■■□□ 2.32
SMAD3-210ENST00000559092 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.56■■■□□ 2.32
SMAD3-210ENST00000559092 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SMAD3-210ENST00000559092 MAPKBP1O60336 1514 aa29.52■■■□□ 2.32
SMAD3-210ENST00000559092 UACAQ9BZF9 1416 aa29.47■■■□□ 2.31
SMAD3-210ENST00000559092 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.47■■■□□ 2.31
SMAD3-210ENST00000559092 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.47■■■□□ 2.31
SMAD3-210ENST00000559092 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.46■■■□□ 2.31
SMAD3-210ENST00000559092 GOLGA3Q08378 1498 aa29.45■■■□□ 2.31
SMAD3-210ENST00000559092 ABCC2Q92887 1545 aa29.44■■■□□ 2.3
SMAD3-210ENST00000559092 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.42■■■□□ 2.3
SMAD3-210ENST00000559092 KIAA0556O60303 1618 aa29.42■■■□□ 2.3
SMAD3-210ENST00000559092 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.38■■■□□ 2.29
SMAD3-210ENST00000559092 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
SMAD3-210ENST00000559092 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.31■■■□□ 2.28
SMAD3-210ENST00000559092 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.3■■■□□ 2.28
SMAD3-210ENST00000559092 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.3■■■□□ 2.28
SMAD3-210ENST00000559092 DIP2BQ9P265 1576 aa29.3■■■□□ 2.28
SMAD3-210ENST00000559092 ASXL2Q76L83 1435 aa29.28■■■□□ 2.28
SMAD3-210ENST00000559092 P3H3Q8IVL6 736 aa29.19■■■□□ 2.26
SMAD3-210ENST00000559092 ABCA8O94911 1581 aa29.17■■■□□ 2.26
SMAD3-210ENST00000559092 KIF21BO75037 1637 aa29.15■■■□□ 2.26
SMAD3-210ENST00000559092 GLI2P10070 1586 aa29.14■■■□□ 2.26
SMAD3-210ENST00000559092 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SMAD3-210ENST00000559092 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SMAD3-210ENST00000559092 SAMD9Q5K651 1589 aa29.1■■■□□ 2.25
SMAD3-210ENST00000559092 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.07■■■□□ 2.24
SMAD3-210ENST00000559092 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SMAD3-210ENST00000559092 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SMAD3-210ENST00000559092 ATP10BO94823 1461 aa28.98■■■□□ 2.23
SMAD3-210ENST00000559092 KCNH8Q96L42 1107 aa28.97■■■□□ 2.23
SMAD3-210ENST00000559092 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.96■■■□□ 2.23
SMAD3-210ENST00000559092 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.96■■■□□ 2.23
SMAD3-210ENST00000559092 ARID3CA6NKF2 412 aa28.94■■■□□ 2.22
SMAD3-210ENST00000559092 TSPOAP1O95153 1857 aa28.93■■■□□ 2.22
SMAD3-210ENST00000559092 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.93■■■□□ 2.22
SMAD3-210ENST00000559092 KDM6BO15054 1643 aa28.93■■■□□ 2.22
SMAD3-210ENST00000559092 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.92■■■□□ 2.22
SMAD3-210ENST00000559092 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.91■■■□□ 2.22
SMAD3-210ENST00000559092 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.89■■■□□ 2.22
SMAD3-210ENST00000559092 CD109Q6YHK3 1445 aa28.88■■■□□ 2.21
SMAD3-210ENST00000559092 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SMAD3-210ENST00000559092 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SMAD3-210ENST00000559092 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SMAD3-210ENST00000559092 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SMAD3-210ENST00000559092 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.84■■■□□ 2.21
SMAD3-210ENST00000559092 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SMAD3-210ENST00000559092 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.78■■■□□ 2.2
SMAD3-210ENST00000559092 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SMAD3-210ENST00000559092 FMN1Q68DA7 1419 aa28.77■■■□□ 2.2
SMAD3-210ENST00000559092 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.77■■■□□ 2.2
SMAD3-210ENST00000559092 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.76■■■□□ 2.19
SMAD3-210ENST00000559092 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.69■■■□□ 2.18
SMAD3-210ENST00000559092 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.66■■■□□ 2.18
SMAD3-210ENST00000559092 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SMAD3-210ENST00000559092 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SMAD3-210ENST00000559092 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.6■■■□□ 2.17
SMAD3-210ENST00000559092 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.58■■■□□ 2.17
SMAD3-210ENST00000559092 NEO1Q92859 1461 aa28.57■■■□□ 2.16
SMAD3-210ENST00000559092 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SMAD3-210ENST00000559092 HECW1Q76N89 1606 aa28.54■■■□□ 2.16
SMAD3-210ENST00000559092 CLIP1P30622 1438 aa28.5■■■□□ 2.15
SMAD3-210ENST00000559092 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
SMAD3-210ENST00000559092 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.48■■■□□ 2.15
SMAD3-210ENST00000559092 RAPGEF3O95398 923 aa28.45■■■□□ 2.14
SMAD3-210ENST00000559092 FANCAO15360 1455 aa28.42■■■□□ 2.14
SMAD3-210ENST00000559092 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SMAD3-210ENST00000559092 AKNAQ7Z591 1439 aa28.42■■■□□ 2.14
SMAD3-210ENST00000559092 PLCH2O75038 1416 aa28.41■■■□□ 2.14
SMAD3-210ENST00000559092 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.39■■■□□ 2.13
SMAD3-210ENST00000559092 ADGRL1O94910 1474 aa28.38■■■□□ 2.13
SMAD3-210ENST00000559092 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.37■■■□□ 2.13
SMAD3-210ENST00000559092 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SMAD3-210ENST00000559092 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.35■■■□□ 2.13
SMAD3-210ENST00000559092 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.35■■■□□ 2.13
SMAD3-210ENST00000559092 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.33■■■□□ 2.13
SMAD3-210ENST00000559092 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
SMAD3-210ENST00000559092 KIF14Q15058 1648 aa28.28■■■□□ 2.12
SMAD3-210ENST00000559092 CEP162Q5TB80 1403 aa28.26■■■□□ 2.11
SMAD3-210ENST00000559092 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.25■■■□□ 2.11
SMAD3-210ENST00000559092 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.25■■■□□ 2.11
SMAD3-210ENST00000559092 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.23■■■□□ 2.11
SMAD3-210ENST00000559092 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.2■■■□□ 2.1
SMAD3-210ENST00000559092 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.2■■■□□ 2.1
SMAD3-210ENST00000559092 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.18■■■□□ 2.1
SMAD3-210ENST00000559092 RICTORQ6R327 1708 aa28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms