RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559092.1

SMAD3-210, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMAD3, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-210ENST00000559092 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.23■■■■■ 4.51
SMAD3-210ENST00000559092 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.48■■■■□ 3.75
SMAD3-210ENST00000559092 ABCC9O60706 1549 aa38.07■■■■□ 3.68
SMAD3-210ENST00000559092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.47■■■■□ 3.43
SMAD3-210ENST00000559092 NACADO15069 1562 aa36.37■■■■□ 3.41
SMAD3-210ENST00000559092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.33■■■■□ 3.41
SMAD3-210ENST00000559092 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.1■■■■□ 3.37
SMAD3-210ENST00000559092 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
SMAD3-210ENST00000559092 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.78■■■■□ 3.32
SMAD3-210ENST00000559092 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.29
SMAD3-210ENST00000559092 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.4■■■■□ 3.26
SMAD3-210ENST00000559092 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.37■■■■□ 3.25
SMAD3-210ENST00000559092 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.34■■■■□ 3.25
SMAD3-210ENST00000559092 SCRIBQ14160 1630 aa35.06■■■■□ 3.2
SMAD3-210ENST00000559092 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.06■■■■□ 3.2
SMAD3-210ENST00000559092 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
SMAD3-210ENST00000559092 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.38■■■■□ 3.09
SMAD3-210ENST00000559092 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.3■■■■□ 3.08
SMAD3-210ENST00000559092 NCAPD3P42695 1498 aa33.63■■■□□ 2.97
SMAD3-210ENST00000559092 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.55■■■□□ 2.96
SMAD3-210ENST00000559092 SMARCA4P51532 1647 aa33.53■■■□□ 2.96
SMAD3-210ENST00000559092 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
SMAD3-210ENST00000559092 SMARCA2P51531 1590 aa33.47■■■□□ 2.95
SMAD3-210ENST00000559092 HMGXB3Q12766 1538 aa33.34■■■□□ 2.93
SMAD3-210ENST00000559092 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.28■■■□□ 2.92
SMAD3-210ENST00000559092 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.27■■■□□ 2.92
SMAD3-210ENST00000559092 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
SMAD3-210ENST00000559092 ERCC6Q03468 1493 aa32.87■■■□□ 2.85
SMAD3-210ENST00000559092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
SMAD3-210ENST00000559092 NESP48681 1621 aa32.82■■■□□ 2.84
SMAD3-210ENST00000559092 WIZO95785 1651 aa32.82■■■□□ 2.84
SMAD3-210ENST00000559092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.7■■■□□ 2.83
SMAD3-210ENST00000559092 CUX2O14529 1486 aa32.69■■■□□ 2.82
SMAD3-210ENST00000559092 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.65■■■□□ 2.82
SMAD3-210ENST00000559092 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.61■■■□□ 2.81
SMAD3-210ENST00000559092 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
SMAD3-210ENST00000559092 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
SMAD3-210ENST00000559092 CFTRP13569 1480 aa32.34■■■□□ 2.77
SMAD3-210ENST00000559092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.28■■■□□ 2.76
SMAD3-210ENST00000559092 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.22■■■□□ 2.75
SMAD3-210ENST00000559092 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.21■■■□□ 2.75
SMAD3-210ENST00000559092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.2■■■□□ 2.75
SMAD3-210ENST00000559092 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.19■■■□□ 2.74
SMAD3-210ENST00000559092 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.18■■■□□ 2.74
SMAD3-210ENST00000559092 WDR62O43379 1518 aa32.1■■■□□ 2.73
SMAD3-210ENST00000559092 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
SMAD3-210ENST00000559092 PRDM2Q13029 1718 aa31.8■■■□□ 2.68
SMAD3-210ENST00000559092 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
SMAD3-210ENST00000559092 ABCC8Q09428 1581 aa31.68■■■□□ 2.66
SMAD3-210ENST00000559092 TOPBP1Q92547 1522 aa31.62■■■□□ 2.65
SMAD3-210ENST00000559092 IFT140Q96RY7 1462 aa31.56■■■□□ 2.64
SMAD3-210ENST00000559092 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.52■■■□□ 2.64
SMAD3-210ENST00000559092 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
SMAD3-210ENST00000559092 OSCARQ8IYS5 282 aa31.36■■■□□ 2.61
SMAD3-210ENST00000559092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
SMAD3-210ENST00000559092 SOGA1O94964 1423 aa31.27■■■□□ 2.6
SMAD3-210ENST00000559092 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
SMAD3-210ENST00000559092 CUX1P39880 1505 aa31.23■■■□□ 2.59
SMAD3-210ENST00000559092 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.593e-6■■■■□ 24.7
SMAD3-210ENST00000559092 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.2■■■□□ 2.58
SMAD3-210ENST00000559092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.19■■■□□ 2.58
SMAD3-210ENST00000559092 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SMAD3-210ENST00000559092 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
SMAD3-210ENST00000559092 WDR97A6NE52 1622 aa31.04■■■□□ 2.56
SMAD3-210ENST00000559092 FBLN2P98095 1184 aa30.95■■■□□ 2.55
SMAD3-210ENST00000559092 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.54
SMAD3-210ENST00000559092 GRIN2BQ13224 1484 aa30.92■■■□□ 2.54
SMAD3-210ENST00000559092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.92■■■□□ 2.54
SMAD3-210ENST00000559092 TRIM41Q8WV44 630 aa30.9■■■□□ 2.54
SMAD3-210ENST00000559092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.87■■■□□ 2.53
SMAD3-210ENST00000559092 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
SMAD3-210ENST00000559092 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.86■■■□□ 2.53
SMAD3-210ENST00000559092 TOP2BQ02880 1626 aa30.85■■■□□ 2.53
SMAD3-210ENST00000559092 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
SMAD3-210ENST00000559092 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.8■■■□□ 2.52
SMAD3-210ENST00000559092 SYNJ1O43426 1573 aa30.79■■■□□ 2.52
SMAD3-210ENST00000559092 CHD1O14646 1710 aa30.77■■■□□ 2.52
SMAD3-210ENST00000559092 SYNJ2O15056 1496 aa30.76■■■□□ 2.51
SMAD3-210ENST00000559092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.73■■■□□ 2.51
SMAD3-210ENST00000559092 ARHGEF11O15085 1522 aa30.71■■■□□ 2.51
SMAD3-210ENST00000559092 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
SMAD3-210ENST00000559092 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
SMAD3-210ENST00000559092 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
SMAD3-210ENST00000559092 PBRM1Q86U86 1689 aa30.62■■■□□ 2.49
SMAD3-210ENST00000559092 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.57■■■□□ 2.48
SMAD3-210ENST00000559092 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.55■■■□□ 2.48
SMAD3-210ENST00000559092 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.52■■■□□ 2.48
SMAD3-210ENST00000559092 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.52■■■□□ 2.48
SMAD3-210ENST00000559092 GRIN2AQ12879 1464 aa30.49■■■□□ 2.47
SMAD3-210ENST00000559092 ADAMTS12P58397 1594 aa30.46■■■□□ 2.47
SMAD3-210ENST00000559092 ARAP1Q96P48 1450 aa30.44■■■□□ 2.46
SMAD3-210ENST00000559092 NUP160Q12769 1436 aa30.4■■■□□ 2.46
SMAD3-210ENST00000559092 KIF27Q86VH2 1401 aa30.37■■■□□ 2.45
SMAD3-210ENST00000559092 IGF1RP08069 1367 aa30.33■■■□□ 2.45
SMAD3-210ENST00000559092 CEP170Q5SW79 1584 aa30.28■■■□□ 2.44
SMAD3-210ENST00000559092 JPH4Q96JJ6 628 aa30.17■■■□□ 2.42
SMAD3-210ENST00000559092 SHROOM2Q13796 1616 aa30.12■■■□□ 2.41
SMAD3-210ENST00000559092 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.11■■■□□ 2.41
SMAD3-210ENST00000559092 CUL7Q14999 1698 aa30.1■■■□□ 2.41
SMAD3-210ENST00000559092 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms