RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 GRIN2AQ12879 1464 aa38.4■■■■□ 3.74
MEIS3-204ENST00000558555 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.34■■■■□ 3.73
MEIS3-204ENST00000558555 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.33■■■■□ 3.73
MEIS3-204ENST00000558555 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.33■■■■□ 3.73
MEIS3-204ENST00000558555 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.33■■■■□ 3.73
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF11O15085 1522 aa38.28■■■■□ 3.72
MEIS3-204ENST00000558555 CEP162Q5TB80 1403 aa38.26■■■■□ 3.71
MEIS3-204ENST00000558555 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.18■■■■□ 3.7
MEIS3-204ENST00000558555 NUP160Q12769 1436 aa38.15■■■■□ 3.7
MEIS3-204ENST00000558555 CEP170Q5SW79 1584 aa38.14■■■■□ 3.7
MEIS3-204ENST00000558555 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
MEIS3-204ENST00000558555 CLIP1P30622 1438 aa38.14■■■■□ 3.7
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.11■■■■□ 3.69
MEIS3-204ENST00000558555 IQGAP2Q13576 1575 aa38.11■■■■□ 3.69
MEIS3-204ENST00000558555 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.99■■■■□ 3.67
MEIS3-204ENST00000558555 ARAP1Q96P48 1450 aa37.96■■■■□ 3.67
MEIS3-204ENST00000558555 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.94■■■■□ 3.66
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.93■■■■□ 3.66
MEIS3-204ENST00000558555 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.9■■■■□ 3.66
MEIS3-204ENST00000558555 SAMD9Q5K651 1589 aa37.86■■■■□ 3.65
MEIS3-204ENST00000558555 JPH4Q96JJ6 628 aa37.81■■■■□ 3.64
MEIS3-204ENST00000558555 P3H3Q8IVL6 736 aa37.77■■■■□ 3.64
MEIS3-204ENST00000558555 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.75■■■■□ 3.63
MEIS3-204ENST00000558555 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.72■■■■□ 3.63
MEIS3-204ENST00000558555 SHROOM2Q13796 1616 aa37.72■■■■□ 3.63
MEIS3-204ENST00000558555 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.71■■■■□ 3.63
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA0556O60303 1618 aa37.71■■■■□ 3.63
MEIS3-204ENST00000558555 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.7■■■■□ 3.63
MEIS3-204ENST00000558555 DISP1Q96F81 1524 aa37.7■■■■□ 3.63
MEIS3-204ENST00000558555 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
MEIS3-204ENST00000558555 FMN1Q68DA7 1419 aa37.59■■■■□ 3.61
MEIS3-204ENST00000558555 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
MEIS3-204ENST00000558555 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
MEIS3-204ENST00000558555 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.41■■■■□ 3.58
MEIS3-204ENST00000558555 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.4■■■■□ 3.58
MEIS3-204ENST00000558555 APLP2Q06481 763 aa37.39■■■■□ 3.58
MEIS3-204ENST00000558555 PTPRGP23470 1445 aa37.36■■■■□ 3.57
MEIS3-204ENST00000558555 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
MEIS3-204ENST00000558555 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
MEIS3-204ENST00000558555 HECW1Q76N89 1606 aa37.28■■■■□ 3.56
MEIS3-204ENST00000558555 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.28■■■■□ 3.56
MEIS3-204ENST00000558555 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.22■■■■□ 3.55
MEIS3-204ENST00000558555 ABCA8O94911 1581 aa37.2■■■■□ 3.55
MEIS3-204ENST00000558555 MAP3K1Q13233 1512 aa37.19■■■■□ 3.54
MEIS3-204ENST00000558555 TIAM1Q13009 1591 aa37.16■■■■□ 3.54
MEIS3-204ENST00000558555 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.16■■■■□ 3.54
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.15■■■■□ 3.54
MEIS3-204ENST00000558555 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.14■■■■□ 3.54
MEIS3-204ENST00000558555 UACAQ9BZF9 1416 aa37.13■■■■□ 3.54
MEIS3-204ENST00000558555 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
MEIS3-204ENST00000558555 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
MEIS3-204ENST00000558555 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC2Q92887 1545 aa37.04■■■■□ 3.52
MEIS3-204ENST00000558555 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.04■■■■□ 3.52
MEIS3-204ENST00000558555 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
MEIS3-204ENST00000558555 ARID3CA6NKF2 412 aa37.02■■■■□ 3.52
MEIS3-204ENST00000558555 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37■■■■□ 3.51
MEIS3-204ENST00000558555 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.98■■■■□ 3.51
MEIS3-204ENST00000558555 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
MEIS3-204ENST00000558555 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
MEIS3-204ENST00000558555 ATP10BO94823 1461 aa36.92■■■■□ 3.5
MEIS3-204ENST00000558555 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.91■■■■□ 3.5
MEIS3-204ENST00000558555 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
MEIS3-204ENST00000558555 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
MEIS3-204ENST00000558555 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.87■■■■□ 3.49
MEIS3-204ENST00000558555 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.82■■■■□ 3.48
MEIS3-204ENST00000558555 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.81■■■■□ 3.48
MEIS3-204ENST00000558555 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.8■■■■□ 3.48
MEIS3-204ENST00000558555 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
MEIS3-204ENST00000558555 MAPKBP1O60336 1514 aa36.78■■■■□ 3.48
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.76■■■■□ 3.48
MEIS3-204ENST00000558555 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.47
MEIS3-204ENST00000558555 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.67■■■■□ 3.46
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
MEIS3-204ENST00000558555 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.66■■■■□ 3.46
MEIS3-204ENST00000558555 NCOA2Q15596 1464 aa36.65■■■■□ 3.46
MEIS3-204ENST00000558555 DIP2BQ9P265 1576 aa36.64■■■■□ 3.46
MEIS3-204ENST00000558555 KIF14Q15058 1648 aa36.59■■■■□ 3.45
MEIS3-204ENST00000558555 ASXL2Q76L83 1435 aa36.56■■■■□ 3.44
MEIS3-204ENST00000558555 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.56■■■■□ 3.44
MEIS3-204ENST00000558555 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.51■■■■□ 3.43
MEIS3-204ENST00000558555 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.47■■■■□ 3.43
MEIS3-204ENST00000558555 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.47■■■■□ 3.43
MEIS3-204ENST00000558555 TSPOAP1O95153 1857 aa36.46■■■■□ 3.43
MEIS3-204ENST00000558555 KCNH8Q96L42 1107 aa36.45■■■■□ 3.43
MEIS3-204ENST00000558555 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.42
MEIS3-204ENST00000558555 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.42■■■■□ 3.42
MEIS3-204ENST00000558555 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.4■■■■□ 3.42
MEIS3-204ENST00000558555 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.4■■■■□ 3.42
MEIS3-204ENST00000558555 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.41
MEIS3-204ENST00000558555 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.34■■■■□ 3.41
MEIS3-204ENST00000558555 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.34■■■■□ 3.41
MEIS3-204ENST00000558555 MIA2Q96PC5 1412 aa36.33■■■■□ 3.41
MEIS3-204ENST00000558555 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
MEIS3-204ENST00000558555 GLI2P10070 1586 aa36.31■■■■□ 3.4
MEIS3-204ENST00000558555 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.29■■■■□ 3.4
MEIS3-204ENST00000558555 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
MEIS3-204ENST00000558555 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.28■■■■□ 3.4
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