RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557846.5

CIB2-204, Transcript of calcium and integrin binding family member 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CIB2, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2-204ENST00000557846 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.18■■■■■ 4.66
CIB2-204ENST00000557846 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
CIB2-204ENST00000557846 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.15■■■■■ 4.66
CIB2-204ENST00000557846 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.09■■■■■ 4.65
CIB2-204ENST00000557846 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
CIB2-204ENST00000557846 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.9■■■■■ 4.62
CIB2-204ENST00000557846 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.88■■■■■ 4.62
CIB2-204ENST00000557846 IQGAP2Q13576 1575 aa43.84■■■■■ 4.61
CIB2-204ENST00000557846 PRXQ9BXM0 1461 aa43.81■■■■■ 4.6
CIB2-204ENST00000557846 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
CIB2-204ENST00000557846 EEA1Q15075 1411 aa43.79■■■■■ 4.6
CIB2-204ENST00000557846 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.78■■■■■ 4.6
CIB2-204ENST00000557846 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
CIB2-204ENST00000557846 PTPRGP23470 1445 aa43.65■■■■■ 4.58
CIB2-204ENST00000557846 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.62■■■■■ 4.57
CIB2-204ENST00000557846 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.62■■■■■ 4.57
CIB2-204ENST00000557846 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.57■■■■■ 4.57
CIB2-204ENST00000557846 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.57■■■■■ 4.56
CIB2-204ENST00000557846 DISP1Q96F81 1524 aa43.53■■■■■ 4.56
CIB2-204ENST00000557846 GOLGA3Q08378 1498 aa43.41■■■■■ 4.54
CIB2-204ENST00000557846 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.4■■■■■ 4.54
CIB2-204ENST00000557846 KIAA0556O60303 1618 aa43.4■■■■■ 4.54
CIB2-204ENST00000557846 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.31■■■■■ 4.52
CIB2-204ENST00000557846 UACAQ9BZF9 1416 aa43.3■■■■■ 4.52
CIB2-204ENST00000557846 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CIB2-204ENST00000557846 KIF21BO75037 1637 aa43.26■■■■■ 4.52
CIB2-204ENST00000557846 P3H3Q8IVL6 736 aa43.25■■■■■ 4.51
CIB2-204ENST00000557846 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
CIB2-204ENST00000557846 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.19■■■■■ 4.51
CIB2-204ENST00000557846 ABCC2Q92887 1545 aa43.19■■■■■ 4.5
CIB2-204ENST00000557846 MAPKBP1O60336 1514 aa43.18■■■■■ 4.5
CIB2-204ENST00000557846 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.15■■■■■ 4.5
CIB2-204ENST00000557846 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.07■■■■■ 4.49
CIB2-204ENST00000557846 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.06■■■■■ 4.48
CIB2-204ENST00000557846 SAMD9Q5K651 1589 aa42.99■■■■■ 4.47
CIB2-204ENST00000557846 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.99■■■■■ 4.47
CIB2-204ENST00000557846 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.99■■■■■ 4.47
CIB2-204ENST00000557846 ASXL2Q76L83 1435 aa42.98■■■■■ 4.47
CIB2-204ENST00000557846 ABCA8O94911 1581 aa42.94■■■■■ 4.46
CIB2-204ENST00000557846 DIP2BQ9P265 1576 aa42.94■■■■■ 4.46
CIB2-204ENST00000557846 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
CIB2-204ENST00000557846 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.87■■■■■ 4.45
CIB2-204ENST00000557846 ARID3CA6NKF2 412 aa42.85■■■■■ 4.45
CIB2-204ENST00000557846 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.82■■■■■ 4.45
CIB2-204ENST00000557846 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
CIB2-204ENST00000557846 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
CIB2-204ENST00000557846 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.7■■■■■ 4.43
CIB2-204ENST00000557846 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.7■■■■■ 4.43
CIB2-204ENST00000557846 KCNH8Q96L42 1107 aa42.69■■■■■ 4.42
CIB2-204ENST00000557846 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
CIB2-204ENST00000557846 GLI2P10070 1586 aa42.66■■■■■ 4.42
CIB2-204ENST00000557846 ATP10BO94823 1461 aa42.65■■■■■ 4.42
CIB2-204ENST00000557846 TSPOAP1O95153 1857 aa42.65■■■■■ 4.42
CIB2-204ENST00000557846 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.59■■■■■ 4.41
CIB2-204ENST00000557846 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
CIB2-204ENST00000557846 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
CIB2-204ENST00000557846 FMN1Q68DA7 1419 aa42.52■■■■■ 4.4
CIB2-204ENST00000557846 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.44■■■■■ 4.38
CIB2-204ENST00000557846 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.43■■■■■ 4.38
CIB2-204ENST00000557846 CD109Q6YHK3 1445 aa42.4■■■■■ 4.38
CIB2-204ENST00000557846 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.39■■■■■ 4.38
CIB2-204ENST00000557846 KDM6BO15054 1643 aa42.38■■■■■ 4.38
CIB2-204ENST00000557846 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
CIB2-204ENST00000557846 CLIP1P30622 1438 aa42.35■■■■■ 4.37
CIB2-204ENST00000557846 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.31■■■■■ 4.36
CIB2-204ENST00000557846 HECW1Q76N89 1606 aa42.28■■■■■ 4.36
CIB2-204ENST00000557846 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CIB2-204ENST00000557846 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.24■■■■■ 4.35
CIB2-204ENST00000557846 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
CIB2-204ENST00000557846 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.18■■■■■ 4.34
CIB2-204ENST00000557846 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.16■■■■■ 4.34
CIB2-204ENST00000557846 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.12■■■■■ 4.33
CIB2-204ENST00000557846 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
CIB2-204ENST00000557846 CEP162Q5TB80 1403 aa42.07■■■■■ 4.33
CIB2-204ENST00000557846 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CIB2-204ENST00000557846 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.98■■■■■ 4.31
CIB2-204ENST00000557846 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.98■■■■■ 4.31
CIB2-204ENST00000557846 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
CIB2-204ENST00000557846 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.97■■■■■ 4.31
CIB2-204ENST00000557846 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
CIB2-204ENST00000557846 NEO1Q92859 1461 aa41.92■■■■■ 4.3
CIB2-204ENST00000557846 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.91■■■■■ 4.3
CIB2-204ENST00000557846 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CIB2-204ENST00000557846 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.88■■■■■ 4.3
CIB2-204ENST00000557846 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.88■■■■■ 4.29
CIB2-204ENST00000557846 KIF14Q15058 1648 aa41.83■■■■■ 4.29
CIB2-204ENST00000557846 FANCAO15360 1455 aa41.82■■■■■ 4.29
CIB2-204ENST00000557846 RAPGEF3O95398 923 aa41.79■■■■■ 4.28
CIB2-204ENST00000557846 PLCH2O75038 1416 aa41.78■■■■■ 4.28
CIB2-204ENST00000557846 AKNAQ7Z591 1439 aa41.78■■■■■ 4.28
CIB2-204ENST00000557846 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.74■■■■■ 4.27
CIB2-204ENST00000557846 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.74■■■■■ 4.27
CIB2-204ENST00000557846 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
CIB2-204ENST00000557846 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.66■■■■■ 4.26
CIB2-204ENST00000557846 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.64■■■■■ 4.26
CIB2-204ENST00000557846 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.61■■■■■ 4.25
CIB2-204ENST00000557846 ADGRL1O94910 1474 aa41.6■■■■■ 4.25
CIB2-204ENST00000557846 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.58■■■■■ 4.25
CIB2-204ENST00000557846 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.58■■■■■ 4.25
CIB2-204ENST00000557846 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.56■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms