RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557569.1

CKB-217, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-217ENST00000557569 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.98■■■■■ 5.11
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CKB-217ENST00000557569 MAPKBP1O60336 1514 aa46.76■■■■■ 5.08
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CKB-217ENST00000557569 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.73■■■■■ 5.07
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CKB-217ENST00000557569 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
CKB-217ENST00000557569 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.52■■■■■ 4.72
CKB-217ENST00000557569 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
CKB-217ENST00000557569 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.5■■■■■ 4.71
CKB-217ENST00000557569 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
CKB-217ENST00000557569 MADDQ8WXG6 1647 aa44.46■■■■■ 4.71
CKB-217ENST00000557569 FBXO41Q8TF61 875 aa44.44■■■■■ 4.7
CKB-217ENST00000557569 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.39■■■■■ 4.7
CKB-217ENST00000557569 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.38■■■■■ 4.7
CKB-217ENST00000557569 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
CKB-217ENST00000557569 AKNAQ7Z591 1439 aa44.36■■■■■ 4.69
CKB-217ENST00000557569 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
CKB-217ENST00000557569 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.34■■■■■ 4.69
CKB-217ENST00000557569 EEA1Q15075 1411 aa44.33■■■■■ 4.69
CKB-217ENST00000557569 RICTORQ6R327 1708 aa44.33■■■■■ 4.69
CKB-217ENST00000557569 FANCAO15360 1455 aa44.32■■■■■ 4.69
CKB-217ENST00000557569 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.31■■■■■ 4.683e-6■□□□□ 8.9
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CKB-217ENST00000557569 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
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CKB-217ENST00000557569 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.16■■■■■ 4.66
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CKB-217ENST00000557569 HECW1Q76N89 1606 aa44.05■■■■■ 4.64
CKB-217ENST00000557569 PLCH2O75038 1416 aa44.03■■■■■ 4.64
CKB-217ENST00000557569 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.02■■■■■ 4.64
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