RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PPP4R4-204	ENST00000555690	CUL7	Q14999	1698 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.51	■■■■■ 4.39
PPP4R4-204	ENST00000555690	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.42	■■■■■ 4.38
PPP4R4-204	ENST00000555690	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.34	■■■■■ 4.37
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.24	■■■■■ 4.35
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.21	■■■■■ 4.35
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PPP4R4-204	ENST00000555690	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.15	■■■■■ 4.34
PPP4R4-204	ENST00000555690	PTPRG	P23470	1445 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PPP4R4-204	ENST00000555690	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
PPP4R4-204	ENST00000555690	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PPP4R4-204	ENST00000555690	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PPP4R4-204	ENST00000555690	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.05	■■■■■ 4.32
PPP4R4-204	ENST00000555690	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.03	■■■■■ 4.32
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.01	■■■■■ 4.32
PPP4R4-204	ENST00000555690	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.9	■■■■■ 4.3
PPP4R4-204	ENST00000555690	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PPP4R4-204	ENST00000555690	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PPP4R4-204	ENST00000555690	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.8	■■■■■ 4.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.79	■■■■■ 4.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.76	■■■■■ 4.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.7	■■■■■ 4.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.69	■■■■■ 4.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	KDM6B	O15054	1643 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.61	■■■■■ 4.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	GLI2	P10070	1586 aa		41.57	■■■■■ 4.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.5	■■■■■ 4.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.48	■■■■■ 4.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PPP4R4-204	ENST00000555690	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PPP4R4-204	ENST00000555690	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PPP4R4-204	ENST00000555690	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PPP4R4-204	ENST00000555690	ABCA8	O94911	1581 aa		41.31	■■■■■ 4.2
PPP4R4-204	ENST00000555690	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.26	■■■■■ 4.2
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.2
PPP4R4-204	ENST00000555690	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.24	■■■■■ 4.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.22	■■■■■ 4.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.16	■■■■■ 4.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.12	■■■■■ 4.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.1	■■■■■ 4.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	EEA1	Q15075	1411 aa		41.07	■■■■■ 4.16
PPP4R4-204	ENST00000555690	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.03	■■■■■ 4.16
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.03	■■■■■ 4.16
PPP4R4-204	ENST00000555690	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.02	■■■■■ 4.16
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP10B	O94823	1461 aa		41.02	■■■■■ 4.16
PPP4R4-204	ENST00000555690	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.95	■■■■■ 4.15
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.87	■■■■■ 4.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.83	■■■■■ 4.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF21B	O75037	1637 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.63	■■■■■ 4.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.6	■■■■■ 4.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.56	■■■■■ 4.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.56	■■■■■ 4.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	NEO1	Q92859	1461 aa		40.55	■■■■■ 4.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.37	■■■■■ 4.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	FANCA	O15360	1455 aa		40.32	■■■■■ 4.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLCH2	O75038	1416 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	PTPRM	P28827	1452 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.13	■■■■■ 4.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.07	■■■■■ 4
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.05	■■■■■ 4
PPP4R4-204	ENST00000555690	MADD	Q8WXG6	1647 aa		40.03	■■■■■ 4
PPP4R4-204	ENST00000555690	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		40.03	■■■■■ 4
PPP4R4-204	ENST00000555690	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
PPP4R4-204	ENST00000555690	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		40.01	■■■■□ 3.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99

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