RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-204ENST00000555690 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.06■■■■■ 7.36
PPP4R4-204ENST00000555690 ABCC9O60706 1549 aa54.71■■■■■ 6.35
PPP4R4-204ENST00000555690 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.65■■■■■ 6.34
PPP4R4-204ENST00000555690 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.04■■■■■ 5.92
PPP4R4-204ENST00000555690 NACADO15069 1562 aa51.7■■■■■ 5.87
PPP4R4-204ENST00000555690 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.65■■■■■ 5.86
PPP4R4-204ENST00000555690 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.31■■■■■ 5.8
PPP4R4-204ENST00000555690 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.03■■■■■ 5.76
PPP4R4-204ENST00000555690 MYO15BQ96JP2 1530 aa51■■■■■ 5.75
PPP4R4-204ENST00000555690 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.83■■■■■ 5.73
PPP4R4-204ENST00000555690 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
PPP4R4-204ENST00000555690 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.54■■■■■ 5.68
PPP4R4-204ENST00000555690 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.39■■■■■ 5.66
PPP4R4-204ENST00000555690 SCRIBQ14160 1630 aa49.89■■■■■ 5.58
PPP4R4-204ENST00000555690 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.81■■■■■ 5.56
PPP4R4-204ENST00000555690 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.38■■■■■ 5.49
PPP4R4-204ENST00000555690 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.29■■■■■ 5.48
PPP4R4-204ENST00000555690 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.26■■■■■ 5.48
PPP4R4-204ENST00000555690 NCAPD3P42695 1498 aa47.78■■■■■ 5.24
PPP4R4-204ENST00000555690 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.65■■■■■ 5.22
PPP4R4-204ENST00000555690 SMARCA4P51532 1647 aa47.59■■■■■ 5.21
PPP4R4-204ENST00000555690 SMARCA2P51531 1590 aa47.48■■■■■ 5.19
PPP4R4-204ENST00000555690 HMGXB3Q12766 1538 aa47.38■■■■■ 5.18
PPP4R4-204ENST00000555690 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
PPP4R4-204ENST00000555690 ERCC6Q03468 1493 aa47.21■■■■■ 5.15
PPP4R4-204ENST00000555690 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
PPP4R4-204ENST00000555690 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.1■■■■■ 5.13
PPP4R4-204ENST00000555690 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.07■■■■■ 5.12
PPP4R4-204ENST00000555690 CUX2O14529 1486 aa47.05■■■■■ 5.12
PPP4R4-204ENST00000555690 NESP48681 1621 aa47.03■■■■■ 5.12
PPP4R4-204ENST00000555690 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.01■■■■■ 5.12
PPP4R4-204ENST00000555690 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.64■■■■■ 5.06
PPP4R4-204ENST00000555690 WIZO95785 1651 aa46.49■■■■■ 5.03
PPP4R4-204ENST00000555690 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
PPP4R4-204ENST00000555690 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.42■■■■■ 5.02
PPP4R4-204ENST00000555690 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.35■■■■■ 5.01
PPP4R4-204ENST00000555690 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.35■■■■■ 5.01
PPP4R4-204ENST00000555690 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
PPP4R4-204ENST00000555690 MRC2Q9UBG0 1479 aa46■■■■■ 4.95
PPP4R4-204ENST00000555690 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
PPP4R4-204ENST00000555690 WDR62O43379 1518 aa45.85■■■■■ 4.93
PPP4R4-204ENST00000555690 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.83■■■■■ 4.93
PPP4R4-204ENST00000555690 CFTRP13569 1480 aa45.82■■■■■ 4.93
PPP4R4-204ENST00000555690 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.81■■■■■ 4.92
PPP4R4-204ENST00000555690 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.42■■■■■ 4.86
PPP4R4-204ENST00000555690 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
PPP4R4-204ENST00000555690 PRDM2Q13029 1718 aa45.25■■■■■ 4.83
PPP4R4-204ENST00000555690 TRIM41Q8WV44 630 aa45.04■■■■■ 4.8
PPP4R4-204ENST00000555690 OSCARQ8IYS5 282 aa45.02■■■■■ 4.8
PPP4R4-204ENST00000555690 TOPBP1Q92547 1522 aa44.95■■■■■ 4.79
PPP4R4-204ENST00000555690 IFT140Q96RY7 1462 aa44.91■■■■■ 4.78
PPP4R4-204ENST00000555690 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
PPP4R4-204ENST00000555690 ABCC8Q09428 1581 aa44.83■■■■■ 4.77
PPP4R4-204ENST00000555690 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.76■■■■■ 4.76
PPP4R4-204ENST00000555690 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
PPP4R4-204ENST00000555690 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
PPP4R4-204ENST00000555690 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.51■■■■■ 4.72
PPP4R4-204ENST00000555690 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
PPP4R4-204ENST00000555690 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.37■■■■■ 4.69
PPP4R4-204ENST00000555690 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.33■■■■■ 4.69
PPP4R4-204ENST00000555690 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.33■■■■■ 4.69
PPP4R4-204ENST00000555690 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.33■■■■■ 4.69
PPP4R4-204ENST00000555690 SOGA1O94964 1423 aa44.33■■■■■ 4.69
PPP4R4-204ENST00000555690 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
PPP4R4-204ENST00000555690 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
PPP4R4-204ENST00000555690 FBLN2P98095 1184 aa44.24■■■■■ 4.67
PPP4R4-204ENST00000555690 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.23■■■■■ 4.67
PPP4R4-204ENST00000555690 ARHGEF11O15085 1522 aa44.23■■■■■ 4.67
PPP4R4-204ENST00000555690 CUX1P39880 1505 aa44.21■■■■■ 4.67
PPP4R4-204ENST00000555690 CHD1O14646 1710 aa44.21■■■■■ 4.67
PPP4R4-204ENST00000555690 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.01■■■■■ 4.64
PPP4R4-204ENST00000555690 WDR97A6NE52 1622 aa44■■■■■ 4.63
PPP4R4-204ENST00000555690 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.99■■■■■ 4.63
PPP4R4-204ENST00000555690 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
PPP4R4-204ENST00000555690 GRIN2BQ13224 1484 aa43.89■■■■■ 4.62
PPP4R4-204ENST00000555690 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
PPP4R4-204ENST00000555690 ARAP1Q96P48 1450 aa43.8■■■■■ 4.6
PPP4R4-204ENST00000555690 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.77■■■■■ 4.6
PPP4R4-204ENST00000555690 SYNJ2O15056 1496 aa43.74■■■■■ 4.59
PPP4R4-204ENST00000555690 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.72■■■■■ 4.59
PPP4R4-204ENST00000555690 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.72■■■■■ 4.59
PPP4R4-204ENST00000555690 SYNJ1O43426 1573 aa43.7■■■■■ 4.59
PPP4R4-204ENST00000555690 PBRM1Q86U86 1689 aa43.66■■■■■ 4.58
PPP4R4-204ENST00000555690 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.61■■■■■ 4.57
PPP4R4-204ENST00000555690 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.59■■■■■ 4.57
PPP4R4-204ENST00000555690 TOP2BQ02880 1626 aa43.49■■■■■ 4.55
PPP4R4-204ENST00000555690 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
PPP4R4-204ENST00000555690 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.47■■■■■ 4.55
PPP4R4-204ENST00000555690 GRIN2AQ12879 1464 aa43.33■■■■■ 4.53
PPP4R4-204ENST00000555690 ADAMTS12P58397 1594 aa43.29■■■■■ 4.52
PPP4R4-204ENST00000555690 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.22■■■■■ 4.51
PPP4R4-204ENST00000555690 NUP160Q12769 1436 aa43.18■■■■■ 4.5
PPP4R4-204ENST00000555690 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.16■■■■■ 4.5
PPP4R4-204ENST00000555690 CEP170Q5SW79 1584 aa43.16■■■■■ 4.5
PPP4R4-204ENST00000555690 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.09■■■■■ 4.49
PPP4R4-204ENST00000555690 SHROOM2Q13796 1616 aa42.93■■■■■ 4.46
PPP4R4-204ENST00000555690 JPH4Q96JJ6 628 aa42.81■■■■■ 4.44
PPP4R4-204ENST00000555690 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
PPP4R4-204ENST00000555690 IGF1RP08069 1367 aa42.71■■■■■ 4.43
PPP4R4-204ENST00000555690 KIF27Q86VH2 1401 aa42.69■■■■■ 4.42
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