RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555359.1

NSFL1C-211, Transcript of NSFL1 cofactor, humanhuman

TSL 3

Gene NSFL1C, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1C-211ENST00000555359 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.57■■■■□ 3.44
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NSFL1C-211ENST00000555359 CUL7Q14999 1698 aa36.42■■■■□ 3.42
NSFL1C-211ENST00000555359 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
NSFL1C-211ENST00000555359 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
NSFL1C-211ENST00000555359 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.31■■■■□ 3.4
NSFL1C-211ENST00000555359 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.27■■■■□ 3.4
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NSFL1C-211ENST00000555359 PTPRGP23470 1445 aa36.2■■■■□ 3.39
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NSFL1C-211ENST00000555359 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.12■■■■□ 3.37
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NSFL1C-211ENST00000555359 IQGAP2Q13576 1575 aa36.07■■■■□ 3.37
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NSFL1C-211ENST00000555359 DIP2BQ9P265 1576 aa36.04■■■■□ 3.36
NSFL1C-211ENST00000555359 DISP1Q96F81 1524 aa35.95■■■■□ 3.35
NSFL1C-211ENST00000555359 ABCC2Q92887 1545 aa35.92■■■■□ 3.34
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NSFL1C-211ENST00000555359 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.85■■■■□ 3.33
NSFL1C-211ENST00000555359 ASXL2Q76L83 1435 aa35.84■■■■□ 3.33
NSFL1C-211ENST00000555359 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.83■■■■□ 3.33
NSFL1C-211ENST00000555359 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.78■■■■□ 3.32
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NSFL1C-211ENST00000555359 KIAA0556O60303 1618 aa35.74■■■■□ 3.31
NSFL1C-211ENST00000555359 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.68■■■■□ 3.3
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NSFL1C-211ENST00000555359 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
NSFL1C-211ENST00000555359 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.54■■■■□ 3.28
NSFL1C-211ENST00000555359 P3H3Q8IVL6 736 aa35.54■■■■□ 3.28
NSFL1C-211ENST00000555359 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.53■■■■□ 3.28
NSFL1C-211ENST00000555359 KCNH8Q96L42 1107 aa35.5■■■■□ 3.27
NSFL1C-211ENST00000555359 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.45■■■■□ 3.27
NSFL1C-211ENST00000555359 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.44■■■■□ 3.26
NSFL1C-211ENST00000555359 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
NSFL1C-211ENST00000555359 ARID3CA6NKF2 412 aa35.44■■■■□ 3.26
NSFL1C-211ENST00000555359 ABCA8O94911 1581 aa35.43■■■■□ 3.26
NSFL1C-211ENST00000555359 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
NSFL1C-211ENST00000555359 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.37■■■■□ 3.25
NSFL1C-211ENST00000555359 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
NSFL1C-211ENST00000555359 CD109Q6YHK3 1445 aa35.31■■■■□ 3.24
NSFL1C-211ENST00000555359 ATP10BO94823 1461 aa35.23■■■■□ 3.23
NSFL1C-211ENST00000555359 EEA1Q15075 1411 aa35.2■■■■□ 3.23
NSFL1C-211ENST00000555359 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.18■■■■□ 3.22
NSFL1C-211ENST00000555359 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
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NSFL1C-211ENST00000555359 SAMD9Q5K651 1589 aa35.16■■■■□ 3.22
NSFL1C-211ENST00000555359 ADGRL1O94910 1474 aa35.16■■■■□ 3.22
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NSFL1C-211ENST00000555359 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.06■■■■□ 3.2
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NSFL1C-211ENST00000555359 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.92■■■■□ 3.18
NSFL1C-211ENST00000555359 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.91■■■■□ 3.18
NSFL1C-211ENST00000555359 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.91■■■■□ 3.18
NSFL1C-211ENST00000555359 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
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NSFL1C-211ENST00000555359 KIF21BO75037 1637 aa34.9■■■■□ 3.18
NSFL1C-211ENST00000555359 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.85■■■■□ 3.17
NSFL1C-211ENST00000555359 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.8■■■■□ 3.16
NSFL1C-211ENST00000555359 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
NSFL1C-211ENST00000555359 NEO1Q92859 1461 aa34.77■■■■□ 3.16
NSFL1C-211ENST00000555359 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
NSFL1C-211ENST00000555359 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.64■■■■□ 3.14
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NSFL1C-211ENST00000555359 AKNAQ7Z591 1439 aa34.64■■■■□ 3.14
NSFL1C-211ENST00000555359 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
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NSFL1C-211ENST00000555359 FANCAO15360 1455 aa34.59■■■■□ 3.13
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NSFL1C-211ENST00000555359 PLCH2O75038 1416 aa34.46■■■■□ 3.11
NSFL1C-211ENST00000555359 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.45■■■■□ 3.11
NSFL1C-211ENST00000555359 HECW1Q76N89 1606 aa34.45■■■■□ 3.11
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NSFL1C-211ENST00000555359 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.41■■■■□ 3.1
NSFL1C-211ENST00000555359 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.4■■■■□ 3.1
NSFL1C-211ENST00000555359 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.39■■■■□ 3.1
NSFL1C-211ENST00000555359 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.38■■■■□ 3.09
NSFL1C-211ENST00000555359 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.36■■■■□ 3.09
NSFL1C-211ENST00000555359 MADDQ8WXG6 1647 aa34.35■■■■□ 3.09
NSFL1C-211ENST00000555359 MLECQ14165 292 aa34.33■■■■□ 3.09
NSFL1C-211ENST00000555359 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
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