RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554894.5

LINC01578-204, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01578, Length 556 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-204ENST00000554894 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.46■■■■■ 5.35
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LINC01578-204ENST00000554894 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.31■■■■■ 5.32
LINC01578-204ENST00000554894 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.15■■■■■ 5.3
LINC01578-204ENST00000554894 IQGAP2Q13576 1575 aa48.1■■■■■ 5.29
LINC01578-204ENST00000554894 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.89■■■■■ 5.26
LINC01578-204ENST00000554894 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.87■■■■■ 5.25
LINC01578-204ENST00000554894 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.86■■■■■ 5.25
LINC01578-204ENST00000554894 PRXQ9BXM0 1461 aa47.84■■■■■ 5.25
LINC01578-204ENST00000554894 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.79■■■■■ 5.24
LINC01578-204ENST00000554894 DISP1Q96F81 1524 aa47.78■■■■■ 5.24
LINC01578-204ENST00000554894 PTPRGP23470 1445 aa47.77■■■■■ 5.24
LINC01578-204ENST00000554894 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.76■■■■■ 5.24
LINC01578-204ENST00000554894 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.71■■■■■ 5.23
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LINC01578-204ENST00000554894 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.67■■■■■ 5.22
LINC01578-204ENST00000554894 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.66■■■■■ 5.22
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LINC01578-204ENST00000554894 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.48■■■■■ 5.19
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LINC01578-204ENST00000554894 DIP2BQ9P265 1576 aa47.46■■■■■ 5.19
LINC01578-204ENST00000554894 UACAQ9BZF9 1416 aa47.46■■■■■ 5.19
LINC01578-204ENST00000554894 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.46■■■■■ 5.19
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LINC01578-204ENST00000554894 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.37■■■■■ 5.17
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LINC01578-204ENST00000554894 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.25■■■■■ 5.15
LINC01578-204ENST00000554894 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.23■■■■■ 5.15
LINC01578-204ENST00000554894 ASXL2Q76L83 1435 aa47.23■■■■■ 5.15
LINC01578-204ENST00000554894 KIF21BO75037 1637 aa47.23■■■■■ 5.15
LINC01578-204ENST00000554894 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.22■■■■■ 5.15
LINC01578-204ENST00000554894 ABCA8O94911 1581 aa47.16■■■■■ 5.14
LINC01578-204ENST00000554894 SAMD9Q5K651 1589 aa47.15■■■■■ 5.14
LINC01578-204ENST00000554894 TSPOAP1O95153 1857 aa47.12■■■■■ 5.13
LINC01578-204ENST00000554894 P3H3Q8IVL6 736 aa47.07■■■■■ 5.13
LINC01578-204ENST00000554894 GLI2P10070 1586 aa47.03■■■■■ 5.12
LINC01578-204ENST00000554894 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
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LINC01578-204ENST00000554894 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.91■■■■■ 5.1
LINC01578-204ENST00000554894 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
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LINC01578-204ENST00000554894 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.85■■■■■ 5.09
LINC01578-204ENST00000554894 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.84■■■■■ 5.09
LINC01578-204ENST00000554894 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.83■■■■■ 5.09
LINC01578-204ENST00000554894 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.83■■■■■ 5.09
LINC01578-204ENST00000554894 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.8■■■■■ 5.08
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LINC01578-204ENST00000554894 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.6■■■■■ 5.05
LINC01578-204ENST00000554894 KCNH8Q96L42 1107 aa46.6■■■■■ 5.05
LINC01578-204ENST00000554894 CD109Q6YHK3 1445 aa46.5■■■■■ 5.03
LINC01578-204ENST00000554894 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.48■■■■■ 5.03
LINC01578-204ENST00000554894 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.46■■■■■ 5.03
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LINC01578-204ENST00000554894 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.28■■■■■ 5
LINC01578-204ENST00000554894 HECW1Q76N89 1606 aa46.27■■■■■ 5
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LINC01578-204ENST00000554894 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.12■■■■■ 4.97
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LINC01578-204ENST00000554894 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.05■■■■■ 4.96
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LINC01578-204ENST00000554894 NEO1Q92859 1461 aa46.02■■■■■ 4.96
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LINC01578-204ENST00000554894 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.89■■■■■ 4.94
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LINC01578-204ENST00000554894 FANCAO15360 1455 aa45.84■■■■■ 4.93
LINC01578-204ENST00000554894 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.84■■■■■ 4.93
LINC01578-204ENST00000554894 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.81■■■■■ 4.92
LINC01578-204ENST00000554894 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
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LINC01578-204ENST00000554894 RAPGEF3O95398 923 aa45.78■■■■■ 4.92
LINC01578-204ENST00000554894 AKNAQ7Z591 1439 aa45.77■■■■■ 4.92
LINC01578-204ENST00000554894 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.77■■■■■ 4.92
LINC01578-204ENST00000554894 RICTORQ6R327 1708 aa45.72■■■■■ 4.91
LINC01578-204ENST00000554894 PLCH2O75038 1416 aa45.72■■■■■ 4.91
LINC01578-204ENST00000554894 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.91
LINC01578-204ENST00000554894 CEP162Q5TB80 1403 aa45.66■■■■■ 4.9
LINC01578-204ENST00000554894 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.55■■■■■ 4.88
LINC01578-204ENST00000554894 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.53■■■■■ 4.88
LINC01578-204ENST00000554894 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.52■■■■■ 4.88
LINC01578-204ENST00000554894 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.51■■■■■ 4.88
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