RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 DIP2BQ9P265 1576 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-231ENST00000552222 KDM6BO15054 1643 aa24.94■■□□□ 1.58
CS-231ENST00000552222 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
CS-231ENST00000552222 TSPOAP1O95153 1857 aa24.94■■□□□ 1.58
CS-231ENST00000552222 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.94■■□□□ 1.58
CS-231ENST00000552222 MAPKBP1O60336 1514 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-231ENST00000552222 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-231ENST00000552222 TOP2BQ02880 1626 aa24.86■■□□□ 1.57
CS-231ENST00000552222 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.86■■□□□ 1.57
CS-231ENST00000552222 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-231ENST00000552222 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CS-231ENST00000552222 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CS-231ENST00000552222 ADGRL1O94910 1474 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-231ENST00000552222 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CS-231ENST00000552222 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
CS-231ENST00000552222 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.63■■□□□ 1.53
CS-231ENST00000552222 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.61■■□□□ 1.53
CS-231ENST00000552222 PTPRGP23470 1445 aa24.61■■□□□ 1.53
CS-231ENST00000552222 ASXL2Q76L83 1435 aa24.59■■□□□ 1.53
CS-231ENST00000552222 IGF1RP08069 1367 aa24.56■■□□□ 1.52
CS-231ENST00000552222 ABCC2Q92887 1545 aa24.51■■□□□ 1.51
CS-231ENST00000552222 CUL7Q14999 1698 aa24.47■■□□□ 1.51
CS-231ENST00000552222 GLI2P10070 1586 aa24.46■■□□□ 1.51
CS-231ENST00000552222 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.45■■□□□ 1.5
CS-231ENST00000552222 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.45■■□□□ 1.5
CS-231ENST00000552222 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CS-231ENST00000552222 UACAQ9BZF9 1416 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-231ENST00000552222 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-231ENST00000552222 KIF27Q86VH2 1401 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-231ENST00000552222 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-231ENST00000552222 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-231ENST00000552222 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
CS-231ENST00000552222 DISP1Q96F81 1524 aa24.32■■□□□ 1.48
CS-231ENST00000552222 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-231ENST00000552222 IQGAP2Q13576 1575 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-231ENST00000552222 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-231ENST00000552222 FBXO41Q8TF61 875 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-231ENST00000552222 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-231ENST00000552222 KCNH8Q96L42 1107 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-231ENST00000552222 KIF21BO75037 1637 aa24.18■■□□□ 1.46
CS-231ENST00000552222 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-231ENST00000552222 CD109Q6YHK3 1445 aa24.13■■□□□ 1.45
CS-231ENST00000552222 KIAA0556O60303 1618 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-231ENST00000552222 ARID3CA6NKF2 412 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-231ENST00000552222 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-231ENST00000552222 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-231ENST00000552222 PTPRMP28827 1452 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-231ENST00000552222 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-231ENST00000552222 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-231ENST00000552222 RAPGEF3O95398 923 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-231ENST00000552222 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-231ENST00000552222 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-231ENST00000552222 ABCA8O94911 1581 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-231ENST00000552222 HSPA2P54652 639 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-231ENST00000552222 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.89■■□□□ 1.42
CS-231ENST00000552222 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.89■■□□□ 1.42
CS-231ENST00000552222 P3H3Q8IVL6 736 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-231ENST00000552222 MADDQ8WXG6 1647 aa23.87■■□□□ 1.41
CS-231ENST00000552222 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CS-231ENST00000552222 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CS-231ENST00000552222 ILDR2Q71H61 639 aa23.86■■□□□ 1.41
CS-231ENST00000552222 ATP10BO94823 1461 aa23.81■■□□□ 1.4
CS-231ENST00000552222 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-231ENST00000552222 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-231ENST00000552222 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.77■■□□□ 1.4
CS-231ENST00000552222 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CS-231ENST00000552222 CERKQ8TCT0 537 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-231ENST00000552222 GOLGA3Q08378 1498 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-231ENST00000552222 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-231ENST00000552222 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-231ENST00000552222 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CS-231ENST00000552222 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CS-231ENST00000552222 MLECQ14165 292 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-231ENST00000552222 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-231ENST00000552222 NEO1Q92859 1461 aa23.63■■□□□ 1.37
CS-231ENST00000552222 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-231ENST00000552222 SOCS7O14512 581 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-231ENST00000552222 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CS-231ENST00000552222 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-231ENST00000552222 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-231ENST00000552222 PRXQ9BXM0 1461 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-231ENST00000552222 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CS-231ENST00000552222 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CS-231ENST00000552222 RICTORQ6R327 1708 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-231ENST00000552222 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.51■■□□□ 1.35
CS-231ENST00000552222 AKNAQ7Z591 1439 aa23.51■■□□□ 1.35
CS-231ENST00000552222 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CS-231ENST00000552222 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-231ENST00000552222 FANCAO15360 1455 aa23.46■■□□□ 1.35
CS-231ENST00000552222 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-231ENST00000552222 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CS-231ENST00000552222 SAMD9Q5K651 1589 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-231ENST00000552222 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-231ENST00000552222 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.342e-20■□□□□ 10.1
CS-231ENST00000552222 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-231ENST00000552222 HECW1Q76N89 1606 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-231ENST00000552222 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-231ENST00000552222 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-231ENST00000552222 STRCQ7RTU9 1775 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-231ENST00000552222 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.38■■□□□ 1.33
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