RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		19.73	■□□□□ 0.75
CS-223	ENST00000551137	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		19.72	■□□□□ 0.75
CS-223	ENST00000551137	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
CS-223	ENST00000551137	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	19.63	■□□□□ 0.73
CS-223	ENST00000551137	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		19.59	■□□□□ 0.73
CS-223	ENST00000551137	IQGAP2	Q13576	1575 aa		19.53	■□□□□ 0.72
CS-223	ENST00000551137	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		19.5	■□□□□ 0.71
CS-223	ENST00000551137	PRX	Q9BXM0	1461 aa		19.48	■□□□□ 0.71
CS-223	ENST00000551137	PTPRG	P23470	1445 aa		19.46	■□□□□ 0.71
CS-223	ENST00000551137	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		19.46	■□□□□ 0.71
CS-223	ENST00000551137	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		19.45	■□□□□ 0.7
CS-223	ENST00000551137	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		19.43	■□□□□ 0.7
CS-223	ENST00000551137	DISP1	Q96F81	1524 aa		19.43	■□□□□ 0.7
CS-223	ENST00000551137	MAPKBP1	O60336	1514 aa		19.42	■□□□□ 0.7
CS-223	ENST00000551137	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	19.42	■□□□□ 0.7
CS-223	ENST00000551137	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		19.39	■□□□□ 0.69
CS-223	ENST00000551137	EEA1	Q15075	1411 aa		19.39	■□□□□ 0.69
CS-223	ENST00000551137	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		19.37	■□□□□ 0.69
CS-223	ENST00000551137	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		19.36	■□□□□ 0.69
CS-223	ENST00000551137	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		19.35	■□□□□ 0.69
CS-223	ENST00000551137	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		19.35	■□□□□ 0.69
CS-223	ENST00000551137	KIAA0556	O60303	1618 aa		19.33	■□□□□ 0.69
CS-223	ENST00000551137	ABCC2	Q92887	1545 aa		19.33	■□□□□ 0.68
CS-223	ENST00000551137	UACA	Q9BZF9	1416 aa		19.33	■□□□□ 0.68
CS-223	ENST00000551137	GOLGA3	Q08378	1498 aa		19.31	■□□□□ 0.68
CS-223	ENST00000551137	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		19.28	■□□□□ 0.68
CS-223	ENST00000551137	DIP2B	Q9P265	1576 aa		19.27	■□□□□ 0.68
CS-223	ENST00000551137	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
CS-223	ENST00000551137	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		19.26	■□□□□ 0.67
CS-223	ENST00000551137	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		19.26	■□□□□ 0.67
CS-223	ENST00000551137	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		19.23	■□□□□ 0.67
CS-223	ENST00000551137	ASXL2	Q76L83	1435 aa		19.21	■□□□□ 0.67
CS-223	ENST00000551137	ABCA8	O94911	1581 aa		19.17	■□□□□ 0.66
CS-223	ENST00000551137	GLI2	P10070	1586 aa		19.17	■□□□□ 0.66
CS-223	ENST00000551137	KIF21B	O75037	1637 aa		19.16	■□□□□ 0.66
CS-223	ENST00000551137	SAMD9	Q5K651	1589 aa		19.15	■□□□□ 0.66
CS-223	ENST00000551137	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	19.14	■□□□□ 0.65
CS-223	ENST00000551137	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	19.13	■□□□□ 0.65
CS-223	ENST00000551137	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	19.11	■□□□□ 0.65
CS-223	ENST00000551137	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		19.08	■□□□□ 0.64
CS-223	ENST00000551137	P3H3	Q8IVL6	736 aa		19.07	■□□□□ 0.64
CS-223	ENST00000551137	TSPOAP1	O95153	1857 aa		19.05	■□□□□ 0.64
CS-223	ENST00000551137	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		19.03	■□□□□ 0.64
CS-223	ENST00000551137	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
CS-223	ENST00000551137	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		19.02	■□□□□ 0.64
CS-223	ENST00000551137	ATP10B	O94823	1461 aa		19.02	■□□□□ 0.63
CS-223	ENST00000551137	KDM6B	O15054	1643 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-223	ENST00000551137	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-223	ENST00000551137	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-223	ENST00000551137	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-223	ENST00000551137	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
CS-223	ENST00000551137	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
CS-223	ENST00000551137	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-223	ENST00000551137	KCNH8	Q96L42	1107 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-223	ENST00000551137	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-223	ENST00000551137	CD109	Q6YHK3	1445 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-223	ENST00000551137	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-223	ENST00000551137	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CS-223	ENST00000551137	ARID3C	A6NKF2	412 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CS-223	ENST00000551137	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		18.86	■□□□□ 0.61
CS-223	ENST00000551137	FMN1	Q68DA7	1419 aa		18.86	■□□□□ 0.61
CS-223	ENST00000551137	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
CS-223	ENST00000551137	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		18.83	■□□□□ 0.61
CS-223	ENST00000551137	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		18.83	■□□□□ 0.6
CS-223	ENST00000551137	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
CS-223	ENST00000551137	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
CS-223	ENST00000551137	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		18.83	■□□□□ 0.6
CS-223	ENST00000551137	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		18.8	■□□□□ 0.6
CS-223	ENST00000551137	NEO1	Q92859	1461 aa		18.77	■□□□□ 0.59
CS-223	ENST00000551137	HECW1	Q76N89	1606 aa		18.74	■□□□□ 0.59
CS-223	ENST00000551137	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		18.74	■□□□□ 0.59
CS-223	ENST00000551137	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
CS-223	ENST00000551137	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59	2e-20	■□□□□ 10.1
CS-223	ENST00000551137	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
CS-223	ENST00000551137	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CS-223	ENST00000551137	CLIP1	P30622	1438 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-223	ENST00000551137	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
CS-223	ENST00000551137	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-223	ENST00000551137	PLCH2	O75038	1416 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	FANCA	O15360	1455 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	AKNA	Q7Z591	1439 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	RAPGEF3	O95398	923 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	ADGRL1	O94910	1474 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-223	ENST00000551137	KIF14	Q15058	1648 aa		18.56	■□□□□ 0.56
CS-223	ENST00000551137	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		18.56	■□□□□ 0.56
CS-223	ENST00000551137	RICTOR	Q6R327	1708 aa		18.55	■□□□□ 0.56
CS-223	ENST00000551137	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		18.54	■□□□□ 0.56
CS-223	ENST00000551137	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		18.54	■□□□□ 0.56
CS-223	ENST00000551137	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		18.52	■□□□□ 0.55
CS-223	ENST00000551137	CEP162	Q5TB80	1403 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CS-223	ENST00000551137	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		18.51	■□□□□ 0.55

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