RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.4■■■□□ 2.14
CS-223ENST00000551137 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-223ENST00000551137 ABCC9O60706 1549 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-223ENST00000551137 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-223ENST00000551137 NACADO15069 1562 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-223ENST00000551137 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-223ENST00000551137 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.72■■□□□ 1.39
CS-223ENST00000551137 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CS-223ENST00000551137 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-223ENST00000551137 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-223ENST00000551137 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.322e-8■■■□□ 14.8
CS-223ENST00000551137 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-223ENST00000551137 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-223ENST00000551137 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-223ENST00000551137 SCRIBQ14160 1630 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-223ENST00000551137 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CS-223ENST00000551137 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-223ENST00000551137 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
CS-223ENST00000551137 NCAPD3P42695 1498 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-223ENST00000551137 SMARCA4P51532 1647 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-223ENST00000551137 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-223ENST00000551137 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-223ENST00000551137 SMARCA2P51531 1590 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-223ENST00000551137 HMGXB3Q12766 1538 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-223ENST00000551137 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-223ENST00000551137 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.85■■□□□ 1.09
CS-223ENST00000551137 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CS-223ENST00000551137 WIZO95785 1651 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-223ENST00000551137 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CS-223ENST00000551137 NESP48681 1621 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-223ENST00000551137 ERCC6Q03468 1493 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-223ENST00000551137 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-223ENST00000551137 CUX2O14529 1486 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-223ENST00000551137 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-223ENST00000551137 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.39■■□□□ 1.02
CS-223ENST00000551137 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CS-223ENST00000551137 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CS-223ENST00000551137 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.27■■□□□ 1
CS-223ENST00000551137 CFTRP13569 1480 aa21.25■□□□□ 0.99
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CS-223ENST00000551137 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-223ENST00000551137 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.13■□□□□ 0.97
CS-223ENST00000551137 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.13■□□□□ 0.97
CS-223ENST00000551137 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.13■□□□□ 0.97
CS-223ENST00000551137 WDR62O43379 1518 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-223ENST00000551137 PRDM2Q13029 1718 aa20.99■□□□□ 0.95
CS-223ENST00000551137 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CS-223ENST00000551137 ABCC8Q09428 1581 aa20.81■□□□□ 0.92
CS-223ENST00000551137 TOPBP1Q92547 1522 aa20.78■□□□□ 0.92
CS-223ENST00000551137 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.72■□□□□ 0.91
CS-223ENST00000551137 IFT140Q96RY7 1462 aa20.72■□□□□ 0.91
CS-223ENST00000551137 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
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CS-223ENST00000551137 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CS-223ENST00000551137 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
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CS-223ENST00000551137 CUX1P39880 1505 aa20.52■□□□□ 0.87
CS-223ENST00000551137 SOGA1O94964 1423 aa20.5■□□□□ 0.87
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CS-223ENST00000551137 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-223ENST00000551137 WDR97A6NE52 1622 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-223ENST00000551137 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CS-223ENST00000551137 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-223ENST00000551137 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CS-223ENST00000551137 GRIN2BQ13224 1484 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-223ENST00000551137 TOP2BQ02880 1626 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-223ENST00000551137 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CS-223ENST00000551137 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-223ENST00000551137 CHD1O14646 1710 aa20.27■□□□□ 0.83
CS-223ENST00000551137 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-223ENST00000551137 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-223ENST00000551137 SYNJ1O43426 1573 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-223ENST00000551137 FBLN2P98095 1184 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-223ENST00000551137 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-223ENST00000551137 TRIM41Q8WV44 630 aa20.2■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 SYNJ2O15056 1496 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 ARHGEF11O15085 1522 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 PBRM1Q86U86 1689 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-223ENST00000551137 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-223ENST00000551137 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-223ENST00000551137 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.03■□□□□ 0.8
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CS-223ENST00000551137 ADAMTS12P58397 1594 aa20.03■□□□□ 0.8
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CS-223ENST00000551137 SHROOM2Q13796 1616 aa19.84■□□□□ 0.77
CS-223ENST00000551137 CUL7Q14999 1698 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-223ENST00000551137 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-223ENST00000551137 JPH4Q96JJ6 628 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-223ENST00000551137 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.74■□□□□ 0.75
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