RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550404.1

ANKRD13A-206, Transcript of ankyrin repeat domain 13A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD13A, Length 2,350 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13A-206ENST00000550404 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.54■■■□□ 2.48
ANKRD13A-206ENST00000550404 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD13A-206ENST00000550404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD13A-206ENST00000550404 PRDM2Q13029 1718 aa30.5■■■□□ 2.47
ANKRD13A-206ENST00000550404 IGF1RP08069 1367 aa30.46■■■□□ 2.47
ANKRD13A-206ENST00000550404 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.45■■■□□ 2.47
ANKRD13A-206ENST00000550404 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.45■■■□□ 2.47
ANKRD13A-206ENST00000550404 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.44■■■□□ 2.46
ANKRD13A-206ENST00000550404 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
ANKRD13A-206ENST00000550404 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
ANKRD13A-206ENST00000550404 FKBP8Q14318 412 aa30.36■■■□□ 2.45
ANKRD13A-206ENST00000550404 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.36■■■□□ 2.45
ANKRD13A-206ENST00000550404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.35■■■□□ 2.45
ANKRD13A-206ENST00000550404 CCER2I3L3R5 266 aa30.33■■■□□ 2.45
ANKRD13A-206ENST00000550404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.33■■■□□ 2.45
ANKRD13A-206ENST00000550404 BCANQ96GW7 911 aa30.3■■■□□ 2.44
ANKRD13A-206ENST00000550404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ANKRD13A-206ENST00000550404 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
ANKRD13A-206ENST00000550404 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
ANKRD13A-206ENST00000550404 NEFLP07196 543 aa30.2■■■□□ 2.42
ANKRD13A-206ENST00000550404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.19■■■□□ 2.42
ANKRD13A-206ENST00000550404 ANP32CO43423 234 aa30.17■■■□□ 2.42
ANKRD13A-206ENST00000550404 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.16■■■□□ 2.42
ANKRD13A-206ENST00000550404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.414e-6■■■■■ 31
ANKRD13A-206ENST00000550404 NESP48681 1621 aa30.12■■■□□ 2.41
ANKRD13A-206ENST00000550404 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
ANKRD13A-206ENST00000550404 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.1■■■□□ 2.41
ANKRD13A-206ENST00000550404 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.1■■■□□ 2.41
ANKRD13A-206ENST00000550404 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.09■■■□□ 2.41
ANKRD13A-206ENST00000550404 TRIM52Q96A61 297 aa30.07■■■□□ 2.4
ANKRD13A-206ENST00000550404 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
ANKRD13A-206ENST00000550404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.03■■■□□ 2.4
ANKRD13A-206ENST00000550404 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.01■■■□□ 2.39
ANKRD13A-206ENST00000550404 TONSLQ96HA7 1378 aa30■■■□□ 2.39
ANKRD13A-206ENST00000550404 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30■■■□□ 2.39
ANKRD13A-206ENST00000550404 UACAQ9BZF9 1416 aa29.98■■■□□ 2.39
ANKRD13A-206ENST00000550404 HFM1A2PYH4 1435 aa29.97■■■□□ 2.39
ANKRD13A-206ENST00000550404 P3H3Q8IVL6 736 aa29.97■■■□□ 2.39
ANKRD13A-206ENST00000550404 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.95■■■□□ 2.38
ANKRD13A-206ENST00000550404 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.94■■■□□ 2.38
ANKRD13A-206ENST00000550404 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD13A-206ENST00000550404 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
ANKRD13A-206ENST00000550404 CUL7Q14999 1698 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD13A-206ENST00000550404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD13A-206ENST00000550404 PTPRKQ15262 1439 aa29.89■■■□□ 2.37
ANKRD13A-206ENST00000550404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD13A-206ENST00000550404 FMN1Q68DA7 1419 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD13A-206ENST00000550404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD13A-206ENST00000550404 NAIPQ13075 1403 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD13A-206ENST00000550404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD13A-206ENST00000550404 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.78■■■□□ 2.36
ANKRD13A-206ENST00000550404 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.77■■■□□ 2.36
ANKRD13A-206ENST00000550404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.76■■■□□ 2.36
ANKRD13A-206ENST00000550404 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.76■■■□□ 2.36
ANKRD13A-206ENST00000550404 MSH5O43196 834 aa29.76■■■□□ 2.36
ANKRD13A-206ENST00000550404 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.75■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 SAMD9Q5K651 1589 aa29.73■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 NCOA2Q15596 1464 aa29.73■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.7■■■□□ 2.35
ANKRD13A-206ENST00000550404 TOPBP1Q92547 1522 aa29.7■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 GRIN2BQ13224 1484 aa29.68■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.66■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.66■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 HECW1Q76N89 1606 aa29.65■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.65■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.65■■■□□ 2.34
ANKRD13A-206ENST00000550404 ARHGEF11O15085 1522 aa29.63■■■□□ 2.33
ANKRD13A-206ENST00000550404 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.61■■■□□ 2.33
ANKRD13A-206ENST00000550404 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
ANKRD13A-206ENST00000550404 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ANKRD13A-206ENST00000550404 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.58■■■□□ 2.33
ANKRD13A-206ENST00000550404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.58■■■□□ 2.33
ANKRD13A-206ENST00000550404 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
ANKRD13A-206ENST00000550404 AKNAQ7Z591 1439 aa29.56■■■□□ 2.32
ANKRD13A-206ENST00000550404 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
ANKRD13A-206ENST00000550404 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.53■■■□□ 2.32
ANKRD13A-206ENST00000550404 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
ANKRD13A-206ENST00000550404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ANKRD13A-206ENST00000550404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.49■■■□□ 2.31
ANKRD13A-206ENST00000550404 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.49■■■□□ 2.31
ANKRD13A-206ENST00000550404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.49■■■□□ 2.31
ANKRD13A-206ENST00000550404 NCOA1Q15788 1441 aa29.48■■■□□ 2.31
ANKRD13A-206ENST00000550404 KDM6BO15054 1643 aa29.45■■■□□ 2.31
ANKRD13A-206ENST00000550404 CCDC184Q52MB2 194 aa29.44■■■□□ 2.3
ANKRD13A-206ENST00000550404 CCDC7Q96M83 1385 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD13A-206ENST00000550404 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
ANKRD13A-206ENST00000550404 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD13A-206ENST00000550404 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.41■■■□□ 2.3
ANKRD13A-206ENST00000550404 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
ANKRD13A-206ENST00000550404 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.39■■■□□ 2.29
ANKRD13A-206ENST00000550404 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
ANKRD13A-206ENST00000550404 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.35■■■□□ 2.29
ANKRD13A-206ENST00000550404 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.34■■■□□ 2.29
ANKRD13A-206ENST00000550404 MIA2Q96PC5 1412 aa29.34■■■□□ 2.29
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