RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.89■■□□□ 1.73
CTDSP2-202ENST00000547169 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.89■■□□□ 1.73
CTDSP2-202ENST00000547169 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.89■■□□□ 1.73
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF11O15085 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDSP2-202ENST00000547169 SHROOM2Q13796 1616 aa25.82■■□□□ 1.72
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CTDSP2-202ENST00000547169 KIF21BO75037 1637 aa25.75■■□□□ 1.71
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CTDSP2-202ENST00000547169 IQGAP2Q13576 1575 aa25.72■■□□□ 1.71
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CTDSP2-202ENST00000547169 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.71■■□□□ 1.71
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CTDSP2-202ENST00000547169 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
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CTDSP2-202ENST00000547169 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDSP2-202ENST00000547169 DISP1Q96F81 1524 aa25.57■■□□□ 1.68
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CTDSP2-202ENST00000547169 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CTDSP2-202ENST00000547169 P3H3Q8IVL6 736 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDSP2-202ENST00000547169 SAMD9Q5K651 1589 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDSP2-202ENST00000547169 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-202ENST00000547169 UACAQ9BZF9 1416 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-202ENST00000547169 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
CTDSP2-202ENST00000547169 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.32■■□□□ 1.64
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CTDSP2-202ENST00000547169 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.29■■□□□ 1.64
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CTDSP2-202ENST00000547169 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.24■■□□□ 1.63
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CTDSP2-202ENST00000547169 ABCA8O94911 1581 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDSP2-202ENST00000547169 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDSP2-202ENST00000547169 FMN1Q68DA7 1419 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP2-202ENST00000547169 CEP162Q5TB80 1403 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-202ENST00000547169 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-202ENST00000547169 MAPKBP1O60336 1514 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-202ENST00000547169 ATP10BO94823 1461 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-202ENST00000547169 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-202ENST00000547169 ARID3CA6NKF2 412 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-202ENST00000547169 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-202ENST00000547169 ASXL2Q76L83 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-202ENST00000547169 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25■■□□□ 1.59
CTDSP2-202ENST00000547169 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-202ENST00000547169 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-202ENST00000547169 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-202ENST00000547169 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-202ENST00000547169 HECW1Q76N89 1606 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 DIP2BQ9P265 1576 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 KCNH8Q96L42 1107 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP2-202ENST00000547169 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-202ENST00000547169 GLI2P10070 1586 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-202ENST00000547169 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-202ENST00000547169 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDSP2-202ENST00000547169 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDSP2-202ENST00000547169 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-202ENST00000547169 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-202ENST00000547169 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP2-202ENST00000547169 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CTDSP2-202ENST00000547169 CD109Q6YHK3 1445 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP2-202ENST00000547169 TSPOAP1O95153 1857 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDSP2-202ENST00000547169 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDSP2-202ENST00000547169 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.64■■□□□ 1.54
CTDSP2-202ENST00000547169 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CTDSP2-202ENST00000547169 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.536e-6■■■■□ 21.5
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CTDSP2-202ENST00000547169 KIF14Q15058 1648 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDSP2-202ENST00000547169 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-202ENST00000547169 MAP3K1Q13233 1512 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-202ENST00000547169 TIAM1Q13009 1591 aa24.58■■□□□ 1.52
CTDSP2-202ENST00000547169 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDSP2-202ENST00000547169 APLP2Q06481 763 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDSP2-202ENST00000547169 PLCH2O75038 1416 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDSP2-202ENST00000547169 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDSP2-202ENST00000547169 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDSP2-202ENST00000547169 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CTDSP2-202ENST00000547169 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDSP2-202ENST00000547169 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDSP2-202ENST00000547169 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDSP2-202ENST00000547169 NEO1Q92859 1461 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDSP2-202ENST00000547169 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDSP2-202ENST00000547169 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CTDSP2-202ENST00000547169 KDM6BO15054 1643 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 FANCAO15360 1455 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 AKNAQ7Z591 1439 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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