RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544685.2

SNHG21-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 21, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG21, Length 594 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG21-201ENST00000544685 CEP170Q5SW79 1584 aa23.61■■□□□ 1.37
SNHG21-201ENST00000544685 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.6■■□□□ 1.37
SNHG21-201ENST00000544685 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.58■■□□□ 1.37
SNHG21-201ENST00000544685 KIF21BO75037 1637 aa23.57■■□□□ 1.36
SNHG21-201ENST00000544685 ARAP1Q96P48 1450 aa23.54■■□□□ 1.36
SNHG21-201ENST00000544685 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG21-201ENST00000544685 GOLGA3Q08378 1498 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG21-201ENST00000544685 SHROOM2Q13796 1616 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG21-201ENST00000544685 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.41■■□□□ 1.34
SNHG21-201ENST00000544685 IQGAP2Q13576 1575 aa23.41■■□□□ 1.34
SNHG21-201ENST00000544685 JPH4Q96JJ6 628 aa23.39■■□□□ 1.33
SNHG21-201ENST00000544685 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.33■■□□□ 1.32
SNHG21-201ENST00000544685 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.32■■□□□ 1.32
SNHG21-201ENST00000544685 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SNHG21-201ENST00000544685 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SNHG21-201ENST00000544685 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SNHG21-201ENST00000544685 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.25■■□□□ 1.31
SNHG21-201ENST00000544685 DISP1Q96F81 1524 aa23.23■■□□□ 1.31
SNHG21-201ENST00000544685 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.23■■□□□ 1.31
SNHG21-201ENST00000544685 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
SNHG21-201ENST00000544685 KIAA0556O60303 1618 aa23.19■■□□□ 1.3
SNHG21-201ENST00000544685 SAMD9Q5K651 1589 aa23.17■■□□□ 1.3
SNHG21-201ENST00000544685 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.14■■□□□ 1.3
SNHG21-201ENST00000544685 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.14■■□□□ 1.29
SNHG21-201ENST00000544685 PTPRGP23470 1445 aa23.08■■□□□ 1.28
SNHG21-201ENST00000544685 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.05■■□□□ 1.28
SNHG21-201ENST00000544685 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SNHG21-201ENST00000544685 CLIP1P30622 1438 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG21-201ENST00000544685 P3H3Q8IVL6 736 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG21-201ENST00000544685 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG21-201ENST00000544685 CEP162Q5TB80 1403 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG21-201ENST00000544685 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SNHG21-201ENST00000544685 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG21-201ENST00000544685 UACAQ9BZF9 1416 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG21-201ENST00000544685 ABCA8O94911 1581 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG21-201ENST00000544685 FMN1Q68DA7 1419 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG21-201ENST00000544685 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG21-201ENST00000544685 ABCC2Q92887 1545 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG21-201ENST00000544685 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG21-201ENST00000544685 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
SNHG21-201ENST00000544685 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.85■■□□□ 1.25
SNHG21-201ENST00000544685 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG21-201ENST00000544685 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG21-201ENST00000544685 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SNHG21-201ENST00000544685 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG21-201ENST00000544685 MAPKBP1O60336 1514 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 HECW1Q76N89 1606 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 ATP10BO94823 1461 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.72■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG21-201ENST00000544685 DIP2BQ9P265 1576 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG21-201ENST00000544685 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.69■■□□□ 1.22
SNHG21-201ENST00000544685 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SNHG21-201ENST00000544685 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG21-201ENST00000544685 ASXL2Q76L83 1435 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG21-201ENST00000544685 TSPOAP1O95153 1857 aa22.64■■□□□ 1.22
SNHG21-201ENST00000544685 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.63■■□□□ 1.21
SNHG21-201ENST00000544685 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SNHG21-201ENST00000544685 ARID3CA6NKF2 412 aa22.62■■□□□ 1.21
SNHG21-201ENST00000544685 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SNHG21-201ENST00000544685 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG21-201ENST00000544685 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG21-201ENST00000544685 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG21-201ENST00000544685 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.55■■□□□ 1.2
SNHG21-201ENST00000544685 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SNHG21-201ENST00000544685 MAP3K1Q13233 1512 aa22.52■■□□□ 1.2
SNHG21-201ENST00000544685 GLI2P10070 1586 aa22.51■■□□□ 1.19
SNHG21-201ENST00000544685 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG21-201ENST00000544685 TIAM1Q13009 1591 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG21-201ENST00000544685 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SNHG21-201ENST00000544685 KDM6BO15054 1643 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG21-201ENST00000544685 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.47■■□□□ 1.19
SNHG21-201ENST00000544685 KCNH8Q96L42 1107 aa22.45■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.42■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 APLP2Q06481 763 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.4■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 KIF14Q15058 1648 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG21-201ENST00000544685 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.39■■□□□ 1.17
SNHG21-201ENST00000544685 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
SNHG21-201ENST00000544685 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SNHG21-201ENST00000544685 CD109Q6YHK3 1445 aa22.34■■□□□ 1.17
SNHG21-201ENST00000544685 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.33■■□□□ 1.17
SNHG21-201ENST00000544685 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SNHG21-201ENST00000544685 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.29■■□□□ 1.16
SNHG21-201ENST00000544685 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SNHG21-201ENST00000544685 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG21-201ENST00000544685 PLCH2O75038 1416 aa22.27■■□□□ 1.16
SNHG21-201ENST00000544685 NCOA2Q15596 1464 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG21-201ENST00000544685 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG21-201ENST00000544685 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SNHG21-201ENST00000544685 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG21-201ENST00000544685 PREX2Q70Z35 1606 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG21-201ENST00000544685 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG21-201ENST00000544685 NEO1Q92859 1461 aa22.21■■□□□ 1.15
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